More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0150 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0168  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  94.74 
 
 
494 aa  867    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0150  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  100 
 
 
495 aa  962    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0314  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  64.44 
 
 
493 aa  611  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0171  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  62.12 
 
 
496 aa  580  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3430  NADH dehydrogenase I, M subunit  63.97 
 
 
496 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.77 
 
 
497 aa  379  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.37 
 
 
535 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1875  NADH dehydrogenase subunit M  41.16 
 
 
502 aa  372  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123353  normal  0.162516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.62 
 
 
525 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177133  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3212  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.38 
 
 
517 aa  375  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.37 
 
 
535 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000144113 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  41.48 
 
 
522 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2873  NADH dehydrogenase subunit M  41.65 
 
 
505 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593537  normal  0.190787 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.06 
 
 
507 aa  363  5.0000000000000005e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.45 
 
 
503 aa  362  9e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2208  NADH dehydrogenase subunit M  41.16 
 
 
502 aa  360  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3343  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.55 
 
 
519 aa  360  4e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3286  NADH dehydrogenase subunit M  41.58 
 
 
505 aa  359  7e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  40.25 
 
 
502 aa  359  7e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0215  NADH dehydrogenase I chain M  47.11 
 
 
491 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  40.25 
 
 
502 aa  358  9.999999999999999e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1567  NADH dehydrogenase subunit M  39.02 
 
 
510 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0145309  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0252  NADH dehydrogenase subunit M  41.73 
 
 
501 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0281  NADH dehydrogenase subunit M  41.73 
 
 
501 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.540456  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2586  NADH dehydrogenase subunit M  40.57 
 
 
505 aa  356  5e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal  0.933861 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  39.07 
 
 
502 aa  355  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4549  NADH dehydrogenase subunit M  39.84 
 
 
502 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.177769 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1656  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.61 
 
 
495 aa  355  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.750988  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4138  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.59 
 
 
506 aa  355  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.68162  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3814  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  46.67 
 
 
490 aa  354  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4402  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.88 
 
 
506 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2819  NADH dehydrogenase subunit M  40.79 
 
 
502 aa  353  2.9999999999999997e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6082  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.19 
 
 
519 aa  353  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.596347  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3126  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.41 
 
 
535 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1465  NADH dehydrogenase subunit M  39.75 
 
 
510 aa  351  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01299  NADH dehydrogenase subunit M  40.72 
 
 
491 aa  350  2e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.648189  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1805  NADH dehydrogenase subunit M  39.75 
 
 
510 aa  350  3e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.168858 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1571  NADH dehydrogenase subunit M  39.75 
 
 
510 aa  350  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0754  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.81 
 
 
501 aa  350  4e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3297  NADH dehydrogenase subunit M  40.08 
 
 
509 aa  349  6e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.416453 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1010  NADH dehydrogenase subunit M  45.83 
 
 
514 aa  349  6e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  38.55 
 
 
501 aa  349  8e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1503  NADH dehydrogenase subunit M  40.17 
 
 
511 aa  348  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2416  NADH dehydrogenase subunit M  41.05 
 
 
506 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185861  hitchhiker  0.00201163 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3214  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.68 
 
 
514 aa  347  4e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3121  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.44 
 
 
513 aa  347  4e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0441802  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28550  NADH dehydrogenase subunit M  45.67 
 
 
509 aa  344  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1195  NADH dehydrogenase subunit M  39.13 
 
 
514 aa  344  2e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2761  NADH dehydrogenase subunit M  39.8 
 
 
511 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1405  NADH dehydrogenase subunit M  39.8 
 
 
532 aa  343  4e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1073  NADH dehydrogenase subunit M  40.12 
 
 
496 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2261  NADH dehydrogenase subunit M  40.4 
 
 
496 aa  342  8e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.796685  normal  0.444802 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0720  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.33 
 
 
504 aa  342  8e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.362005  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1625  NADH dehydrogenase subunit M  40.4 
 
 
496 aa  342  8e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209377  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2237  NADH dehydrogenase subunit M  40.4 
 
 
496 aa  342  8e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.759454  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2154  NADH dehydrogenase subunit M  40.2 
 
 
496 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.575239  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5565  NADH dehydrogenase subunit M  40.2 
 
 
496 aa  342  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0400022  normal  0.331028 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1024  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.65 
 
 
500 aa  342  1e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.272198  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1952  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.63 
 
 
507 aa  341  1e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0417902  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1817  NADH dehydrogenase subunit M  40.12 
 
 
496 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0425  NADH dehydrogenase subunit M  40.12 
 
 
496 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1311  NADH dehydrogenase subunit M  40.12 
 
 
496 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1448  NADH dehydrogenase subunit M  40.12 
 
 
496 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1142  NADH dehydrogenase subunit M  40.12 
 
 
496 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400671  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2821  NADH dehydrogenase subunit M  42.72 
 
 
509 aa  341  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.43  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0725  NADH dehydrogenase subunit M  40.12 
 
 
496 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1302  NADH dehydrogenase subunit M  40.12 
 
 
496 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1304  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.31 
 
 
521 aa  341  2e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278041  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02202  NADH dehydrogenase subunit M  42.38 
 
 
509 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.786903  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1380  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.38 
 
 
509 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02162  hypothetical protein  42.38 
 
 
509 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2423  NADH dehydrogenase subunit M  46.39 
 
 
509 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4621  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.95 
 
 
503 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0225414 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2653  NADH dehydrogenase subunit M  42.38 
 
 
509 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2539  NADH dehydrogenase subunit M  40 
 
 
511 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1375  NADH dehydrogenase subunit M  42.38 
 
 
509 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.905412 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2426  NADH dehydrogenase subunit M  42.38 
 
 
509 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3416  NADH dehydrogenase subunit M  42.38 
 
 
509 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2570  NADH dehydrogenase subunit M  42.38 
 
 
509 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2431  NADH dehydrogenase subunit M  42.38 
 
 
509 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2820  NADH dehydrogenase subunit M  39.84 
 
 
494 aa  340  2.9999999999999998e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2275  NADH dehydrogenase subunit M  40.2 
 
 
496 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229712  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2545  NADH dehydrogenase subunit M  42.24 
 
 
509 aa  340  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3625  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.36 
 
 
491 aa  340  4e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2556  NADH dehydrogenase subunit M  42.24 
 
 
509 aa  340  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.02 
 
 
504 aa  340  4e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.29 
 
 
542 aa  339  5e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2501  NADH dehydrogenase subunit M  42.24 
 
 
509 aa  340  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1728  NADH dehydrogenase subunit M  39.47 
 
 
512 aa  340  5e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.694351  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2663  NADH dehydrogenase subunit M  42.24 
 
 
509 aa  340  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.29 
 
 
542 aa  340  5e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.990094  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0829  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.14 
 
 
504 aa  339  7e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1992  NADH dehydrogenase subunit M  39.76 
 
 
513 aa  339  9e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1040  NADH dehydrogenase subunit M  40 
 
 
496 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.926201  normal  0.336803 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2456  NADH dehydrogenase subunit M  42 
 
 
509 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0414  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.29 
 
 
542 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29860  NADH dehydrogenase subunit M  42.39 
 
 
509 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000573313  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2558  NADH dehydrogenase subunit M  42.39 
 
 
509 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1513  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.07 
 
 
490 aa  337  2.9999999999999997e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366776 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2232  NADH dehydrogenase subunit M  39.64 
 
 
513 aa  337  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>