More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1603 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1603  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  100 
 
 
594 aa  1182    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0753  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  47.06 
 
 
592 aa  489  1e-137  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3626  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.64 
 
 
586 aa  488  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2158  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  47.85 
 
 
589 aa  391  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.812368  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0788  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  45.07 
 
 
588 aa  390  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3956  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  41.35 
 
 
566 aa  337  5e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3669  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  41.21 
 
 
566 aa  333  4e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3287  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.79 
 
 
566 aa  332  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0353953  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1632  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  41.93 
 
 
565 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2290  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38 
 
 
569 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2964  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.76 
 
 
564 aa  321  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0589522 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0893  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.67 
 
 
575 aa  309  1.0000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330722  normal  0.0780403 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2865  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.49 
 
 
588 aa  244  3e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.643493  normal  0.225438 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0846  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.71 
 
 
595 aa  229  1e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5151  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.97 
 
 
618 aa  209  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0571898  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3445  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.36 
 
 
612 aa  207  4e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464182  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  30.9 
 
 
673 aa  171  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2616  NADH dehydrogenase (quinone)  30.31 
 
 
577 aa  160  8e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  30.28 
 
 
671 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  27.16 
 
 
500 aa  159  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0671  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.5 
 
 
525 aa  158  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1822  hydrogenase membrane subunit  31.63 
 
 
643 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0165692  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  28.33 
 
 
672 aa  153  7e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  25.25 
 
 
748 aa  153  8.999999999999999e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0379  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.36 
 
 
605 aa  153  8.999999999999999e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000619684  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0164  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.78 
 
 
538 aa  152  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  33.52 
 
 
1253 aa  151  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0218073 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0588  NADH dehydrogenase (quinone)  30.94 
 
 
609 aa  151  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  32.37 
 
 
662 aa  150  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0742  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.9 
 
 
538 aa  150  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2529  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.21 
 
 
766 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.997639  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.2 
 
 
522 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  29.02 
 
 
1265 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  29.08 
 
 
669 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0731  quinone dependent NADH dehydrogenase  31.08 
 
 
511 aa  147  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156813  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.95 
 
 
661 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1123  putative NADH dehydrogenase  28.57 
 
 
498 aa  144  6e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0103051  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0044  NADH dehydrogenase (quinone)  33.75 
 
 
525 aa  144  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.33239 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0320  NADH dehydrogenase (quinone)  30.07 
 
 
531 aa  143  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18950  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.25 
 
 
543 aa  143  9e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.8 
 
 
523 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0000590255  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0937  hydrogenase subunit F  30.03 
 
 
482 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1781  hydrogenase subunit F  29.94 
 
 
482 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1042  hydrogenase subunit F  30.23 
 
 
482 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  28.36 
 
 
673 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3221  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.69 
 
 
500 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2708  hydrogenase 4 subunit B  29.04 
 
 
679 aa  142  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1396  hydrogenase 4 subunit B  34.13 
 
 
671 aa  141  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3692  NADH dehydrogenase (quinone)  30.75 
 
 
500 aa  142  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0496  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.11 
 
 
565 aa  141  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  29.79 
 
 
672 aa  141  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  29.79 
 
 
672 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  29.79 
 
 
672 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  29.79 
 
 
672 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  30.21 
 
 
672 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0955  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.38 
 
 
523 aa  140  7e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00424687  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  29.06 
 
 
480 aa  140  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  30.87 
 
 
683 aa  140  7.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0875  hydrogenase subunit F  29.66 
 
 
482 aa  140  8.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00115046 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3953  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.38 
 
 
492 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000416  Na(+) H(+) antiporter subunit D  30.72 
 
 
498 aa  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  26.2 
 
 
662 aa  139  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0929  hydrogenase 4 subunit B  29.86 
 
 
687 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4909  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  27.73 
 
 
635 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0943  NADH dehydrogenase (quinone)  28.91 
 
 
723 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.730208  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3948  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.03 
 
 
545 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.147624 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1791  ATP-binding protein  29.2 
 
 
655 aa  137  4e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0608774  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  30.96 
 
 
1264 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0315  NADH dehydrogenase (quinone)  30.91 
 
 
674 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39787  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2806  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.19 
 
 
997 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1914  L-alanyl-D-glutamate peptidase  28.22 
 
 
655 aa  137  6.0000000000000005e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3666  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.61 
 
 
492 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.752681  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0669  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.06 
 
 
538 aa  137  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1771  NADH dehydrogenase (quinone)  31.1 
 
 
500 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1768  NADH dehydrogenase (quinone)  31.87 
 
 
792 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  29.68 
 
 
672 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3855  hydrogenase 4 subunit B  32.06 
 
 
672 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.73 
 
 
943 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0380  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.72 
 
 
472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000595488  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.41 
 
 
492 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.141551  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2286  NADH dehydrogenase (quinone)  32.05 
 
 
437 aa  135  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1353  hydrogenase subunit F  28.12 
 
 
481 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.178859  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0985  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  27.03 
 
 
624 aa  134  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  32.72 
 
 
737 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2341  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.54 
 
 
504 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2618  NADH dehydrogenase (quinone)  31.75 
 
 
646 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.430528  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2032  NADH dehydrogenase (quinone)  30.15 
 
 
504 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14770  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.39 
 
 
510 aa  133  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18278  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1260  hydrogenase 4 subunit B  32.37 
 
 
672 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0751084 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0890  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.18 
 
 
507 aa  133  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50733  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0070  NADH dehydrogenase (quinone)  30.6 
 
 
667 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3531  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.46 
 
 
971 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  29.91 
 
 
674 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  26.95 
 
 
656 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0584  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.82 
 
 
535 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0574  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.12 
 
 
535 aa  132  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0596  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.82 
 
 
535 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.395006 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2525  NADH dehydrogenase (quinone)  28.76 
 
 
505 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.44 
 
 
952 aa  131  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3781  NADH dehydrogenase (quinone)  33.23 
 
 
654 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0217094  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>