More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0107 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
500 aa  989    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.47 
 
 
499 aa  303  4.0000000000000003e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2742  NADH dehydrogenase (quinone)  35.78 
 
 
497 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3628  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36.42 
 
 
487 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1280  NADH dehydrogenase (quinone)  36.97 
 
 
499 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  34.07 
 
 
554 aa  282  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2864  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.07 
 
 
566 aa  280  3e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479761  normal  0.594337 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  37.29 
 
 
748 aa  280  5e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0845  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36.76 
 
 
698 aa  279  7e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3954  NADH dehydrogenase (quinone)  37.31 
 
 
497 aa  279  8e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0790  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.37 
 
 
500 aa  279  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1398  NADH dehydrogenase (quinone)  34.28 
 
 
498 aa  276  5e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2662  NADH dehydrogenase (quinone)  38.02 
 
 
503 aa  274  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1000  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.09 
 
 
507 aa  268  2e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.827251 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3285  NADH dehydrogenase (quinone)  36.84 
 
 
496 aa  268  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0676667  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2288  NADH dehydrogenase (quinone)  36.27 
 
 
488 aa  268  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2161  NADH dehydrogenase (quinone)  33.06 
 
 
501 aa  267  2.9999999999999995e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0751  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.59 
 
 
542 aa  267  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3667  NADH dehydrogenase (quinone)  37.47 
 
 
496 aa  265  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2966  NADH dehydrogenase (quinone)  34.35 
 
 
501 aa  265  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.278298 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.56 
 
 
501 aa  264  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.37012 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1601  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.33 
 
 
499 aa  264  3e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01550  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  33.96 
 
 
505 aa  263  6.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1634  NADH dehydrogenase (quinone)  35.68 
 
 
490 aa  259  6e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.181583  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5152  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.64 
 
 
651 aa  259  6e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0744  NADH dehydrogenase (quinone)  35.02 
 
 
504 aa  256  7e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3666  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.19 
 
 
492 aa  248  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.752681  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.8 
 
 
492 aa  247  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.141551  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3446  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.79 
 
 
669 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.181891  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3953  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.33 
 
 
492 aa  244  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0890  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.6 
 
 
507 aa  242  1e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50733  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1420  NADH dehydrogenase (quinone)  35.5 
 
 
1265 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0812  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
503 aa  239  5.999999999999999e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.114491  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.76 
 
 
513 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  34.08 
 
 
1264 aa  239  9e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0328  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase family protein  33.19 
 
 
489 aa  237  4e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1880  NADH dehydrogenase (quinone)  36.97 
 
 
1245 aa  233  6e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374238  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  33.5 
 
 
1265 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0917  NADH dehydrogenase (quinone)  31.82 
 
 
486 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.958268  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0677  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
496 aa  227  3e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0891  NADH dehydrogenase (quinone)  33.81 
 
 
493 aa  222  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.158004  normal  0.070736 
 
 
-
 
NC_002978  WD1107  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.79 
 
 
488 aa  221  3e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.980044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  34.47 
 
 
1253 aa  221  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0218073 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0563  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase family protein  35.22 
 
 
475 aa  214  1.9999999999999998e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0816  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.58 
 
 
498 aa  213  7.999999999999999e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0380  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.22 
 
 
472 aa  212  1e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000595488  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1635  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.4 
 
 
502 aa  209  6e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193581  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.21 
 
 
522 aa  209  7e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  32.05 
 
 
673 aa  208  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12060  NADH dehydrogenase I subunit L  33.09 
 
 
506 aa  205  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000252399  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0671  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.67 
 
 
525 aa  204  3e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2286  NADH dehydrogenase (quinone)  32.05 
 
 
437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  29.44 
 
 
501 aa  201  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.156897  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.34 
 
 
496 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4834  NADH dehydrogenase (quinone)  29.15 
 
 
585 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0179  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.42 
 
 
491 aa  197  3e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.490475  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  32.11 
 
 
683 aa  195  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  29.57 
 
 
672 aa  194  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0315  NADH dehydrogenase (quinone)  32.65 
 
 
674 aa  193  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39787  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2223  NADH dehydrogenase (quinone)  31.28 
 
 
496 aa  193  6e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0121  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  26.46 
 
 
491 aa  193  7e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1771  NADH dehydrogenase (quinone)  30.22 
 
 
500 aa  192  9e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0955  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.9 
 
 
523 aa  192  9e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00424687  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  29.62 
 
 
673 aa  192  9e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0070  NADH dehydrogenase (quinone)  33.9 
 
 
667 aa  192  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0588  NADH dehydrogenase (quinone)  32.2 
 
 
609 aa  192  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  27.35 
 
 
493 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  30.28 
 
 
672 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  31.44 
 
 
672 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  29.81 
 
 
672 aa  190  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  30.45 
 
 
672 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  30.45 
 
 
672 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2525  NADH dehydrogenase (quinone)  27.42 
 
 
505 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2863  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30 
 
 
498 aa  188  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.845476  normal  0.745609 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0320  NADH dehydrogenase (quinone)  31.66 
 
 
531 aa  188  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  36.23 
 
 
672 aa  188  2e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2708  hydrogenase 4 subunit B  30.7 
 
 
679 aa  188  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0379  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.15 
 
 
605 aa  188  2e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000619684  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2032  NADH dehydrogenase (quinone)  27.25 
 
 
504 aa  187  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  34.4 
 
 
671 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  31.39 
 
 
473 aa  187  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  34.68 
 
 
669 aa  187  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000416  Na(+) H(+) antiporter subunit D  29 
 
 
498 aa  186  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1123  putative NADH dehydrogenase  28.48 
 
 
498 aa  186  8e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0103051  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  28.41 
 
 
649 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.21 
 
 
959 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3530  NADH dehydrogenase (quinone)  33.85 
 
 
470 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1606  NADH dehydrogenase subunit M  29.49 
 
 
626 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0164  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.8 
 
 
538 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0751  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.16 
 
 
501 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00659406  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2858  NADH dehydrogenase (quinone)  29.72 
 
 
504 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.356875  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0314  hydrogenase 4 subunit D  33.85 
 
 
505 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0167658  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  37.88 
 
 
674 aa  183  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2806  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.68 
 
 
997 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3781  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
654 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0217094  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0918  NADH dehydrogenase (quinone)  34.49 
 
 
559 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0742  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.2 
 
 
538 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  27.89 
 
 
480 aa  181  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1599  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.69 
 
 
762 aa  180  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85135  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  31.58 
 
 
662 aa  180  5.999999999999999e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>