More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2966 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2966  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
501 aa  988    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.278298 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3285  NADH dehydrogenase (quinone)  57.35 
 
 
496 aa  544  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0676667  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3954  NADH dehydrogenase (quinone)  56.36 
 
 
497 aa  525  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3667  NADH dehydrogenase (quinone)  57.98 
 
 
496 aa  527  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0891  NADH dehydrogenase (quinone)  57.54 
 
 
493 aa  504  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.158004  normal  0.070736 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2288  NADH dehydrogenase (quinone)  52.47 
 
 
488 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1634  NADH dehydrogenase (quinone)  53.72 
 
 
490 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.181583  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0790  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  50.95 
 
 
500 aa  431  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1601  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  49.38 
 
 
499 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0751  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  44.67 
 
 
542 aa  395  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3628  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  50.33 
 
 
487 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  47.5 
 
 
554 aa  353  4e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0845  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.17 
 
 
698 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1000  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  45.56 
 
 
507 aa  329  7e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.827251 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0677  NADH dehydrogenase (quinone)  43.29 
 
 
496 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1280  NADH dehydrogenase (quinone)  46.35 
 
 
499 aa  324  2e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2662  NADH dehydrogenase (quinone)  47.22 
 
 
503 aa  324  3e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2864  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  47.06 
 
 
566 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479761  normal  0.594337 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2742  NADH dehydrogenase (quinone)  46.23 
 
 
497 aa  317  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0328  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase family protein  38.59 
 
 
489 aa  315  9.999999999999999e-85  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1398  NADH dehydrogenase (quinone)  44.44 
 
 
498 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5152  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  42.01 
 
 
651 aa  308  2.0000000000000002e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3446  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  41.48 
 
 
669 aa  300  3e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.181891  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01550  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  43.3 
 
 
505 aa  288  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0812  NADH dehydrogenase (quinone)  39.08 
 
 
503 aa  286  5e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.114491  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0816  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.25 
 
 
498 aa  286  7e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0744  NADH dehydrogenase (quinone)  43.44 
 
 
504 aa  278  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0563  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase family protein  39.9 
 
 
475 aa  271  2e-71  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  34.35 
 
 
500 aa  265  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  35.97 
 
 
1265 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1538  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.2 
 
 
953 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3532  NADH dehydrogenase (quinone)  32.25 
 
 
480 aa  181  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2161  NADH dehydrogenase (quinone)  32.77 
 
 
501 aa  180  7e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1138  NADH dehydrogenase (quinone)  32.29 
 
 
470 aa  179  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.98 
 
 
952 aa  179  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  31.15 
 
 
480 aa  179  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1606  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.51 
 
 
610 aa  178  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.483904  normal  0.915409 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  31.09 
 
 
748 aa  176  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1100  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.62 
 
 
953 aa  176  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0546017  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  29.01 
 
 
499 aa  176  9e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  31.74 
 
 
1264 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3805  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.19 
 
 
969 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.761799 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.29 
 
 
656 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0697  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.61 
 
 
946 aa  172  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.156614  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0314  hydrogenase 4 subunit D  33.16 
 
 
505 aa  172  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0167658  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0232  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.94 
 
 
949 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  0.778843 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2652  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.87 
 
 
949 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3774  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.78 
 
 
477 aa  168  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0888165  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0560  NADH dehydrogenase (quinone)  33.97 
 
 
801 aa  168  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.640167  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0992  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.64 
 
 
949 aa  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.47 
 
 
501 aa  166  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.37012 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1420  NADH dehydrogenase (quinone)  31.1 
 
 
1265 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  29.83 
 
 
1253 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0218073 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0148  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.35 
 
 
961 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525301  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1768  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
792 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3531  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.91 
 
 
971 aa  161  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0588  NADH dehydrogenase (quinone)  30.46 
 
 
609 aa  161  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1136  NADH dehydrogenase (quinone)  29.36 
 
 
476 aa  160  4e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0917  NADH dehydrogenase (quinone)  30.61 
 
 
486 aa  160  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.958268  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0475  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.93 
 
 
622 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.230809 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1635  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.25 
 
 
502 aa  159  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193581  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2102  NADH dehydrogenase (quinone)  34.36 
 
 
793 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4573  hydrogenase 4 subunit D  32.3 
 
 
479 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0180  hydrogenase 4 subunit D  31.42 
 
 
457 aa  158  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210029  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2090  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.68 
 
 
770 aa  157  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2709  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.91 
 
 
786 aa  157  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5269  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.66 
 
 
967 aa  156  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.85 
 
 
654 aa  156  8e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4834  NADH dehydrogenase (quinone)  31.73 
 
 
585 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  31.53 
 
 
654 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4616  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.11 
 
 
979 aa  154  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.641343  decreased coverage  0.000524948 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0483  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.85 
 
 
798 aa  154  5e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.514379 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3666  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.61 
 
 
492 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.752681  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5081  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.11 
 
 
979 aa  153  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0676  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.55 
 
 
958 aa  153  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.685359  normal  0.485202 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0874  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.32 
 
 
786 aa  153  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755571  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.41 
 
 
642 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3695  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.05 
 
 
782 aa  152  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.983526 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.61 
 
 
958 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.54 
 
 
642 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_802  NADH:quinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)  31.53 
 
 
654 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0500  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.56 
 
 
972 aa  152  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438717  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0497  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.81 
 
 
931 aa  151  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.999924 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0435  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.56 
 
 
970 aa  151  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.305696  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.02 
 
 
790 aa  151  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1591  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.21 
 
 
1024 aa  151  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156246  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1010  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.12 
 
 
978 aa  151  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246067  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0969  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.23 
 
 
759 aa  151  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00014024  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3953  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.61 
 
 
492 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.78 
 
 
943 aa  150  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0985  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.71 
 
 
624 aa  150  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0903  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.28 
 
 
932 aa  150  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0217477  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000418  Na(+) H(+) antiporter subunit A/Na(+) H(+) antiporter subunit B  32.73 
 
 
889 aa  150  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2654  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.78 
 
 
980 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2806  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.27 
 
 
997 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1865  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32 
 
 
758 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.13806  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0132  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.02 
 
 
788 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3218  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.99 
 
 
767 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3530  NADH dehydrogenase (quinone)  30.26 
 
 
470 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.08 
 
 
959 aa  148  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>