More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0474 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0552  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  72.5 
 
 
531 aa  750    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.667644  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0474  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  100 
 
 
529 aa  1029    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1081  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.1 
 
 
524 aa  244  3e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.346579  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2290  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.84 
 
 
569 aa  189  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1632  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.32 
 
 
565 aa  172  9e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0788  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  27.37 
 
 
588 aa  172  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3626  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.75 
 
 
586 aa  157  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0753  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.78 
 
 
592 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3287  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.42 
 
 
566 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0353953  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0893  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.92 
 
 
575 aa  147  5e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330722  normal  0.0780403 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3669  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.61 
 
 
566 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3956  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.21 
 
 
566 aa  144  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2158  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.14 
 
 
589 aa  134  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.812368  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2964  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.74 
 
 
564 aa  131  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0589522 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1603  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  25.5 
 
 
594 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0846  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.55 
 
 
595 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3445  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  26.25 
 
 
612 aa  104  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464182  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5151  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  24.82 
 
 
618 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0571898  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2865  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  26.97 
 
 
588 aa  101  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.643493  normal  0.225438 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3530  NADH dehydrogenase (quinone)  32.28 
 
 
470 aa  89.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1791  ATP-binding protein  28.87 
 
 
655 aa  88.6  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0608774  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  29.17 
 
 
662 aa  88.2  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  25.14 
 
 
683 aa  86.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  31.02 
 
 
473 aa  86.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4834  NADH dehydrogenase (quinone)  23.99 
 
 
585 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1116  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  27.19 
 
 
493 aa  84.3  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2616  NADH dehydrogenase (quinone)  27.04 
 
 
577 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1914  L-alanyl-D-glutamate peptidase  26.92 
 
 
655 aa  83.6  0.000000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0179  hydrogenase 4 subunit B  29.65 
 
 
669 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.987712  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2618  NADH dehydrogenase (quinone)  27.11 
 
 
646 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.430528  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  26.43 
 
 
672 aa  81.6  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0329  hydrogenase 4 subunit B  28.36 
 
 
669 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0917  NADH dehydrogenase (quinone)  26.67 
 
 
486 aa  81.3  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.958268  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4288  NADH dehydrogenase (quinone)  24.48 
 
 
637 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277072  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2558  NADH dehydrogenase subunit M  29.95 
 
 
509 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0379  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  27.01 
 
 
605 aa  81.3  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000619684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2423  NADH dehydrogenase subunit M  31.47 
 
 
509 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29860  NADH dehydrogenase subunit M  29.95 
 
 
509 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000573313  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1261  hydrogenase 4 subunit B  28.79 
 
 
668 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  27.54 
 
 
662 aa  80.5  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1142  hydrogenase 4 subunit B  29.15 
 
 
748 aa  80.5  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.239539  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  23.84 
 
 
649 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  24.42 
 
 
674 aa  79.7  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4671  hydrogenase 4 subunit B  26.96 
 
 
674 aa  80.1  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2787  NADH dehydrogenase (quinone)  27.59 
 
 
633 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2795  NADH dehydrogenase (quinone)  27.59 
 
 
633 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0754  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  27.46 
 
 
501 aa  78.2  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000228157  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3297  NADH dehydrogenase subunit M  28.43 
 
 
509 aa  77.8  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.416453 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28550  NADH dehydrogenase subunit M  30.26 
 
 
509 aa  77.4  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.07 
 
 
790 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1107  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.47 
 
 
488 aa  77.4  0.0000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.980044  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1503  NADH dehydrogenase subunit M  30.26 
 
 
511 aa  77.4  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1405  NADH dehydrogenase subunit M  30.26 
 
 
532 aa  77.4  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1465  NADH dehydrogenase subunit M  28.93 
 
 
510 aa  77  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  24.75 
 
 
499 aa  77  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1059  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  28.5 
 
 
502 aa  77  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02202  NADH dehydrogenase subunit M  30.26 
 
 
509 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.786903  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1380  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  30.26 
 
 
509 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1805  NADH dehydrogenase subunit M  28.93 
 
 
510 aa  76.6  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.168858 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1571  NADH dehydrogenase subunit M  28.93 
 
 
510 aa  76.6  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1375  NADH dehydrogenase subunit M  30.26 
 
 
509 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.905412 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02162  hypothetical protein  30.26 
 
 
509 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2431  NADH dehydrogenase subunit M  30.26 
 
 
509 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2653  NADH dehydrogenase subunit M  30.26 
 
 
509 aa  77  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6065  hydrogenase 4 subunit B  28.79 
 
 
669 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388772  hitchhiker  0.000500664 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2426  NADH dehydrogenase subunit M  30.26 
 
 
509 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0584  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  25.08 
 
 
535 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3416  NADH dehydrogenase subunit M  30.26 
 
 
509 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0596  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  25.08 
 
 
535 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.395006 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2570  NADH dehydrogenase subunit M  30.26 
 
 
509 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2761  NADH dehydrogenase subunit M  30.26 
 
 
511 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2863  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.38 
 
 
498 aa  76.3  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.845476  normal  0.745609 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2545  NADH dehydrogenase subunit M  30.26 
 
 
509 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2501  NADH dehydrogenase subunit M  30.26 
 
 
509 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  27.27 
 
 
644 aa  76.6  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0210  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.73 
 
 
525 aa  76.6  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.924509  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2556  NADH dehydrogenase subunit M  30.26 
 
 
509 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1321  hydrogenase membrane subunit  27.87 
 
 
644 aa  76.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2456  NADH dehydrogenase subunit M  30.26 
 
 
509 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2663  NADH dehydrogenase subunit M  30.26 
 
 
509 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3855  hydrogenase 4 subunit B  25.15 
 
 
672 aa  76.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0574  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  24.76 
 
 
535 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  22.29 
 
 
476 aa  75.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3376  NADH dehydrogenase I, M subunit  28.93 
 
 
510 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3208  NADH dehydrogenase subunit M  28.93 
 
 
510 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281414  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1745  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  27.66 
 
 
525 aa  74.7  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.716507  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2821  NADH dehydrogenase subunit M  29.74 
 
 
509 aa  74.3  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.43  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  26.73 
 
 
673 aa  74.3  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2882  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  28.08 
 
 
534 aa  74.3  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139376  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0816  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  27.27 
 
 
497 aa  74.3  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4892  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  26.87 
 
 
552 aa  73.9  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.405552  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1617  hydrogenase 4 subunit B  26.24 
 
 
668 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  26.57 
 
 
669 aa  73.9  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1532  hydrogenase 4 subunit B  26.24 
 
 
668 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0932  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, M subunit  27.72 
 
 
497 aa  73.6  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_803  NADH:quinone oxidoreductase subunit 4 (chain M)  27.72 
 
 
497 aa  73.6  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  28.47 
 
 
1265 aa  73.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_002936  DET1575  hydrogenase membrane subunit  25.9 
 
 
617 aa  72.8  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1781  hydrogenase subunit F  26.2 
 
 
482 aa  73.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1691  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  25.83 
 
 
688 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000143823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>