More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00960 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_00960  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  100 
 
 
484 aa  961    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4573  hydrogenase 4 subunit D  57.98 
 
 
479 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1283  hydrogenase 4 subunit D  54.13 
 
 
479 aa  511  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0280034  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2710  hydrogenase 4 subunit D  54.66 
 
 
479 aa  494  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1185  NADH dehydrogenase (quinone)  52.63 
 
 
479 aa  489  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2631  hydrogenase 4 subunit D  52.63 
 
 
479 aa  490  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.960654  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3706  hydrogenase 4 subunit D  52.21 
 
 
479 aa  486  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.897531  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02376  hydrogenase 4 membrane subunit  54.05 
 
 
449 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1192  hydrogenase 4 subunit D  54.05 
 
 
450 aa  473  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2187  hydrogenase 4 subunit D  50.63 
 
 
480 aa  463  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.562518 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0180  hydrogenase 4 subunit D  43.45 
 
 
457 aa  318  1e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210029  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0314  hydrogenase 4 subunit D  41.38 
 
 
505 aa  289  6e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0167658  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  35.58 
 
 
654 aa  199  7.999999999999999e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_802  NADH:quinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)  38.95 
 
 
654 aa  197  3e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.32 
 
 
656 aa  196  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.47 
 
 
654 aa  196  7e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.57 
 
 
645 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.062647  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3531  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.4 
 
 
971 aa  189  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0538  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.24 
 
 
801 aa  189  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.58 
 
 
952 aa  189  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0560  NADH dehydrogenase (quinone)  32.51 
 
 
801 aa  189  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.640167  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3128  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.9 
 
 
975 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0676  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35 
 
 
958 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.685359  normal  0.485202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0148  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.56 
 
 
961 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525301  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.5 
 
 
790 aa  186  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1138  NADH dehydrogenase (quinone)  33 
 
 
470 aa  186  9e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.15 
 
 
969 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1605  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.94 
 
 
983 aa  186  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0030  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.47 
 
 
973 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0435  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.72 
 
 
970 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.305696  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.88 
 
 
642 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0500  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.72 
 
 
972 aa  184  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438717  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  34.59 
 
 
620 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0952  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.88 
 
 
801 aa  184  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4492  NADH dehydrogenase subunit L  35.13 
 
 
638 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.655452  normal  0.47705 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3695  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.58 
 
 
782 aa  184  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.983526 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0971  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.88 
 
 
801 aa  184  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  35.36 
 
 
636 aa  184  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  33.62 
 
 
480 aa  184  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0132  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.36 
 
 
788 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1100  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.5 
 
 
953 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0546017  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2654  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.71 
 
 
980 aa  182  9.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1768  NADH dehydrogenase (quinone)  35.2 
 
 
792 aa  182  9.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3898  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.85 
 
 
639 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1010  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.12 
 
 
978 aa  182  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246067  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0660  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.71 
 
 
800 aa  182  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0122576  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.2 
 
 
958 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3805  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.83 
 
 
969 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.761799 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0645  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.71 
 
 
800 aa  182  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5269  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.78 
 
 
967 aa  182  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1076  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.28 
 
 
553 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.031536  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.55 
 
 
992 aa  180  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431128  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5090  NADH dehydrogenase subunit L  34.59 
 
 
620 aa  179  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.42 
 
 
628 aa  179  8e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3532  NADH dehydrogenase (quinone)  32.07 
 
 
480 aa  179  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1538  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.8 
 
 
953 aa  179  9e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3471  monovalent cation:proton antiporter, putative  36.78 
 
 
972 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.665295  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0985  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.48 
 
 
624 aa  179  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3252  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.52 
 
 
972 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295044  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.82 
 
 
634 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5417  NADH dehydrogenase subunit L  34.59 
 
 
620 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1386  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.4 
 
 
984 aa  177  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0924669  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1853  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.26 
 
 
971 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.126065 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1524  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.14 
 
 
981 aa  177  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2870  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.33 
 
 
622 aa  177  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0441123 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1606  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.43 
 
 
610 aa  177  4e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.483904  normal  0.915409 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.94 
 
 
959 aa  177  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5468  NADH dehydrogenase subunit L  34.59 
 
 
620 aa  177  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2806  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.03 
 
 
997 aa  177  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0639  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.26 
 
 
639 aa  176  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1634  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.26 
 
 
639 aa  176  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3182  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.26 
 
 
639 aa  176  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0441  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.41 
 
 
676 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.592794  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5413  NADH dehydrogenase subunit L  35.16 
 
 
620 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.38 
 
 
642 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0870  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.55 
 
 
775 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.867337 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0074  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.82 
 
 
765 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2474  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.9 
 
 
984 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.585409  normal  0.405301 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4156  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.29 
 
 
676 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0322847 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0400  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.39 
 
 
768 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000418  Na(+) H(+) antiporter subunit A/Na(+) H(+) antiporter subunit B  36.31 
 
 
889 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4974  NADH dehydrogenase subunit L  34.84 
 
 
620 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.74 
 
 
710 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.18 
 
 
676 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2874  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.3 
 
 
799 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1775  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.39 
 
 
768 aa  174  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.671135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4992  NADH dehydrogenase subunit L  34.59 
 
 
620 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1591  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.07 
 
 
1024 aa  173  6.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156246  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3443  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.15 
 
 
971 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.274222 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2652  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  40.07 
 
 
949 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5142  NADH dehydrogenase subunit L  34.34 
 
 
620 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5383  NADH dehydrogenase subunit L  34.59 
 
 
620 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.0362e-16 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0992  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  40.07 
 
 
949 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5534  NADH dehydrogenase subunit L  34.34 
 
 
604 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3510  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.29 
 
 
971 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00329797 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0413  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.35 
 
 
676 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.07 
 
 
630 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0697  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.49 
 
 
946 aa  172  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.156614  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3310  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.92 
 
 
966 aa  172  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90946  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4054  NADH dehydrogenase subunit L  32.85 
 
 
652 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.431336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>