More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3716 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0669  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  71.27 
 
 
538 aa  748    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3716  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  100 
 
 
559 aa  1089    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0574  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  70.72 
 
 
535 aa  721    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0164  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  72.24 
 
 
538 aa  749    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0584  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  70.91 
 
 
535 aa  720    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0596  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  70.91 
 
 
535 aa  720    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.395006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0742  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  71.94 
 
 
538 aa  753    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0044  NADH dehydrogenase (quinone)  59.96 
 
 
525 aa  587  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.33239 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3948  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  57.7 
 
 
545 aa  581  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.147624 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35440  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  58.01 
 
 
540 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.708783 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3658  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  58.73 
 
 
562 aa  573  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3871  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  58.52 
 
 
539 aa  569  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0496  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  55.96 
 
 
565 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0210  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  60.83 
 
 
525 aa  560  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.924509  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2437  NADH dehydrogenase (quinone)  57.33 
 
 
530 aa  542  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.366515 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25180  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  52.65 
 
 
526 aa  527  1e-148  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0648794  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4892  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  53.04 
 
 
552 aa  527  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.405552  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3816  NADH dehydrogenase (quinone)  59.81 
 
 
509 aa  518  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.818014  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18950  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  57.14 
 
 
543 aa  509  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0348  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  54.02 
 
 
547 aa  502  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0328119  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16780  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  51.95 
 
 
525 aa  501  1e-140  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.234078  normal  0.0837109 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05170  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  55.87 
 
 
521 aa  499  1e-140  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6653  Na(+)/H(+) antiporter subunit D  52.51 
 
 
529 aa  498  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3185  NADH dehydrogenase (quinone)  55.6 
 
 
552 aa  498  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14770  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  50.2 
 
 
510 aa  437  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18278  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  50.79 
 
 
523 aa  431  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0000590255  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4628  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  48.36 
 
 
511 aa  421  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2525  NADH dehydrogenase (quinone)  41.17 
 
 
505 aa  364  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  39.7 
 
 
501 aa  361  2e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.156897  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2032  NADH dehydrogenase (quinone)  41.25 
 
 
504 aa  358  9.999999999999999e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1771  NADH dehydrogenase (quinone)  40.04 
 
 
500 aa  354  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0077  NADH dehydrogenase (quinone)  37.79 
 
 
500 aa  346  8e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0731  quinone dependent NADH dehydrogenase  40.72 
 
 
511 aa  345  1e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156813  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3692  NADH dehydrogenase (quinone)  38.75 
 
 
500 aa  342  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  39.1 
 
 
498 aa  340  5e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805314  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2858  NADH dehydrogenase (quinone)  39.66 
 
 
504 aa  337  3.9999999999999995e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.356875  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3221  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.02 
 
 
500 aa  336  7.999999999999999e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0751  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.19 
 
 
501 aa  335  9e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00659406  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0980  NADH dehydrogenase (quinone)  38.37 
 
 
502 aa  334  3e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.723018  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1772  Na(+)/H(+) antiporter subunit D  36.84 
 
 
499 aa  332  1e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0097  NADH dehydrogenase (quinone)  37.41 
 
 
505 aa  332  1e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.988192  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0403  sodium/proton antiporter protein  36.45 
 
 
499 aa  325  1e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000416  Na(+) H(+) antiporter subunit D  39.09 
 
 
498 aa  324  3e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1123  putative NADH dehydrogenase  40.19 
 
 
498 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0103051  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2341  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.99 
 
 
504 aa  320  6e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2925  NADH dehydrogenase (quinone)  36.9 
 
 
505 aa  301  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0483803  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0867  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  41.3 
 
 
493 aa  300  6e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.704502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3534  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  43.14 
 
 
532 aa  278  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1110  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  40.9 
 
 
512 aa  270  7e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3229  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.19 
 
 
488 aa  269  8.999999999999999e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.121013 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0648  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.95 
 
 
498 aa  269  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0663  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.95 
 
 
498 aa  269  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000080828  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1160  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.52 
 
 
495 aa  267  4e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1431  NADH dehydrogenase (quinone)  38.51 
 
 
498 aa  265  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352854  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.53 
 
 
499 aa  261  3e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.85 
 
 
513 aa  260  6e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1540  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36.41 
 
 
540 aa  260  6e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.010926 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0535  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.33 
 
 
498 aa  259  9e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3455  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.22 
 
 
488 aa  258  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112327  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2930  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.87 
 
 
519 aa  258  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0968  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36.71 
 
 
498 aa  257  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0949  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36.71 
 
 
498 aa  257  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2871  NADH dehydrogenase (quinone)  32.52 
 
 
490 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0230  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.86 
 
 
503 aa  252  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104393  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2654  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36.92 
 
 
503 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0994  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36.92 
 
 
503 aa  247  4e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.949709  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1282  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.96 
 
 
534 aa  246  6.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.819493  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2851  NADH dehydrogenase (quinone)  33.89 
 
 
505 aa  241  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3984  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.74 
 
 
503 aa  240  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1731  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.67 
 
 
505 aa  239  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.494392  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3807  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.01 
 
 
506 aa  238  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.5869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0867  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36.91 
 
 
519 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.335998  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0699  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36.67 
 
 
530 aa  237  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2712  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.38 
 
 
574 aa  231  3e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1003  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.41 
 
 
517 aa  229  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00150473  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1915  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.86 
 
 
521 aa  227  4e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3717  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.81 
 
 
539 aa  221  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0877  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.03 
 
 
517 aa  221  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0349434  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1102  NADH dehydrogenase (quinone)  35.53 
 
 
507 aa  219  8.999999999999998e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.164573  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0610  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.64 
 
 
520 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26950  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  37.64 
 
 
528 aa  217  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49502  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1357  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.77 
 
 
503 aa  215  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.726443  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3816  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.8 
 
 
505 aa  214  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19533  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3855  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.71 
 
 
511 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1128  NADH dehydrogenase (quinone)  33.18 
 
 
540 aa  206  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.556203  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11070  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.57 
 
 
556 aa  205  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3731  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.37 
 
 
511 aa  205  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.78206  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0563  NADH dehydrogenase (quinone)  31.07 
 
 
539 aa  204  4e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.850315  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0674  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.32 
 
 
511 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2619  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  36.66 
 
 
484 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0580  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.38 
 
 
510 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0135154 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0061  NADH dehydrogenase (quinone)  32.72 
 
 
508 aa  200  7e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0901  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.72 
 
 
503 aa  200  7e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1680  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.82 
 
 
511 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.962527  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1603  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.46 
 
 
568 aa  197  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4731  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.62 
 
 
598 aa  194  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.840154 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4614  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.96 
 
 
561 aa  193  7e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.354108  hitchhiker  0.00768927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0150  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.9 
 
 
511 aa  193  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  30.73 
 
 
499 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5079  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.96 
 
 
551 aa  192  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.793582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>