More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2761 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02202  NADH dehydrogenase subunit M  86.19 
 
 		 509 aa  875    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.786903  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1380  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  86.19 
 
 		 509 aa  875    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4130  NADH dehydrogenase subunit M  74.3 
 
 		 510 aa  669    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2556  NADH dehydrogenase subunit M  86.77 
 
 		 509 aa  876    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2501  NADH dehydrogenase subunit M  86.58 
 
 		 509 aa  876    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1405  NADH dehydrogenase subunit M  89.98 
 
 		 532 aa  904    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1010  NADH dehydrogenase subunit M  71.2 
 
 		 514 aa  718    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3376  NADH dehydrogenase I, M subunit  74.5 
 
 		 510 aa  679    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3208  NADH dehydrogenase subunit M  74.3 
 
 		 510 aa  677    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281414  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2456  NADH dehydrogenase subunit M  86.58 
 
 		 509 aa  875    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02162  hypothetical protein  86.19 
 
 		 509 aa  875    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2426  NADH dehydrogenase subunit M  86.19 
 
 		 509 aa  875    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1805  NADH dehydrogenase subunit M  89.63 
 
 		 510 aa  895    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.168858 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2761  NADH dehydrogenase subunit M  100 
 
 		 511 aa  1019    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3297  NADH dehydrogenase subunit M  89.24 
 
 		 509 aa  907    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.416453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3614  NADH dehydrogenase subunit M  74.9 
 
 		 510 aa  694    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28550  NADH dehydrogenase subunit M  71.85 
 
 		 509 aa  713    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2663  NADH dehydrogenase subunit M  86.58 
 
 		 509 aa  876    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2539  NADH dehydrogenase subunit M  89.59 
 
 		 511 aa  909    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2431  NADH dehydrogenase subunit M  86.19 
 
 		 509 aa  875    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1735  NADH dehydrogenase subunit M  74.3 
 
 		 510 aa  669    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00591275  normal  0.538145 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2423  NADH dehydrogenase subunit M  73.08 
 
 		 509 aa  720    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2558  NADH dehydrogenase subunit M  75.3 
 
 		 509 aa  736    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1375  NADH dehydrogenase subunit M  86.19 
 
 		 509 aa  875    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.905412 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2570  NADH dehydrogenase subunit M  86.19 
 
 		 509 aa  875    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2653  NADH dehydrogenase subunit M  85.99 
 
 		 509 aa  873    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1503  NADH dehydrogenase subunit M  96.67 
 
 		 511 aa  973    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2545  NADH dehydrogenase subunit M  86.77 
 
 		 509 aa  879    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2821  NADH dehydrogenase subunit M  85.99 
 
 		 509 aa  848    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.43  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3121  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  67.07 
 
 		 513 aa  674    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0441802  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0370  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  69.63 
 
 		 507 aa  701    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1571  NADH dehydrogenase subunit M  89.63 
 
 		 510 aa  895    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3702  NADH dehydrogenase subunit M  74.7 
 
 		 510 aa  671    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.65414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1465  NADH dehydrogenase subunit M  89.43 
 
 		 510 aa  894    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3416  NADH dehydrogenase subunit M  86.19 
 
 		 509 aa  875    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29860  NADH dehydrogenase subunit M  75.3 
 
 		 509 aa  736    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000573313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1862  NADH dehydrogenase subunit M  74.5 
 
 		 510 aa  690    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal  0.0328463 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0595  NADH dehydrogenase subunit M  62.93 
 
 		 541 aa  632  1e-180  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000354161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0584  NADH dehydrogenase subunit M  62.93 
 
 		 541 aa  634  1e-180  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1688  NADH dehydrogenase subunit M  57.54 
 
 		 577 aa  590  1e-167  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.694136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1024  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  52.67 
 
 		 500 aa  472  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.272198  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1116  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  52.69 
 
 		 493 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1348  NADH dehydrogenase I, M subunit  54.55 
 
 		 489 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.467461  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1109  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  54.22 
 
 		 505 aa  455  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3814  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50.21 
 
 		 490 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2871  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.05 
 
 		 537 aa  431  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0408599 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0707  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  51.02 
 
 		 493 aa  397  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.296941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0314  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.94 
 
 		 493 aa  368  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3430  NADH dehydrogenase I, M subunit  42.18 
 
 		 496 aa  361  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.12 
 
 		 525 aa  350  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0171  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.89 
 
 		 496 aa  349  8e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1337  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.79 
 
 		 481 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.52 
 
 		 497 aa  344  2e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3343  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.16 
 
 		 519 aa  342  8e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.16 
 
 		 535 aa  342  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  37.75 
 
 		 522 aa  340  4e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.36 
 
 		 535 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000144113 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1358  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.96 
 
 		 481 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.199626  normal  0.187922 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  40.2 
 
 		 501 aa  338  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4060  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.05 
 
 		 480 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.40537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.44 
 
 		 542 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.44 
 
 		 542 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.990094  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0414  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.24 
 
 		 542 aa  335  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4732  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.96 
 
 		 480 aa  334  3e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708423  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1700  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.06 
 
 		 486 aa  333  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0282324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.09 
 
 		 494 aa  332  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000177754 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5565  NADH dehydrogenase subunit M  39.63 
 
 		 496 aa  332  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0400022  normal  0.331028 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1073  NADH dehydrogenase subunit M  39.43 
 
 		 496 aa  332  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2618  NADH-quinone oxidoreductase, M subunit  39.09 
 
 		 494 aa  332  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1311  NADH dehydrogenase subunit M  39.83 
 
 		 496 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1817  NADH dehydrogenase subunit M  39.83 
 
 		 496 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1302  NADH dehydrogenase subunit M  39.83 
 
 		 496 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1142  NADH dehydrogenase subunit M  39.83 
 
 		 496 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400671  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1448  NADH dehydrogenase subunit M  39.83 
 
 		 496 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0425  NADH dehydrogenase subunit M  39.83 
 
 		 496 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3212  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.57 
 
 		 517 aa  331  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2154  NADH dehydrogenase subunit M  39.43 
 
 		 496 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.575239  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0725  NADH dehydrogenase subunit M  39.83 
 
 		 496 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2261  NADH dehydrogenase subunit M  39.43 
 
 		 496 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.796685  normal  0.444802 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1625  NADH dehydrogenase subunit M  39.43 
 
 		 496 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209377  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1040  NADH dehydrogenase subunit M  39.18 
 
 		 496 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.926201  normal  0.336803 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2275  NADH dehydrogenase subunit M  39.63 
 
 		 496 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229712  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2237  NADH dehydrogenase subunit M  39.43 
 
 		 496 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.759454  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1875  NADH dehydrogenase subunit M  39.92 
 
 		 502 aa  329  8e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123353  normal  0.162516 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.48 
 
 		 507 aa  329  9e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  38.88 
 
 		 502 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1747  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.45 
 
 		 486 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.308611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0168  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.4 
 
 		 494 aa  327  5e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3126  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.15 
 
 		 535 aa  326  5e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0759  NADH dehydrogenase subunit M  38.41 
 
 		 521 aa  326  5e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0754  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.35 
 
 		 501 aa  326  6e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2208  NADH dehydrogenase subunit M  39.58 
 
 		 502 aa  326  8.000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2416  NADH dehydrogenase subunit M  40.69 
 
 		 506 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185861  hitchhiker  0.00201163 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0829  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.45 
 
 		 504 aa  325  2e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  37.88 
 
 		 502 aa  324  3e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1248  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.08 
 
 		 534 aa  323  5e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0150  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.83 
 
 		 495 aa  323  5e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4549  NADH dehydrogenase subunit M  39.59 
 
 		 502 aa  322  8e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.177769 
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  37.88 
 
 		 502 aa  322  9.000000000000001e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4402  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.95 
 
 		 506 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.807836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>