More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2662 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1000  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  74.55 
 
 
507 aa  706    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.827251 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2662  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
503 aa  982    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1280  NADH dehydrogenase (quinone)  64.59 
 
 
499 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1398  NADH dehydrogenase (quinone)  63.45 
 
 
498 aa  586  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2742  NADH dehydrogenase (quinone)  62.45 
 
 
497 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0744  NADH dehydrogenase (quinone)  62.45 
 
 
504 aa  537  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0812  NADH dehydrogenase (quinone)  61.2 
 
 
503 aa  508  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.114491  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01550  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  56.31 
 
 
505 aa  496  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  48.08 
 
 
554 aa  353  5e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0845  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.37 
 
 
698 aa  349  8e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2288  NADH dehydrogenase (quinone)  46.11 
 
 
488 aa  333  5e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0790  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  46.19 
 
 
500 aa  332  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2966  NADH dehydrogenase (quinone)  47.57 
 
 
501 aa  331  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.278298 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2864  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.64 
 
 
566 aa  319  7e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479761  normal  0.594337 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5152  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  45.75 
 
 
651 aa  314  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3628  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.13 
 
 
487 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1601  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  41.13 
 
 
499 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3285  NADH dehydrogenase (quinone)  46.15 
 
 
496 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0676667  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3954  NADH dehydrogenase (quinone)  43.83 
 
 
497 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3446  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  46.78 
 
 
669 aa  301  2e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.181891  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3667  NADH dehydrogenase (quinone)  43.85 
 
 
496 aa  294  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0891  NADH dehydrogenase (quinone)  43.27 
 
 
493 aa  292  8e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.158004  normal  0.070736 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0751  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.34 
 
 
542 aa  283  5.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  38.02 
 
 
500 aa  283  7.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1634  NADH dehydrogenase (quinone)  46.7 
 
 
490 aa  279  7e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.181583  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0677  NADH dehydrogenase (quinone)  37.28 
 
 
496 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0328  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase family protein  37.66 
 
 
489 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0563  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase family protein  40.49 
 
 
475 aa  231  3e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0816  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.42 
 
 
498 aa  224  2e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  30.02 
 
 
748 aa  190  5.999999999999999e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  31.76 
 
 
499 aa  188  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0917  NADH dehydrogenase (quinone)  29.74 
 
 
486 aa  176  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.958268  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  33.57 
 
 
1264 aa  176  8e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2161  NADH dehydrogenase (quinone)  35.14 
 
 
501 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  35.29 
 
 
1253 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0218073 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  29.46 
 
 
480 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0314  hydrogenase 4 subunit D  34.56 
 
 
505 aa  173  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0167658  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  32.56 
 
 
1265 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1420  NADH dehydrogenase (quinone)  32.23 
 
 
1265 aa  169  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3532  NADH dehydrogenase (quinone)  31.03 
 
 
480 aa  168  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.01 
 
 
513 aa  160  4e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  35.76 
 
 
672 aa  160  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  36.34 
 
 
672 aa  160  6e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  36.05 
 
 
672 aa  159  8e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  36.05 
 
 
672 aa  159  9e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  36.05 
 
 
672 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  36.05 
 
 
672 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  34.57 
 
 
673 aa  159  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1880  NADH dehydrogenase (quinone)  34.89 
 
 
1245 aa  157  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374238  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0284  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  32.27 
 
 
517 aa  156  7e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000106102 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0918  NADH dehydrogenase (quinone)  29.03 
 
 
559 aa  155  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1138  NADH dehydrogenase (quinone)  32.49 
 
 
470 aa  154  2e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  34.12 
 
 
671 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1538  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.46 
 
 
953 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1591  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.29 
 
 
1024 aa  154  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156246  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4573  hydrogenase 4 subunit D  34 
 
 
479 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.06 
 
 
501 aa  153  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.37012 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1100  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.57 
 
 
953 aa  149  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0546017  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1136  NADH dehydrogenase (quinone)  29.9 
 
 
476 aa  149  1.0000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0588  NADH dehydrogenase (quinone)  27.72 
 
 
609 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1605  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.74 
 
 
983 aa  147  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2709  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.28 
 
 
786 aa  147  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1283  hydrogenase 4 subunit D  32.9 
 
 
479 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0280034  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.89 
 
 
952 aa  146  7.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3179  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.78 
 
 
625 aa  146  9e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3530  NADH dehydrogenase (quinone)  28.22 
 
 
470 aa  146  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1386  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.25 
 
 
984 aa  146  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0924669  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0560  NADH dehydrogenase (quinone)  30.86 
 
 
801 aa  145  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.640167  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.81 
 
 
966 aa  145  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.041044 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  29.12 
 
 
662 aa  145  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0232  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.33 
 
 
949 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  0.778843 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.25 
 
 
492 aa  144  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.141551  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.11 
 
 
943 aa  144  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0992  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.45 
 
 
949 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0391  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.89 
 
 
649 aa  144  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1058  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.81 
 
 
652 aa  144  4e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2652  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.71 
 
 
949 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2474  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.79 
 
 
984 aa  143  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.585409  normal  0.405301 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4547  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.26 
 
 
631 aa  143  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3805  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.26 
 
 
969 aa  143  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.761799 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.32 
 
 
959 aa  143  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3774  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.42 
 
 
477 aa  143  7e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0888165  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3666  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.72 
 
 
492 aa  143  8e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.752681  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.97 
 
 
969 aa  142  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3531  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.17 
 
 
971 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0890  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.17 
 
 
507 aa  141  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50733  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13177  NADH dehydrogenase subunit L  32.13 
 
 
633 aa  141  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3695  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.01 
 
 
782 aa  140  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.983526 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4452  NADH dehydrogenase subunit L  29.58 
 
 
651 aa  140  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.221921 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5081  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.52 
 
 
979 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.99 
 
 
642 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.46 
 
 
992 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431128  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0480  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.56 
 
 
639 aa  139  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0943  NADH dehydrogenase (quinone)  30 
 
 
723 aa  139  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.730208  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4616  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.52 
 
 
979 aa  139  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.641343  decreased coverage  0.000524948 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2096  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.34 
 
 
726 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4834  NADH dehydrogenase (quinone)  31.28 
 
 
585 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4380  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.02 
 
 
698 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  27.38 
 
 
473 aa  138  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0697  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.14 
 
 
946 aa  139  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.156614  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>