More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0788 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0788  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  100 
 
 
588 aa  1178    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3626  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  49.01 
 
 
586 aa  504  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0753  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.77 
 
 
592 aa  438  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2158  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.97 
 
 
589 aa  420  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.812368  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2290  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  43.42 
 
 
569 aa  413  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3287  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.51 
 
 
566 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0353953  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3956  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.01 
 
 
566 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3669  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.42 
 
 
566 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1632  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  44.22 
 
 
565 aa  385  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1603  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.07 
 
 
594 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2964  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  43.29 
 
 
564 aa  365  1e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0589522 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0893  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.46 
 
 
575 aa  349  8e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330722  normal  0.0780403 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0846  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.89 
 
 
595 aa  243  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3445  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.07 
 
 
612 aa  230  5e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464182  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2865  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  42.35 
 
 
588 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.643493  normal  0.225438 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5151  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.88 
 
 
618 aa  219  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0571898  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0474  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.37 
 
 
529 aa  172  2e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0552  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.17 
 
 
531 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.667644  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0379  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.89 
 
 
605 aa  163  7e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000619684  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0937  hydrogenase subunit F  29.34 
 
 
482 aa  159  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1042  hydrogenase subunit F  29.31 
 
 
482 aa  159  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  29.61 
 
 
499 aa  157  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1781  hydrogenase subunit F  28.08 
 
 
482 aa  156  8e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0671  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.97 
 
 
525 aa  155  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0875  hydrogenase subunit F  28.57 
 
 
482 aa  156  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00115046 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1353  hydrogenase subunit F  28.16 
 
 
481 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.178859  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.86 
 
 
522 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  32.89 
 
 
500 aa  149  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  31.23 
 
 
1264 aa  146  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  30.4 
 
 
673 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  30.87 
 
 
672 aa  143  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3531  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.99 
 
 
971 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  32 
 
 
1265 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  34.16 
 
 
683 aa  139  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1081  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.33 
 
 
524 aa  138  3.0000000000000003e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.346579  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  33.33 
 
 
671 aa  138  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1420  NADH dehydrogenase (quinone)  29.49 
 
 
1265 aa  137  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2616  NADH dehydrogenase (quinone)  31.61 
 
 
577 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1880  NADH dehydrogenase (quinone)  34.67 
 
 
1245 aa  134  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374238  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.07 
 
 
790 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  30.52 
 
 
737 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0500  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.92 
 
 
972 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438717  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3855  hydrogenase 4 subunit B  31.18 
 
 
672 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0943  NADH dehydrogenase (quinone)  30 
 
 
723 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.730208  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0435  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.64 
 
 
970 aa  130  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.305696  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  34.78 
 
 
662 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1768  NADH dehydrogenase (quinone)  31.01 
 
 
792 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  31.37 
 
 
669 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1771  NADH dehydrogenase (quinone)  29.57 
 
 
500 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  29.53 
 
 
501 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.156897  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2618  NADH dehydrogenase (quinone)  32.08 
 
 
646 aa  127  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.430528  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  28.65 
 
 
748 aa  127  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0044  NADH dehydrogenase (quinone)  31.73 
 
 
525 aa  127  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.33239 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3781  NADH dehydrogenase (quinone)  35.64 
 
 
654 aa  127  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0217094  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0929  hydrogenase 4 subunit B  31.83 
 
 
687 aa  127  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3953  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.72 
 
 
492 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6653  Na(+)/H(+) antiporter subunit D  29.33 
 
 
529 aa  126  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0496  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.65 
 
 
565 aa  126  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2806  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.9 
 
 
997 aa  126  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.71 
 
 
661 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  27.71 
 
 
662 aa  126  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0890  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.76 
 
 
507 aa  126  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50733  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5269  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.71 
 
 
967 aa  126  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1217  NADH dehydrogenase subunit M  27.29 
 
 
614 aa  125  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0917  NADH dehydrogenase (quinone)  27.15 
 
 
486 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.958268  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1591  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.33 
 
 
1024 aa  125  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156246  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1396  hydrogenase 4 subunit B  30.54 
 
 
671 aa  125  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0070  NADH dehydrogenase (quinone)  32.98 
 
 
667 aa  125  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1575  hydrogenase membrane subunit  30.8 
 
 
617 aa  125  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1260  hydrogenase 4 subunit B  31.18 
 
 
672 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0751084 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3530  NADH dehydrogenase (quinone)  33.45 
 
 
470 aa  125  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0955  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.91 
 
 
523 aa  124  4e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00424687  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0030  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.03 
 
 
973 aa  124  5e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01550  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  29.19 
 
 
505 aa  124  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000416  Na(+) H(+) antiporter subunit D  30.13 
 
 
498 aa  124  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  30.92 
 
 
644 aa  124  5e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0669  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.17 
 
 
538 aa  124  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4834  NADH dehydrogenase (quinone)  28.82 
 
 
585 aa  124  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2858  NADH dehydrogenase (quinone)  30.72 
 
 
504 aa  124  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.356875  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0742  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.84 
 
 
538 aa  124  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0210  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.93 
 
 
525 aa  123  9e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.924509  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  30.19 
 
 
1253 aa  123  9e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0218073 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  29.57 
 
 
498 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805314  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3692  NADH dehydrogenase (quinone)  29.21 
 
 
500 aa  123  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1741  NADH dehydrogenase subunit M  26.71 
 
 
604 aa  122  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.56797  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0164  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.15 
 
 
538 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2437  NADH dehydrogenase (quinone)  28.67 
 
 
530 aa  122  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.366515 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2032  NADH dehydrogenase (quinone)  29.11 
 
 
504 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2708  hydrogenase 4 subunit B  30.18 
 
 
679 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3666  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.07 
 
 
492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.752681  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.08 
 
 
492 aa  121  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.141551  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0751  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  27.68 
 
 
768 aa  121  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75438  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2161  NADH dehydrogenase (quinone)  32.48 
 
 
501 aa  122  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0588  NADH dehydrogenase (quinone)  30.85 
 
 
609 aa  121  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0890  NADH dehydrogenase subunit M  27.03 
 
 
613 aa  121  3.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.514114  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3197  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.31 
 
 
666 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1321  hydrogenase membrane subunit  29.24 
 
 
644 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1280  NADH dehydrogenase (quinone)  28.87 
 
 
499 aa  120  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1791  ATP-binding protein  29.79 
 
 
655 aa  120  6e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0608774  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1691  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.43 
 
 
688 aa  120  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000143823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>