More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0669 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3716  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  72.66 
 
 
559 aa  693    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0669  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  100 
 
 
538 aa  1052    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0584  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  71.97 
 
 
535 aa  724    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0164  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  74.19 
 
 
538 aa  754    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0574  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  71.78 
 
 
535 aa  724    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0596  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  71.97 
 
 
535 aa  724    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.395006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0742  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  74.76 
 
 
538 aa  756    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3948  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  56.38 
 
 
545 aa  557  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.147624 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0044  NADH dehydrogenase (quinone)  56.87 
 
 
525 aa  554  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.33239 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0496  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  54.91 
 
 
565 aa  544  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3658  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  55.54 
 
 
562 aa  539  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35440  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  56.2 
 
 
540 aa  538  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.708783 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0210  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  56.61 
 
 
525 aa  521  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.924509  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3871  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  56.08 
 
 
539 aa  523  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2437  NADH dehydrogenase (quinone)  55.01 
 
 
530 aa  513  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.366515 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4892  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  52.67 
 
 
552 aa  510  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.405552  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25180  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  53.03 
 
 
526 aa  489  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0648794  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0348  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  53.48 
 
 
547 aa  486  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0328119  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3816  NADH dehydrogenase (quinone)  55.99 
 
 
509 aa  486  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.818014  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16780  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  51.84 
 
 
525 aa  478  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.234078  normal  0.0837109 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05170  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  53.73 
 
 
521 aa  476  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6653  Na(+)/H(+) antiporter subunit D  50.94 
 
 
529 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18950  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  52.84 
 
 
543 aa  473  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3185  NADH dehydrogenase (quinone)  52.57 
 
 
552 aa  463  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14770  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  47.18 
 
 
510 aa  411  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18278  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4628  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  46.78 
 
 
511 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.47 
 
 
523 aa  401  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0000590255  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2525  NADH dehydrogenase (quinone)  40.19 
 
 
505 aa  340  5e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0077  NADH dehydrogenase (quinone)  38.1 
 
 
500 aa  329  6e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3692  NADH dehydrogenase (quinone)  38.89 
 
 
500 aa  327  4.0000000000000003e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2032  NADH dehydrogenase (quinone)  39.39 
 
 
504 aa  327  5e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  38.29 
 
 
501 aa  322  9.000000000000001e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.156897  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1771  NADH dehydrogenase (quinone)  38.09 
 
 
500 aa  318  1e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0097  NADH dehydrogenase (quinone)  37.81 
 
 
505 aa  317  5e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.988192  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0731  quinone dependent NADH dehydrogenase  40 
 
 
511 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156813  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2858  NADH dehydrogenase (quinone)  38.67 
 
 
504 aa  311  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.356875  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0751  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.64 
 
 
501 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00659406  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000416  Na(+) H(+) antiporter subunit D  36.82 
 
 
498 aa  306  7e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1772  Na(+)/H(+) antiporter subunit D  38.21 
 
 
499 aa  305  2.0000000000000002e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0980  NADH dehydrogenase (quinone)  37.05 
 
 
502 aa  302  1e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.723018  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3221  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.45 
 
 
500 aa  301  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  37.15 
 
 
498 aa  301  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805314  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0403  sodium/proton antiporter protein  36.63 
 
 
499 aa  298  1e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1123  putative NADH dehydrogenase  38.36 
 
 
498 aa  298  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0103051  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2341  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.04 
 
 
504 aa  295  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0867  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  41 
 
 
493 aa  281  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.704502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3534  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  43.31 
 
 
532 aa  272  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2925  NADH dehydrogenase (quinone)  35.88 
 
 
505 aa  269  8e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0483803  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0648  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.37 
 
 
498 aa  260  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0663  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.37 
 
 
498 aa  260  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000080828  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1110  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.92 
 
 
512 aa  259  9e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1431  NADH dehydrogenase (quinone)  40.81 
 
 
498 aa  257  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352854  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1160  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.96 
 
 
495 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2930  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.89 
 
 
519 aa  249  7e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0949  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.33 
 
 
498 aa  249  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0968  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.33 
 
 
498 aa  249  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36.61 
 
 
499 aa  247  3e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0535  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.08 
 
 
498 aa  244  3e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2871  NADH dehydrogenase (quinone)  30.82 
 
 
490 aa  243  6e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2851  NADH dehydrogenase (quinone)  35.7 
 
 
505 aa  243  7.999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1731  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.51 
 
 
505 aa  240  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.494392  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3455  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.39 
 
 
488 aa  239  8e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112327  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.42 
 
 
513 aa  237  3e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3229  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.05 
 
 
488 aa  236  9e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.121013 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1540  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.51 
 
 
540 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.010926 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3984  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.33 
 
 
503 aa  234  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1282  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.64 
 
 
534 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.819493  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0867  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.48 
 
 
519 aa  230  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.335998  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1915  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.24 
 
 
521 aa  229  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0699  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.46 
 
 
530 aa  228  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0230  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36.46 
 
 
503 aa  226  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104393  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3807  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.55 
 
 
506 aa  226  7e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.5869 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2654  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.14 
 
 
503 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0994  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.89 
 
 
503 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.949709  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26950  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  38.49 
 
 
528 aa  220  6e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49502  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1003  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.09 
 
 
517 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00150473  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3717  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36.11 
 
 
539 aa  217  2.9999999999999998e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3816  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.09 
 
 
505 aa  216  8e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19533  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0610  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.45 
 
 
520 aa  210  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1102  NADH dehydrogenase (quinone)  33.95 
 
 
507 aa  209  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.164573  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0877  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.23 
 
 
517 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0349434  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0486  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.6 
 
 
535 aa  204  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1357  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.83 
 
 
503 aa  204  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.726443  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0580  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.14 
 
 
510 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0135154 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2712  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.16 
 
 
574 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2619  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  38.25 
 
 
484 aa  196  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5079  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.04 
 
 
551 aa  194  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.793582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2228  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.98 
 
 
559 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2808  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.39 
 
 
539 aa  194  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.333483 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1128  NADH dehydrogenase (quinone)  31.03 
 
 
540 aa  193  7e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.556203  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1603  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.34 
 
 
568 aa  192  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3254  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.81 
 
 
561 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0445777  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3731  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.46 
 
 
511 aa  192  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.78206  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0674  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.9 
 
 
511 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3855  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.73 
 
 
511 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4614  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.86 
 
 
561 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.354108  hitchhiker  0.00768927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3473  monovalent cation/proton antiporter, MnhD/PhaD subunit  30.24 
 
 
558 aa  190  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11070  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.2 
 
 
556 aa  189  9e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0563  NADH dehydrogenase (quinone)  31.56 
 
 
539 aa  188  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.850315  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1851  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.76 
 
 
559 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.059579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>