More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0969 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1420  NADH dehydrogenase (quinone)  43 
 
 		 1265 aa  902    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1880  NADH dehydrogenase (quinone)  50.04 
 
 		 1245 aa  986    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374238  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  43.55 
 
 		 1265 aa  894    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 1253 aa  2457    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0218073 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  61.37 
 
 		 1264 aa  1379    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  34.47 
 
 		 500 aa  232  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2210  NADH dehydrogenase (quinone)  26.7 
 
 		 1047 aa  223  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129844 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1280  NADH dehydrogenase (quinone)  34.41 
 
 		 499 aa  206  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  34.35 
 
 		 669 aa  201  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0315  NADH dehydrogenase (quinone)  36.4 
 
 		 674 aa  199  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39787  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1398  NADH dehydrogenase (quinone)  33.99 
 
 		 498 aa  199  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  32.87 
 
 		 672 aa  196  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  32.38 
 
 		 672 aa  196  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  32.87 
 
 		 672 aa  196  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  32.38 
 
 		 672 aa  196  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  31.45 
 
 		 748 aa  195  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  33.1 
 
 		 672 aa  195  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  34.08 
 
 		 671 aa  194  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0892  NADH dehydrogenase (quinone)  35.15 
 
 		 669 aa  193  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  31.94 
 
 		 672 aa  193  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1634  NADH dehydrogenase (quinone)  34.66 
 
 		 490 aa  190  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.181583  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1601  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.16 
 
 		 499 aa  190  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2742  NADH dehydrogenase (quinone)  32.91 
 
 		 497 aa  190  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.18 
 
 		 661 aa  188  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  36.1 
 
 		 683 aa  187  7e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0379  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.67 
 
 		 605 aa  187  1.0000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000619684  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0588  NADH dehydrogenase (quinone)  33.67 
 
 		 609 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  33.09 
 
 		 673 aa  185  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  30.54 
 
 		 499 aa  185  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1321  hydrogenase membrane subunit  32.61 
 
 		 644 aa  185  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01550  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  34.44 
 
 		 505 aa  185  6e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0929  hydrogenase 4 subunit B  30.89 
 
 		 687 aa  184  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1142  hydrogenase 4 subunit B  38.15 
 
 		 748 aa  182  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.239539  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3292  hydrogenase 4 subunit B  33.33 
 
 		 674 aa  182  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0955  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.94 
 
 		 523 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00424687  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.64 
 
 		 943 aa  182  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0375  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.48 
 
 		 669 aa  182  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.044448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0380  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.55 
 
 		 472 aa  182  4.999999999999999e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000595488  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0314  hydrogenase 4 subunit D  32.94 
 
 		 505 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0167658  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2662  NADH dehydrogenase (quinone)  35.08 
 
 		 503 aa  181  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  34.1 
 
 		 673 aa  180  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0917  NADH dehydrogenase (quinone)  31.5 
 
 		 486 aa  179  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.958268  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.9 
 
 		 790 aa  179  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  30.21 
 
 		 480 aa  180  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0320  NADH dehydrogenase (quinone)  33.81 
 
 		 531 aa  179  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.63 
 
 		 522 aa  178  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04209  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.85 
 
 		 938 aa  177  8e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1575  hydrogenase membrane subunit  33.43 
 
 		 617 aa  177  9e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0890  NADH dehydrogenase subunit M  30.09 
 
 		 613 aa  177  9e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.514114  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3530  NADH dehydrogenase (quinone)  33.24 
 
 		 470 aa  177  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1136  NADH dehydrogenase (quinone)  30.62 
 
 		 476 aa  177  9.999999999999999e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3628  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.29 
 
 		 487 aa  177  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0744  NADH dehydrogenase (quinone)  32.8 
 
 		 504 aa  177  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  35.6 
 
 		 662 aa  177  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0671  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.13 
 
 		 525 aa  177  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  33.09 
 
 		 620 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2708  hydrogenase 4 subunit B  33.26 
 
 		 679 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0751  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.54 
 
 		 542 aa  176  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4571  hydrogenase 4 subunit F  31.26 
 
 		 512 aa  176  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0790  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.23 
 
 		 500 aa  176  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5534  NADH dehydrogenase subunit L  33.33 
 
 		 604 aa  175  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5383  NADH dehydrogenase subunit L  33.57 
 
 		 620 aa  175  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.0362e-16 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2161  NADH dehydrogenase (quinone)  32.61 
 
 		 501 aa  175  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  31.96 
 
 		 672 aa  174  6.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5142  NADH dehydrogenase subunit L  33.33 
 
 		 620 aa  174  9e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1741  NADH dehydrogenase subunit M  28.78 
 
 		 604 aa  174  9e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.56797  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  31.52 
 
 		 644 aa  174  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4974  NADH dehydrogenase subunit L  33.57 
 
 		 620 aa  174  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1000  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.43 
 
 		 507 aa  174  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.827251 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1822  hydrogenase membrane subunit  32.18 
 
 		 643 aa  174  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0165692  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4992  NADH dehydrogenase subunit L  33.33 
 
 		 620 aa  173  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  31.4 
 
 		 649 aa  173  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0845  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.9 
 
 		 698 aa  173  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  29.93 
 
 		 473 aa  173  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3795  NADH dehydrogenase (quinone)  37.82 
 
 		 666 aa  172  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  33.8 
 
 		 737 aa  172  3e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2966  NADH dehydrogenase (quinone)  30.95 
 
 		 501 aa  172  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.278298 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.86 
 
 		 501 aa  172  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37012 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0070  NADH dehydrogenase (quinone)  34.87 
 
 		 667 aa  172  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0943  NADH dehydrogenase (quinone)  33.77 
 
 		 723 aa  172  5e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.730208  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1217  NADH dehydrogenase subunit M  28.43 
 
 		 614 aa  172  5e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  31.86 
 
 		 674 aa  171  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3532  NADH dehydrogenase (quinone)  30.63 
 
 		 480 aa  171  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3654  NADH dehydrogenase (quinone)  37.36 
 
 		 665 aa  171  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0329  hydrogenase 4 subunit B  32.58 
 
 		 669 aa  171  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3193  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.4 
 
 		 659 aa  171  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.141056  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3712  NADH dehydrogenase (quinone)  36.69 
 
 		 666 aa  171  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.753561  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3401  F420H2 dehydrogenase subunit N  31.36 
 
 		 481 aa  170  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1069  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.02 
 
 		 659 aa  171  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7000400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3667  NADH dehydrogenase (quinone)  31.49 
 
 		 496 aa  170  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5417  NADH dehydrogenase subunit L  33.09 
 
 		 620 aa  170  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.74 
 
 		 492 aa  170  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.141551  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0890  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.5 
 
 		 507 aa  170  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50733  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1688  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.34 
 
 		 495 aa  170  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.565022  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5468  NADH dehydrogenase subunit L  33.09 
 
 		 620 aa  169  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  32.18 
 
 		 662 aa  169  4e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0179  hydrogenase 4 subunit B  33.41 
 
 		 669 aa  168  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.987712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6065  hydrogenase 4 subunit B  31.92 
 
 		 669 aa  168  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388772  hitchhiker  0.000500664 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2288  NADH dehydrogenase (quinone)  30.53 
 
 		 488 aa  168  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0985  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.9 
 
 		 624 aa  167  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>