More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2708 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  61.47 
 
 
672 aa  751    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  61.17 
 
 
672 aa  749    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  61.17 
 
 
672 aa  748    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  56.21 
 
 
673 aa  709    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2708  hydrogenase 4 subunit B  100 
 
 
679 aa  1343    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  58.12 
 
 
671 aa  710    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  61.62 
 
 
672 aa  753    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  89.3 
 
 
673 aa  1091    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  61.47 
 
 
672 aa  751    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  61.62 
 
 
672 aa  753    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  49.31 
 
 
672 aa  592  1e-168  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  41.28 
 
 
683 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1914  L-alanyl-D-glutamate peptidase  37.75 
 
 
655 aa  397  1e-109  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1142  hydrogenase 4 subunit B  41.24 
 
 
748 aa  391  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.239539  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1791  ATP-binding protein  36.56 
 
 
655 aa  386  1e-106  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0608774  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  42.26 
 
 
661 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  37.01 
 
 
662 aa  384  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3054  formate hydrogenlyase subunit 3  42.22 
 
 
608 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.920212  normal  0.22505 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3974  formate hydrogenlyase subunit 3  42.49 
 
 
608 aa  373  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2848  formate hydrogenlyase subunit 3  42.49 
 
 
608 aa  373  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.264273 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3011  formate hydrogenlyase subunit 3  42.49 
 
 
608 aa  373  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02573  NADH dehydrogenase subunit N  42.29 
 
 
608 aa  372  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.621394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0966  NADH dehydrogenase (quinone)  42.29 
 
 
608 aa  372  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2859  formate hydrogenlyase subunit 3  42.29 
 
 
608 aa  372  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0989  formate hydrogenlyase subunit 3  42.29 
 
 
608 aa  372  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.180245 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3003  formate hydrogenlyase subunit 3  41.83 
 
 
608 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790766 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2972  formate hydrogenlyase subunit 3  41.83 
 
 
608 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0892  NADH dehydrogenase (quinone)  38.95 
 
 
669 aa  368  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3038  formate hydrogenlyase subunit 3  41.83 
 
 
608 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000419635 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3161  formate hydrogenlyase subunit 3  41.63 
 
 
608 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  39.48 
 
 
669 aa  362  9e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0132  hydrogenase 4 membrane subunit  33.45 
 
 
650 aa  352  1e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.167866  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1691  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.66 
 
 
688 aa  349  8e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000143823  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0734  NAD-dependent dehydrogenase subunit  37.56 
 
 
668 aa  348  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0393018  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2432  NADH dehydrogenase (quinone)  45.49 
 
 
622 aa  345  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.96835  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  38.63 
 
 
737 aa  340  7e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3196  formate hydrogenlyase subunit 3  40.27 
 
 
608 aa  339  9e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  38.03 
 
 
662 aa  339  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1321  hydrogenase membrane subunit  36.76 
 
 
644 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  35.91 
 
 
644 aa  337  5e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2616  NADH dehydrogenase (quinone)  38.97 
 
 
577 aa  335  2e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0943  NADH dehydrogenase (quinone)  38.35 
 
 
723 aa  333  8e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.730208  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1575  hydrogenase membrane subunit  37.6 
 
 
617 aa  332  2e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2601  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.17 
 
 
660 aa  332  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0070  NADH dehydrogenase (quinone)  37.6 
 
 
667 aa  331  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2474  hydrogenase 4 subunit B  39.44 
 
 
669 aa  331  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  36.61 
 
 
674 aa  326  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0375  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.67 
 
 
669 aa  323  5e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.044448  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  35.26 
 
 
649 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3292  hydrogenase 4 subunit B  37.12 
 
 
674 aa  321  3e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4288  NADH dehydrogenase (quinone)  35.66 
 
 
637 aa  321  3.9999999999999996e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277072  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0329  hydrogenase 4 subunit B  35.36 
 
 
669 aa  318  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2558  NADH dehydrogenase (quinone)  35.96 
 
 
666 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0166  hydrogenase 4 subunit B  39.56 
 
 
681 aa  316  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970512  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3781  NADH dehydrogenase (quinone)  44.44 
 
 
654 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0217094  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4671  hydrogenase 4 subunit B  36.26 
 
 
674 aa  312  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3655  NADH dehydrogenase (quinone)  47.72 
 
 
654 aa  310  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0270969  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1822  hydrogenase membrane subunit  32.21 
 
 
643 aa  310  8e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0165692  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0739  NAD-dependent dehydrogenase subunit  36.83 
 
 
661 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188084  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3193  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.84 
 
 
659 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.141056  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1069  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.4 
 
 
659 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7000400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0929  hydrogenase 4 subunit B  38.99 
 
 
687 aa  307  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3197  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.3 
 
 
666 aa  306  6e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6065  hydrogenase 4 subunit B  35.21 
 
 
669 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388772  hitchhiker  0.000500664 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1065  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.85 
 
 
666 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.82932e-25 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1260  hydrogenase 4 subunit B  39.3 
 
 
672 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0751084 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0179  hydrogenase 4 subunit B  35.31 
 
 
669 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.987712  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3855  hydrogenase 4 subunit B  38.31 
 
 
672 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1862  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.73 
 
 
646 aa  299  1e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000307213  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1261  hydrogenase 4 subunit B  35.56 
 
 
668 aa  294  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2618  NADH dehydrogenase (quinone)  34.21 
 
 
646 aa  292  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.430528  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1307  NADH dehydrogenase (quinone)  31.46 
 
 
633 aa  291  4e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3796  NADH dehydrogenase (quinone)  47.46 
 
 
654 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273036  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3713  NADH dehydrogenase (quinone)  47.46 
 
 
654 aa  289  1e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.117424  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1396  hydrogenase 4 subunit B  37.77 
 
 
671 aa  288  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1617  hydrogenase 4 subunit B  35.56 
 
 
668 aa  287  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1532  hydrogenase 4 subunit B  35.56 
 
 
668 aa  287  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2560  NADH dehydrogenase (quinone)  35.8 
 
 
663 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4703  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.31 
 
 
662 aa  279  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0336  NADH dehydrogenase (quinone)  40 
 
 
665 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0315  NADH dehydrogenase (quinone)  34.71 
 
 
674 aa  268  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39787  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1807  hydrogenase 4 subunit B  36.65 
 
 
660 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.370569  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2149  hydrogenase 4 subunit B  36.65 
 
 
660 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.33721  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2985  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.08 
 
 
674 aa  260  8e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0690807  hitchhiker  0.0074409 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0778  NADH dehydrogenase (quinone)  36.33 
 
 
682 aa  258  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.590886  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3795  NADH dehydrogenase (quinone)  42.61 
 
 
666 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3654  NADH dehydrogenase (quinone)  43.92 
 
 
665 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3712  NADH dehydrogenase (quinone)  42.2 
 
 
666 aa  246  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.753561  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4469  NADH dehydrogenase (quinone)  35.27 
 
 
664 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3276  NADH dehydrogenase (quinone)  34.36 
 
 
671 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10084  oxidoreductase  31.46 
 
 
640 aa  226  9e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  normal  0.170471 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  33.01 
 
 
748 aa  209  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  33.03 
 
 
1265 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  30.7 
 
 
500 aa  205  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  33.94 
 
 
1264 aa  204  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0671  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.78 
 
 
525 aa  204  4e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.43 
 
 
522 aa  201  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2787  NADH dehydrogenase (quinone)  28.53 
 
 
633 aa  196  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2795  NADH dehydrogenase (quinone)  28.53 
 
 
633 aa  196  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  32.65 
 
 
1253 aa  194  6e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0218073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>