More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1128 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1128  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
540 aa  1069    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.556203  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0061  NADH dehydrogenase (quinone)  52.89 
 
 
508 aa  449  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3807  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.77 
 
 
506 aa  383  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.5869 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0495  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  51.47 
 
 
504 aa  377  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2654  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  47.58 
 
 
503 aa  365  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0230  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.49 
 
 
503 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104393  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0994  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  47.8 
 
 
503 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.949709  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0674  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.26 
 
 
511 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1540  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  44.11 
 
 
540 aa  361  2e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.010926 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0580  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  49.07 
 
 
510 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0135154 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3717  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  48.73 
 
 
539 aa  356  5.999999999999999e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1357  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  44.54 
 
 
503 aa  355  7.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.726443  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3855  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  44.77 
 
 
511 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0901  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.93 
 
 
503 aa  353  5.9999999999999994e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0150  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.55 
 
 
511 aa  349  7e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3984  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.15 
 
 
503 aa  348  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19550  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  48.61 
 
 
499 aa  340  5.9999999999999996e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216033  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1102  NADH dehydrogenase (quinone)  48.96 
 
 
507 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.164573  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2851  NADH dehydrogenase (quinone)  41.52 
 
 
505 aa  335  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3816  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  41.38 
 
 
505 aa  332  1e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19533  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50710  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  49.1 
 
 
499 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564704 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0699  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.14 
 
 
530 aa  320  3e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04211  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  41.97 
 
 
516 aa  318  1e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3731  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  41.23 
 
 
511 aa  305  2.0000000000000002e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.78206  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4322  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  48.97 
 
 
499 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891162  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2486  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  43.24 
 
 
502 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1680  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.27 
 
 
511 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.962527  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1443  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  42.83 
 
 
501 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0476084  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2228  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.2 
 
 
559 aa  276  9e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3512  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.2 
 
 
559 aa  276  9e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.523861  hitchhiker  0.00169463 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1851  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.92 
 
 
559 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.059579 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.94 
 
 
559 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.260298  normal  0.224731 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1589  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  43.51 
 
 
554 aa  269  8.999999999999999e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1384  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.61 
 
 
578 aa  264  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0617713  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4614  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.41 
 
 
561 aa  263  6e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.354108  hitchhiker  0.00768927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3473  monovalent cation/proton antiporter, MnhD/PhaD subunit  35.5 
 
 
558 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3533  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.96 
 
 
543 aa  262  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5079  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.41 
 
 
551 aa  261  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.793582 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2476  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.39 
 
 
578 aa  261  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2808  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  44.73 
 
 
539 aa  259  6e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.333483 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4731  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.2 
 
 
598 aa  259  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.840154 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3254  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.99 
 
 
561 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0445777  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3312  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.53 
 
 
559 aa  252  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0502  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.73 
 
 
542 aa  251  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.321339  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2858  NADH dehydrogenase (quinone)  36.65 
 
 
504 aa  250  5e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.356875  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1287  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36.11 
 
 
576 aa  249  9e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.592615  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0437  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.52 
 
 
542 aa  249  9e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0958706  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1603  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.88 
 
 
568 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3130  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.05 
 
 
544 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5266  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  41.49 
 
 
543 aa  247  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1008  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  43.17 
 
 
535 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.757465  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1522  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.4 
 
 
573 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0664995  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3623  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.58 
 
 
539 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0168629  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2525  NADH dehydrogenase (quinone)  34.66 
 
 
505 aa  242  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2656  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.69 
 
 
535 aa  240  4e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3447  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  42.03 
 
 
540 aa  240  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.471673 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  32.97 
 
 
501 aa  239  5.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.156897  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3291  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.04 
 
 
601 aa  238  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.433006  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3713  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  41.8 
 
 
540 aa  236  7e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3907  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.32 
 
 
572 aa  236  7e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5154  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.74 
 
 
534 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3692  NADH dehydrogenase (quinone)  37.03 
 
 
500 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0077  NADH dehydrogenase (quinone)  31.49 
 
 
500 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1771  NADH dehydrogenase (quinone)  33.69 
 
 
500 aa  229  9e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0496  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.99 
 
 
565 aa  228  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0751  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.86 
 
 
501 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00659406  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0032  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.14 
 
 
540 aa  228  2e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000416  Na(+) H(+) antiporter subunit D  32.68 
 
 
498 aa  226  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0980  NADH dehydrogenase (quinone)  31.92 
 
 
502 aa  225  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.723018  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0210  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.35 
 
 
525 aa  223  8e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.924509  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1123  putative NADH dehydrogenase  34.3 
 
 
498 aa  223  8e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0103051  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2443  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.82 
 
 
541 aa  222  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.85253  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2871  NADH dehydrogenase (quinone)  36.29 
 
 
490 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3948  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.66 
 
 
545 aa  219  7.999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.147624 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2032  NADH dehydrogenase (quinone)  32.55 
 
 
504 aa  218  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1772  Na(+)/H(+) antiporter subunit D  31.52 
 
 
499 aa  217  4e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  34.42 
 
 
498 aa  217  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805314  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3658  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.91 
 
 
562 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16780  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  34.65 
 
 
525 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.234078  normal  0.0837109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3871  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.86 
 
 
539 aa  215  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0403  sodium/proton antiporter protein  31.73 
 
 
499 aa  211  3e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0348  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.31 
 
 
547 aa  210  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0328119  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18950  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36.96 
 
 
543 aa  209  7e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1431  NADH dehydrogenase (quinone)  34.72 
 
 
498 aa  208  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352854  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0044  NADH dehydrogenase (quinone)  33.63 
 
 
525 aa  207  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.33239 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0097  NADH dehydrogenase (quinone)  32.59 
 
 
505 aa  207  5e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.988192  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.76 
 
 
523 aa  207  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0000590255  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3534  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.11 
 
 
532 aa  206  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0949  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.57 
 
 
498 aa  205  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0968  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.57 
 
 
498 aa  205  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0867  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  39.6 
 
 
493 aa  204  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.704502 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0731  quinone dependent NADH dehydrogenase  36.26 
 
 
511 aa  203  8e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156813  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1110  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.99 
 
 
512 aa  203  8e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2341  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.51 
 
 
504 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3221  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.53 
 
 
500 aa  201  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2925  NADH dehydrogenase (quinone)  33.94 
 
 
505 aa  200  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0483803  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4892  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.11 
 
 
552 aa  200  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.405552  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0574  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.51 
 
 
535 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34 
 
 
513 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0584  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.51 
 
 
535 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>