More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1348 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1348  NADH dehydrogenase I, M subunit  100 
 
 
489 aa  959    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.467461  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1503  NADH dehydrogenase subunit M  54.55 
 
 
511 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2761  NADH dehydrogenase subunit M  54.55 
 
 
511 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02202  NADH dehydrogenase subunit M  53.6 
 
 
509 aa  511  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.786903  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1380  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  53.6 
 
 
509 aa  511  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1375  NADH dehydrogenase subunit M  53.6 
 
 
509 aa  511  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.905412 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1116  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  61.3 
 
 
493 aa  514  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2426  NADH dehydrogenase subunit M  53.6 
 
 
509 aa  511  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3297  NADH dehydrogenase subunit M  54.55 
 
 
509 aa  513  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.416453 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2431  NADH dehydrogenase subunit M  53.6 
 
 
509 aa  511  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02162  hypothetical protein  53.6 
 
 
509 aa  511  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2653  NADH dehydrogenase subunit M  53.6 
 
 
509 aa  512  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3416  NADH dehydrogenase subunit M  53.6 
 
 
509 aa  511  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2570  NADH dehydrogenase subunit M  53.6 
 
 
509 aa  511  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1465  NADH dehydrogenase subunit M  53.72 
 
 
510 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1571  NADH dehydrogenase subunit M  53.72 
 
 
510 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2558  NADH dehydrogenase subunit M  54.31 
 
 
509 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1024  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  58.64 
 
 
500 aa  511  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.272198  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1805  NADH dehydrogenase subunit M  53.72 
 
 
510 aa  509  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.168858 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29860  NADH dehydrogenase subunit M  54.31 
 
 
509 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000573313  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1405  NADH dehydrogenase subunit M  54.34 
 
 
532 aa  502  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2539  NADH dehydrogenase subunit M  53.94 
 
 
511 aa  504  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2545  NADH dehydrogenase subunit M  53 
 
 
509 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2501  NADH dehydrogenase subunit M  52.8 
 
 
509 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28550  NADH dehydrogenase subunit M  54 
 
 
509 aa  501  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3121  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  54.35 
 
 
513 aa  500  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0441802  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2556  NADH dehydrogenase subunit M  53 
 
 
509 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2456  NADH dehydrogenase subunit M  53 
 
 
509 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2663  NADH dehydrogenase subunit M  52.8 
 
 
509 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2821  NADH dehydrogenase subunit M  52.21 
 
 
509 aa  493  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.43  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2423  NADH dehydrogenase subunit M  53.59 
 
 
509 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1010  NADH dehydrogenase subunit M  52.81 
 
 
514 aa  491  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3208  NADH dehydrogenase subunit M  56 
 
 
510 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281414  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2871  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50.49 
 
 
537 aa  483  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0408599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3376  NADH dehydrogenase I, M subunit  56.31 
 
 
510 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1862  NADH dehydrogenase subunit M  55.45 
 
 
510 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal  0.0328463 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1109  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  57.06 
 
 
505 aa  481  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0595  NADH dehydrogenase subunit M  51.8 
 
 
541 aa  477  1e-133  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000354161  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3614  NADH dehydrogenase subunit M  54.93 
 
 
510 aa  476  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166771  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0584  NADH dehydrogenase subunit M  51.8 
 
 
541 aa  476  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3814  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  53.48 
 
 
490 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4130  NADH dehydrogenase subunit M  55.64 
 
 
510 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3702  NADH dehydrogenase subunit M  55.64 
 
 
510 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.65414  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1735  NADH dehydrogenase subunit M  55.64 
 
 
510 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00591275  normal  0.538145 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0370  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.19 
 
 
507 aa  432  1e-120  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1688  NADH dehydrogenase subunit M  47.39 
 
 
577 aa  430  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.694136  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0707  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  56.46 
 
 
493 aa  403  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.296941  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4060  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  46.37 
 
 
480 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.40537  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0314  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  46.27 
 
 
493 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1358  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45 
 
 
481 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.199626  normal  0.187922 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3430  NADH dehydrogenase I, M subunit  48.91 
 
 
496 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1337  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.21 
 
 
481 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210293  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.92 
 
 
497 aa  360  3e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.29 
 
 
525 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177133  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4732  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.8 
 
 
480 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708423  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0171  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  46.96 
 
 
496 aa  354  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  39.59 
 
 
502 aa  353  5e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  39.59 
 
 
502 aa  351  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  39.39 
 
 
502 aa  350  3e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  40.53 
 
 
522 aa  349  5e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.76 
 
 
535 aa  349  7e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.71 
 
 
535 aa  347  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000144113 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1700  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.3 
 
 
486 aa  345  8e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0282324  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2618  NADH-quinone oxidoreductase, M subunit  42.77 
 
 
494 aa  344  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.77 
 
 
494 aa  344  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177754 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1248  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.04 
 
 
534 aa  341  1e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130648  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1273  NADH dehydrogenase subunit M  41.59 
 
 
503 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218995  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3212  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.57 
 
 
517 aa  340  4e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3343  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.75 
 
 
519 aa  340  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.22 
 
 
507 aa  340  5e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0790  NADH dehydrogenase subunit M  40.14 
 
 
489 aa  339  8e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0146664  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1747  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.68 
 
 
486 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.308611  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1365  NADH dehydrogenase subunit M  41.59 
 
 
503 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288443  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3625  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.98 
 
 
491 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1297  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.75 
 
 
517 aa  336  5e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.310609  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0902  NADH dehydrogenase subunit M  42.14 
 
 
503 aa  335  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  41.93 
 
 
501 aa  334  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1567  NADH dehydrogenase subunit M  40.47 
 
 
510 aa  333  3e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0145309  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3214  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.82 
 
 
514 aa  333  4e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0414  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43 
 
 
542 aa  333  4e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.8 
 
 
542 aa  332  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.8 
 
 
542 aa  332  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.990094  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2820  NADH dehydrogenase subunit M  40.99 
 
 
494 aa  331  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4402  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.97 
 
 
506 aa  330  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4621  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.1 
 
 
503 aa  330  5.0000000000000004e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0225414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1304  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.7 
 
 
521 aa  328  9e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278041  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1875  NADH dehydrogenase subunit M  39.59 
 
 
502 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123353  normal  0.162516 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2049  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.84 
 
 
495 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3126  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.35 
 
 
535 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.57 
 
 
508 aa  326  7e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2232  NADH dehydrogenase subunit M  40.21 
 
 
513 aa  326  7e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1817  NADH dehydrogenase subunit M  38.52 
 
 
496 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1448  NADH dehydrogenase subunit M  38.52 
 
 
496 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1302  NADH dehydrogenase subunit M  38.52 
 
 
496 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0425  NADH dehydrogenase subunit M  38.52 
 
 
496 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1142  NADH dehydrogenase subunit M  38.52 
 
 
496 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400671  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0725  NADH dehydrogenase subunit M  38.52 
 
 
496 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10971  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1311  NADH dehydrogenase subunit M  38.52 
 
 
496 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.73 
 
 
585 aa  325  9e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341288  normal  0.991992 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1728  NADH dehydrogenase subunit M  41.2 
 
 
512 aa  325  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.694351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>