More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0379 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0379  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  100 
 
 
605 aa  1182    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000619684  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1217  NADH dehydrogenase subunit M  33.33 
 
 
614 aa  271  2e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1741  NADH dehydrogenase subunit M  33.68 
 
 
604 aa  252  1e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.56797  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0890  NADH dehydrogenase subunit M  30.34 
 
 
613 aa  237  6e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.514114  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2210  NADH dehydrogenase (quinone)  33.91 
 
 
1047 aa  233  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.129844 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1606  NADH dehydrogenase subunit M  34.43 
 
 
626 aa  232  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1420  NADH dehydrogenase (quinone)  36.95 
 
 
1265 aa  190  7e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  34.15 
 
 
500 aa  188  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  31.81 
 
 
1264 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1880  NADH dehydrogenase (quinone)  35.51 
 
 
1245 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374238  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3666  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.88 
 
 
492 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.752681  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.17 
 
 
492 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.141551  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.84 
 
 
501 aa  182  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.37012 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1136  NADH dehydrogenase (quinone)  31.64 
 
 
476 aa  182  1e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3953  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.99 
 
 
492 aa  182  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  33.51 
 
 
1265 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0955  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32 
 
 
523 aa  181  4e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00424687  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.87 
 
 
522 aa  180  7e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0753  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36.18 
 
 
592 aa  177  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  32.67 
 
 
1253 aa  177  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0218073 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2161  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
501 aa  171  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0671  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.44 
 
 
525 aa  170  8e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  32.8 
 
 
473 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0890  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.37 
 
 
507 aa  167  6.9999999999999995e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50733  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3626  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.55 
 
 
586 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0788  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.89 
 
 
588 aa  163  9e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  29.14 
 
 
673 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0132  hydrogenase 4 membrane subunit  31.71 
 
 
650 aa  162  1e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.167866  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1142  hydrogenase 4 subunit B  28.6 
 
 
748 aa  162  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.239539  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  27.13 
 
 
672 aa  162  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.22 
 
 
513 aa  162  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2806  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.75 
 
 
997 aa  161  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  29.65 
 
 
748 aa  160  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  31.63 
 
 
499 aa  157  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4834  NADH dehydrogenase (quinone)  28.54 
 
 
585 aa  153  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2742  NADH dehydrogenase (quinone)  33.89 
 
 
497 aa  153  8e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  32.2 
 
 
644 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0937  hydrogenase subunit F  28.86 
 
 
482 aa  153  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1781  hydrogenase subunit F  29.28 
 
 
482 aa  151  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2787  NADH dehydrogenase (quinone)  28.05 
 
 
633 aa  150  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2795  NADH dehydrogenase (quinone)  28.05 
 
 
633 aa  150  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0892  NADH dehydrogenase (quinone)  32.99 
 
 
669 aa  150  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0179  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.69 
 
 
491 aa  150  5e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.490475  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0284  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  31.22 
 
 
517 aa  150  6e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000106102 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2964  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.41 
 
 
564 aa  150  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0589522 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0929  hydrogenase 4 subunit B  28.55 
 
 
687 aa  150  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  30.43 
 
 
649 aa  150  8e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0875  hydrogenase subunit F  29.03 
 
 
482 aa  150  8e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00115046 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1042  hydrogenase subunit F  28.24 
 
 
482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0121  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.71 
 
 
491 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3401  F420H2 dehydrogenase subunit N  32.55 
 
 
481 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280357  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3530  NADH dehydrogenase (quinone)  32.1 
 
 
470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2864  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.79 
 
 
566 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479761  normal  0.594337 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.16 
 
 
952 aa  149  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0917  NADH dehydrogenase (quinone)  30.63 
 
 
486 aa  148  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.958268  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1603  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.36 
 
 
594 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3287  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.23 
 
 
566 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0353953  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1914  L-alanyl-D-glutamate peptidase  28.76 
 
 
655 aa  147  5e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3669  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.23 
 
 
566 aa  147  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0286  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit N  32.75 
 
 
494 aa  147  6e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000250262 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  28.25 
 
 
671 aa  147  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0751  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.89 
 
 
542 aa  147  7.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1635  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.17 
 
 
502 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193581  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0588  NADH dehydrogenase (quinone)  30.06 
 
 
609 aa  146  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  26.58 
 
 
683 aa  146  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1321  hydrogenase membrane subunit  32.61 
 
 
644 aa  146  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3956  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.5 
 
 
566 aa  146  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2558  NADH dehydrogenase (quinone)  31.74 
 
 
666 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3531  NADH dehydrogenase (quinone)  27.2 
 
 
610 aa  144  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2158  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.31 
 
 
589 aa  144  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.812368  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1353  hydrogenase subunit F  28.6 
 
 
481 aa  144  5e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.178859  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3197  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.91 
 
 
666 aa  144  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3805  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.58 
 
 
969 aa  144  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.761799 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1791  ATP-binding protein  27.84 
 
 
655 aa  143  8e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0608774  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2223  NADH dehydrogenase (quinone)  35.38 
 
 
496 aa  143  9e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.33 
 
 
959 aa  143  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  32.57 
 
 
673 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3855  hydrogenase 4 subunit B  32.03 
 
 
672 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0893  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.9 
 
 
575 aa  142  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330722  normal  0.0780403 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2863  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.98 
 
 
498 aa  142  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.845476  normal  0.745609 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3628  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.09 
 
 
487 aa  141  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  34.03 
 
 
672 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1065  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31 
 
 
666 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.82932e-25 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30 
 
 
656 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2290  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.68 
 
 
569 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1599  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.39 
 
 
762 aa  140  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85135  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  29.43 
 
 
620 aa  140  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  33.68 
 
 
672 aa  140  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  33.68 
 
 
672 aa  140  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  33.68 
 
 
672 aa  140  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  32.29 
 
 
672 aa  140  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1538  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.68 
 
 
953 aa  140  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_002978  WD1107  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.56 
 
 
488 aa  140  8.999999999999999e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.980044  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5413  NADH dehydrogenase subunit L  29.69 
 
 
620 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.15 
 
 
628 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0030  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.09 
 
 
973 aa  139  1e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  26.08 
 
 
662 aa  139  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0790  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.68 
 
 
500 aa  139  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0070  NADH dehydrogenase (quinone)  34.32 
 
 
667 aa  139  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1100  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.86 
 
 
953 aa  139  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0546017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>