More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0486 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0486  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  100 
 
 
535 aa  1019    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2712  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  62.22 
 
 
574 aa  556  1e-157  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0563  NADH dehydrogenase (quinone)  55.6 
 
 
539 aa  496  1e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.850315  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.58 
 
 
513 aa  288  2e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0980  NADH dehydrogenase (quinone)  34.77 
 
 
502 aa  257  4e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.723018  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1771  NADH dehydrogenase (quinone)  32.19 
 
 
500 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2858  NADH dehydrogenase (quinone)  31.34 
 
 
504 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.356875  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3534  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  39.07 
 
 
532 aa  250  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3221  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.83 
 
 
500 aa  250  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2525  NADH dehydrogenase (quinone)  32.21 
 
 
505 aa  249  7e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0077  NADH dehydrogenase (quinone)  33.21 
 
 
500 aa  249  7e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2032  NADH dehydrogenase (quinone)  33.15 
 
 
504 aa  246  8e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1123  putative NADH dehydrogenase  33.02 
 
 
498 aa  246  8e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0103051  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  31.44 
 
 
498 aa  246  8e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805314  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0751  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.18 
 
 
501 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00659406  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  31.19 
 
 
501 aa  243  6e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.156897  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2341  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.42 
 
 
504 aa  243  7e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3692  NADH dehydrogenase (quinone)  30.81 
 
 
500 aa  241  2.9999999999999997e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2871  NADH dehydrogenase (quinone)  32.55 
 
 
490 aa  239  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3948  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.16 
 
 
545 aa  237  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.147624 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35440  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  33.89 
 
 
540 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.708783 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3807  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.56 
 
 
506 aa  231  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.5869 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0044  NADH dehydrogenase (quinone)  34.43 
 
 
525 aa  229  6e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.33239 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0097  NADH dehydrogenase (quinone)  31.01 
 
 
505 aa  229  7e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.988192  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0731  quinone dependent NADH dehydrogenase  32.32 
 
 
511 aa  228  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156813  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000416  Na(+) H(+) antiporter subunit D  32.64 
 
 
498 aa  224  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0210  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.3 
 
 
525 aa  224  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.924509  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1160  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.28 
 
 
495 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1772  Na(+)/H(+) antiporter subunit D  30.65 
 
 
499 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3717  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.79 
 
 
539 aa  220  6e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2925  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
505 aa  219  7e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0483803  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2437  NADH dehydrogenase (quinone)  31.84 
 
 
530 aa  219  7.999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.366515 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3185  NADH dehydrogenase (quinone)  35.33 
 
 
552 aa  218  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0403  sodium/proton antiporter protein  30.33 
 
 
499 aa  217  4e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0496  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.59 
 
 
565 aa  216  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0164  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.38 
 
 
538 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0669  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.41 
 
 
538 aa  214  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2851  NADH dehydrogenase (quinone)  34.03 
 
 
505 aa  214  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0949  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.49 
 
 
498 aa  212  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0968  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.49 
 
 
498 aa  212  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3871  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.27 
 
 
539 aa  212  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0742  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.09 
 
 
538 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3816  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.21 
 
 
505 aa  210  5e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19533  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4892  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.62 
 
 
552 aa  210  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.405552  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3658  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.58 
 
 
562 aa  209  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0230  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35 
 
 
503 aa  207  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104393  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0348  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.89 
 
 
547 aa  206  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0328119  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14770  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.78 
 
 
510 aa  206  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18278  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1102  NADH dehydrogenase (quinone)  38.65 
 
 
507 aa  205  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.164573  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3816  NADH dehydrogenase (quinone)  33.95 
 
 
509 aa  206  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.818014  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0994  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.64 
 
 
503 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.949709  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3455  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36.56 
 
 
488 aa  204  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112327  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3855  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.51 
 
 
511 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0535  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.03 
 
 
498 aa  204  4e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2654  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.02 
 
 
503 aa  203  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1431  NADH dehydrogenase (quinone)  32.02 
 
 
498 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352854  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1357  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.02 
 
 
503 aa  201  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.726443  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18950  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.88 
 
 
543 aa  201  3e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1110  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.39 
 
 
512 aa  199  7.999999999999999e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25180  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  31.19 
 
 
526 aa  199  9e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0648794  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3229  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36.56 
 
 
488 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.121013 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0574  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.64 
 
 
535 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0580  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.14 
 
 
510 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0135154 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1540  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.58 
 
 
540 aa  198  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.010926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0584  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.64 
 
 
535 aa  198  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0596  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.64 
 
 
535 aa  198  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.395006 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3984  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.33 
 
 
503 aa  197  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19550  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.95 
 
 
499 aa  195  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216033  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2808  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.23 
 
 
539 aa  195  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.333483 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50710  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36.54 
 
 
499 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564704 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0674  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.57 
 
 
511 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1128  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
540 aa  194  4e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.556203  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4628  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.37 
 
 
511 aa  194  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0150  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.89 
 
 
511 aa  193  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0867  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.91 
 
 
493 aa  191  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.704502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.85 
 
 
523 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0000590255  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6653  Na(+)/H(+) antiporter subunit D  33.74 
 
 
529 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0495  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.64 
 
 
504 aa  187  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3666  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.06 
 
 
492 aa  186  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.752681  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  33.18 
 
 
493 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0901  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36.4 
 
 
503 aa  184  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2161  NADH dehydrogenase (quinone)  36.07 
 
 
501 aa  184  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0877  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.31 
 
 
517 aa  183  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0349434  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0699  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36.93 
 
 
530 aa  183  8.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3716  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.65 
 
 
559 aa  182  9.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1003  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.42 
 
 
517 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00150473  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.98 
 
 
501 aa  180  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.37012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4731  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.52 
 
 
598 aa  179  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.840154 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4322  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.18 
 
 
499 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891162  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1282  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.02 
 
 
534 aa  179  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.819493  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0867  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.03 
 
 
519 aa  178  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.335998  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3953  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.47 
 
 
492 aa  178  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.06 
 
 
492 aa  177  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.141551  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1443  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.04 
 
 
501 aa  176  7e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0476084  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  29.53 
 
 
499 aa  176  9e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0061  NADH dehydrogenase (quinone)  31.49 
 
 
508 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1603  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.22 
 
 
568 aa  175  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2476  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.87 
 
 
578 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1384  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.27 
 
 
578 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0617713  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2286  NADH dehydrogenase (quinone)  33.69 
 
 
437 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>