More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0061 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0061  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
508 aa  986    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1128  NADH dehydrogenase (quinone)  52.89 
 
 
540 aa  498  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.556203  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3807  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.95 
 
 
506 aa  435  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.5869 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3984  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.25 
 
 
503 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0901  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  51.74 
 
 
503 aa  427  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2851  NADH dehydrogenase (quinone)  46.79 
 
 
505 aa  426  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1540  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.11 
 
 
540 aa  423  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.010926 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0580  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  48.27 
 
 
510 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0135154 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1357  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  47.41 
 
 
503 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.726443  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1102  NADH dehydrogenase (quinone)  49.08 
 
 
507 aa  403  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.164573  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0230  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  47 
 
 
503 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104393  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3816  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.77 
 
 
505 aa  400  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19533  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0495  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  50.83 
 
 
504 aa  398  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3717  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.03 
 
 
539 aa  395  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3855  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  47.78 
 
 
511 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0674  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  49.4 
 
 
511 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2654  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.49 
 
 
503 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0994  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.08 
 
 
503 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.949709  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0150  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  48.99 
 
 
511 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19550  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  49.7 
 
 
499 aa  385  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50710  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  52.24 
 
 
499 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564704 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0699  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  43.4 
 
 
530 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4322  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  50.91 
 
 
499 aa  349  6e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891162  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3731  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  44.27 
 
 
511 aa  341  2e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.78206  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04211  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  43.44 
 
 
516 aa  332  9e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2486  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  46.25 
 
 
502 aa  332  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1443  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  47.03 
 
 
501 aa  324  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0476084  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1680  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  43.91 
 
 
511 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.962527  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1851  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.99 
 
 
559 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.059579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2228  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.18 
 
 
559 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3473  monovalent cation/proton antiporter, MnhD/PhaD subunit  39.42 
 
 
558 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.99 
 
 
559 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.260298  normal  0.224731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3512  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.99 
 
 
559 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.523861  hitchhiker  0.00169463 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1603  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  41.54 
 
 
568 aa  308  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3254  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.5 
 
 
561 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0445777  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0502  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.19 
 
 
542 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.321339  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4731  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37 
 
 
598 aa  303  5.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.840154 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0437  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.19 
 
 
542 aa  303  7.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0958706  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1589  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  42.71 
 
 
554 aa  298  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3312  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.7 
 
 
559 aa  296  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2808  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.88 
 
 
539 aa  296  8e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.333483 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1384  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.22 
 
 
578 aa  293  4e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0617713  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2476  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.76 
 
 
578 aa  292  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3533  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.81 
 
 
543 aa  292  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1008  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.8 
 
 
535 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.757465  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2656  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.15 
 
 
535 aa  286  7e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5079  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.64 
 
 
551 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.793582 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3623  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  44.92 
 
 
539 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0168629  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4614  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.07 
 
 
561 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.354108  hitchhiker  0.00768927 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5266  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.2 
 
 
543 aa  281  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3291  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.57 
 
 
601 aa  281  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.433006  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1522  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.74 
 
 
573 aa  280  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0664995  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  35.26 
 
 
501 aa  276  6e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.156897  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2525  NADH dehydrogenase (quinone)  34.26 
 
 
505 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3713  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.53 
 
 
540 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3447  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.53 
 
 
540 aa  273  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.471673 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2858  NADH dehydrogenase (quinone)  35.32 
 
 
504 aa  268  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.356875  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0751  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.53 
 
 
501 aa  266  8e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00659406  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1287  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.45 
 
 
576 aa  264  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.592615  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1771  NADH dehydrogenase (quinone)  35.93 
 
 
500 aa  263  6e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2443  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.31 
 
 
541 aa  261  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.85253  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3130  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.65 
 
 
544 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  36.88 
 
 
498 aa  256  5e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805314  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0032  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.05 
 
 
540 aa  256  5e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0077  NADH dehydrogenase (quinone)  32.34 
 
 
500 aa  256  6e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3907  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.47 
 
 
572 aa  256  9e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0980  NADH dehydrogenase (quinone)  33.14 
 
 
502 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.723018  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1123  putative NADH dehydrogenase  34.52 
 
 
498 aa  254  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0103051  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2032  NADH dehydrogenase (quinone)  34.57 
 
 
504 aa  251  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3692  NADH dehydrogenase (quinone)  33.67 
 
 
500 aa  249  7e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000416  Na(+) H(+) antiporter subunit D  33 
 
 
498 aa  248  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3221  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.38 
 
 
500 aa  248  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5154  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.87 
 
 
534 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.04 
 
 
513 aa  241  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0731  quinone dependent NADH dehydrogenase  34.27 
 
 
511 aa  241  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156813  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1772  Na(+)/H(+) antiporter subunit D  33.61 
 
 
499 aa  236  7e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35440  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  34.74 
 
 
540 aa  233  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.708783 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1160  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.6 
 
 
495 aa  233  6e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0949  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.2 
 
 
498 aa  233  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0968  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.2 
 
 
498 aa  233  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0496  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.12 
 
 
565 aa  232  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3948  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34 
 
 
545 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.147624 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0403  sodium/proton antiporter protein  34.03 
 
 
499 aa  230  4e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25180  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  34.05 
 
 
526 aa  230  5e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0648794  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0164  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.46 
 
 
538 aa  229  7e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2871  NADH dehydrogenase (quinone)  33.13 
 
 
490 aa  229  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3871  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.33 
 
 
539 aa  228  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0535  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.35 
 
 
498 aa  226  6e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0097  NADH dehydrogenase (quinone)  30.47 
 
 
505 aa  226  7e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.988192  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2341  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.3 
 
 
504 aa  224  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2925  NADH dehydrogenase (quinone)  33.4 
 
 
505 aa  222  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0483803  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0742  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.72 
 
 
538 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3658  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.01 
 
 
562 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0210  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.08 
 
 
525 aa  218  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.924509  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0867  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.41 
 
 
493 aa  216  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.704502 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16780  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  31.98 
 
 
525 aa  213  7e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.234078  normal  0.0837109 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2437  NADH dehydrogenase (quinone)  31.72 
 
 
530 aa  213  7.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.366515 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0044  NADH dehydrogenase (quinone)  32.65 
 
 
525 aa  213  9e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.33239 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.79 
 
 
523 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0000590255  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18950  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.54 
 
 
543 aa  212  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>