More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3126 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3126  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  100 
 
 
535 aa  1069    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  73.8 
 
 
522 aa  805    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  72.83 
 
 
535 aa  757    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000144113 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3343  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  74.22 
 
 
519 aa  804    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  71.24 
 
 
535 aa  767    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  76.32 
 
 
525 aa  802    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177133  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  54.56 
 
 
542 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  54.56 
 
 
542 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.990094  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0414  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  53.98 
 
 
542 aa  525  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4155  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  53.36 
 
 
534 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0166298 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  51.49 
 
 
501 aa  514  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  52.44 
 
 
502 aa  511  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  52.24 
 
 
502 aa  508  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  49.44 
 
 
585 aa  508  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341288  normal  0.991992 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  52.03 
 
 
502 aa  508  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4621  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  51.82 
 
 
503 aa  504  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0225414 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1728  NADH dehydrogenase subunit M  51.21 
 
 
512 aa  499  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.694351  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  48.61 
 
 
497 aa  499  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1567  NADH dehydrogenase subunit M  49.7 
 
 
510 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0145309  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0759  NADH dehydrogenase subunit M  49.15 
 
 
521 aa  492  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1992  NADH dehydrogenase subunit M  49.51 
 
 
513 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1190  NADH dehydrogenase subunit M  50 
 
 
513 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.602239  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2529  NADH dehydrogenase subunit M  50 
 
 
513 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0432269  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2820  NADH dehydrogenase subunit M  49.7 
 
 
494 aa  489  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1328  NADH dehydrogenase subunit M  49.25 
 
 
515 aa  486  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0365587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4549  NADH dehydrogenase subunit M  50.2 
 
 
502 aa  484  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.177769 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  49.11 
 
 
503 aa  484  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  48.88 
 
 
507 aa  479  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1875  NADH dehydrogenase subunit M  49.59 
 
 
502 aa  480  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123353  normal  0.162516 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0902  NADH dehydrogenase subunit M  50.92 
 
 
503 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1195  NADH dehydrogenase subunit M  47.93 
 
 
514 aa  480  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2873  NADH dehydrogenase subunit M  49.8 
 
 
505 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593537  normal  0.190787 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3214  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  49.9 
 
 
514 aa  477  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1365  NADH dehydrogenase subunit M  50.98 
 
 
503 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288443  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1304  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50.51 
 
 
521 aa  477  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278041  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3286  NADH dehydrogenase subunit M  49.8 
 
 
505 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3212  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50.4 
 
 
517 aa  475  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4138  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  48.31 
 
 
506 aa  478  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.68162  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1073  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50.75 
 
 
527 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.397792  normal  0.614174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1202  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50.54 
 
 
527 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4402  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.91 
 
 
506 aa  473  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2232  NADH dehydrogenase subunit M  48.07 
 
 
513 aa  472  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1273  NADH dehydrogenase subunit M  50.98 
 
 
503 aa  475  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218995  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1295  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  48.37 
 
 
559 aa  473  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1248  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  49.25 
 
 
534 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130648  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0790  NADH dehydrogenase subunit M  49.59 
 
 
489 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0146664  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2586  NADH dehydrogenase subunit M  49.19 
 
 
505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal  0.933861 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2288  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  46.53 
 
 
516 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2416  NADH dehydrogenase subunit M  52.14 
 
 
506 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185861  hitchhiker  0.00201163 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2208  NADH dehydrogenase subunit M  49.8 
 
 
502 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1037  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  49.61 
 
 
525 aa  466  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.260264  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1007  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50.32 
 
 
527 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244989  normal  0.172272 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1656  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  49.18 
 
 
495 aa  464  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.750988  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.29 
 
 
508 aa  464  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  46.17 
 
 
494 aa  457  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2618  NADH-quinone oxidoreductase, M subunit  46.17 
 
 
494 aa  457  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0829  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.01 
 
 
504 aa  455  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2050  NADH dehydrogenase subunit M  46.63 
 
 
488 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232549  normal  0.0955875 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3625  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.17 
 
 
491 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0754  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  48.26 
 
 
501 aa  453  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1302  NADH dehydrogenase subunit M  46.83 
 
 
496 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1817  NADH dehydrogenase subunit M  46.83 
 
 
496 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1311  NADH dehydrogenase subunit M  46.83 
 
 
496 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1448  NADH dehydrogenase subunit M  46.83 
 
 
496 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5565  NADH dehydrogenase subunit M  47.03 
 
 
496 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0400022  normal  0.331028 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0425  NADH dehydrogenase subunit M  46.83 
 
 
496 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2261  NADH dehydrogenase subunit M  47.24 
 
 
496 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.796685  normal  0.444802 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0150  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  46.64 
 
 
508 aa  450  1e-125  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000116263  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1073  NADH dehydrogenase subunit M  46.83 
 
 
496 aa  450  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1142  NADH dehydrogenase subunit M  46.83 
 
 
496 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400671  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0725  NADH dehydrogenase subunit M  46.83 
 
 
496 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10971  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1297  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.75 
 
 
517 aa  449  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.310609  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1625  NADH dehydrogenase subunit M  47.24 
 
 
496 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209377  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2275  NADH dehydrogenase subunit M  47.24 
 
 
496 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229712  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2237  NADH dehydrogenase subunit M  47.24 
 
 
496 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.759454  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2047  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.2 
 
 
506 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.688388  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2049  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.7 
 
 
495 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2154  NADH dehydrogenase subunit M  47.03 
 
 
496 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.575239  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1415  NADH dehydrogenase (quinone)  46.68 
 
 
491 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.508375  normal  0.0193211 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1367  NADH dehydrogenase subunit M  46.17 
 
 
504 aa  447  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73718  normal  0.0186615 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1040  NADH dehydrogenase subunit M  47.03 
 
 
496 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.926201  normal  0.336803 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1355  NADH dehydrogenase subunit M  47.32 
 
 
496 aa  444  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000992227  normal  0.0345123 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1997  NADH dehydrogenase subunit M  46.52 
 
 
497 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.425538  normal  0.176809 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2819  NADH dehydrogenase subunit M  45.82 
 
 
502 aa  443  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3498  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.78 
 
 
491 aa  444  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0973  NADH dehydrogenase subunit M  46.83 
 
 
488 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0836349  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2553  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  46.4 
 
 
504 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.668765  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3202  NADH dehydrogenase subunit M  46.72 
 
 
496 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.422188  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0939  NADH dehydrogenase subunit M  47.24 
 
 
488 aa  442  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.573933  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1103  NADH dehydrogenase subunit M  44.79 
 
 
495 aa  436  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135594  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1505  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.77 
 
 
491 aa  437  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.185001  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.98 
 
 
504 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1513  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.75 
 
 
490 aa  432  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366776 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1879  NADH dehydrogenase subunit M  45.81 
 
 
488 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.493129  normal  0.822984 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2202  NADH dehydrogenase subunit M  46.22 
 
 
488 aa  435  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal  0.474832 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1958  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.14 
 
 
501 aa  432  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0280811 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01299  NADH dehydrogenase subunit M  45.02 
 
 
491 aa  430  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.648189  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0961  NADH dehydrogenase subunit M  45.86 
 
 
494 aa  430  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0280946  normal  0.49186 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1754  NADH dehydrogenase subunit M  46.15 
 
 
493 aa  429  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.494513  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1154  NADH dehydrogenase subunit M  45.21 
 
 
494 aa  431  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.408177  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>