More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0790 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0790  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  100 
 
 
500 aa  996    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0751  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  48.97 
 
 
542 aa  476  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3628  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  52.36 
 
 
487 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2966  NADH dehydrogenase (quinone)  50.95 
 
 
501 aa  448  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.278298 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2288  NADH dehydrogenase (quinone)  50.9 
 
 
488 aa  445  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1601  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  48.88 
 
 
499 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3667  NADH dehydrogenase (quinone)  48.14 
 
 
496 aa  432  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3285  NADH dehydrogenase (quinone)  46.9 
 
 
496 aa  431  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0676667  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0845  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  51.55 
 
 
698 aa  426  1e-118  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1634  NADH dehydrogenase (quinone)  50 
 
 
490 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.181583  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5152  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  51.17 
 
 
651 aa  416  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3954  NADH dehydrogenase (quinone)  46.35 
 
 
497 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  44.73 
 
 
554 aa  409  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2864  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  53.39 
 
 
566 aa  412  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479761  normal  0.594337 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3446  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  50.11 
 
 
669 aa  395  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.181891  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0891  NADH dehydrogenase (quinone)  46.1 
 
 
493 aa  385  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.158004  normal  0.070736 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1398  NADH dehydrogenase (quinone)  43.38 
 
 
498 aa  366  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0677  NADH dehydrogenase (quinone)  45.56 
 
 
496 aa  351  2e-95  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1280  NADH dehydrogenase (quinone)  45.54 
 
 
499 aa  347  2e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2742  NADH dehydrogenase (quinone)  42.92 
 
 
497 aa  347  2e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0328  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase family protein  44.99 
 
 
489 aa  347  3e-94  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2662  NADH dehydrogenase (quinone)  49.74 
 
 
503 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1000  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  45.28 
 
 
507 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.827251 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0812  NADH dehydrogenase (quinone)  43.43 
 
 
503 aa  323  3e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.114491  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0744  NADH dehydrogenase (quinone)  39.92 
 
 
504 aa  317  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01550  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  41.87 
 
 
505 aa  312  9e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_002978  WD0816  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.54 
 
 
498 aa  301  1e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  35.7 
 
 
500 aa  296  6e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0563  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase family protein  41.18 
 
 
475 aa  291  3e-77  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  30.17 
 
 
499 aa  211  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  32.17 
 
 
480 aa  205  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2161  NADH dehydrogenase (quinone)  35.55 
 
 
501 aa  196  6e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  29.94 
 
 
748 aa  195  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1420  NADH dehydrogenase (quinone)  32.37 
 
 
1265 aa  189  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3532  NADH dehydrogenase (quinone)  31.9 
 
 
480 aa  189  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  32.55 
 
 
1264 aa  186  6e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.68 
 
 
501 aa  185  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.37012 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  33.41 
 
 
1265 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  31.5 
 
 
1253 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0218073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0314  hydrogenase 4 subunit D  33.5 
 
 
505 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0167658  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.99 
 
 
492 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.141551  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3666  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.02 
 
 
492 aa  179  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.752681  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1635  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.73 
 
 
502 aa  177  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193581  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0917  NADH dehydrogenase (quinone)  30 
 
 
486 aa  177  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.958268  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1599  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.51 
 
 
762 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85135  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0850  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.44 
 
 
750 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0969  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.59 
 
 
759 aa  172  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00014024  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0852  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.07 
 
 
770 aa  172  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.826241  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3953  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.99 
 
 
492 aa  171  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1880  NADH dehydrogenase (quinone)  30.27 
 
 
1245 aa  171  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374238  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0751  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  33.51 
 
 
768 aa  170  5e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75438  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.96 
 
 
656 aa  170  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1138  NADH dehydrogenase (quinone)  29.95 
 
 
470 aa  169  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0538  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.35 
 
 
801 aa  168  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.26 
 
 
790 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1865  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.72 
 
 
758 aa  167  5e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.13806  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0877  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.57 
 
 
648 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000848716  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.33 
 
 
952 aa  165  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0475  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.8 
 
 
622 aa  164  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.230809 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3531  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.13 
 
 
971 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.48 
 
 
943 aa  163  8.000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  27.98 
 
 
620 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1136  NADH dehydrogenase (quinone)  29.15 
 
 
476 aa  162  1e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.82 
 
 
642 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4573  hydrogenase 4 subunit D  34.09 
 
 
479 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2855  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.58 
 
 
769 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0985  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.23 
 
 
624 aa  160  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0660  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  29 
 
 
687 aa  160  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.37 
 
 
642 aa  159  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3743  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.79 
 
 
651 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1538  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.04 
 
 
953 aa  159  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5417  NADH dehydrogenase subunit L  27.06 
 
 
620 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3805  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.87 
 
 
969 aa  158  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.761799 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1606  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.48 
 
 
610 aa  158  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.483904  normal  0.915409 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00960  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  33.33 
 
 
484 aa  159  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.39 
 
 
959 aa  158  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5142  NADH dehydrogenase subunit L  27.01 
 
 
620 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0293  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  30.18 
 
 
669 aa  158  3e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5534  NADH dehydrogenase subunit L  27.01 
 
 
604 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2400  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  32.04 
 
 
669 aa  157  5.0000000000000005e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26701  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  30.11 
 
 
670 aa  157  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  33.24 
 
 
672 aa  157  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5153  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.7 
 
 
548 aa  156  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.939463  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0828  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.37 
 
 
658 aa  156  8e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5468  NADH dehydrogenase subunit L  27.06 
 
 
620 aa  156  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.15 
 
 
634 aa  156  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1768  NADH dehydrogenase (quinone)  31.93 
 
 
792 aa  156  9e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  33.33 
 
 
672 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  33.33 
 
 
672 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5269  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.07 
 
 
967 aa  156  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1937  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.36 
 
 
637 aa  156  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34876  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5383  NADH dehydrogenase subunit L  27.23 
 
 
620 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.0362e-16 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3898  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.53 
 
 
639 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3811  NADH dehydrogenase subunit L  26 
 
 
620 aa  155  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0180  hydrogenase 4 subunit D  31.6 
 
 
457 aa  155  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  33.06 
 
 
672 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4992  NADH dehydrogenase subunit L  26.76 
 
 
620 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4974  NADH dehydrogenase subunit L  26.76 
 
 
620 aa  154  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3950  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.31 
 
 
956 aa  154  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0588976 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0497  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.83 
 
 
931 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.999924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>