More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0671 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0671  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  100 
 
 
525 aa  1041    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  59.46 
 
 
522 aa  620  1e-176  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0955  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  59.35 
 
 
523 aa  590  1e-167  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00424687  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4834  NADH dehydrogenase (quinone)  32.05 
 
 
585 aa  233  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.6 
 
 
513 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3666  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.35 
 
 
492 aa  221  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.752681  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3953  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.15 
 
 
492 aa  221  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.79 
 
 
501 aa  210  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.37012 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.14 
 
 
492 aa  210  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.141551  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  32 
 
 
673 aa  209  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  31.67 
 
 
500 aa  204  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  34.03 
 
 
671 aa  204  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  28.82 
 
 
499 aa  200  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0380  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.7 
 
 
472 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000595488  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  30.24 
 
 
748 aa  196  6e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0315  NADH dehydrogenase (quinone)  36.87 
 
 
674 aa  196  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39787  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  31.64 
 
 
501 aa  195  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.156897  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1123  putative NADH dehydrogenase  31.46 
 
 
498 aa  195  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0103051  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3221  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.98 
 
 
500 aa  195  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2525  NADH dehydrogenase (quinone)  30.1 
 
 
505 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0890  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.99 
 
 
507 aa  194  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50733  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0588  NADH dehydrogenase (quinone)  34.75 
 
 
609 aa  192  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  32.41 
 
 
672 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.38 
 
 
790 aa  188  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0917  NADH dehydrogenase (quinone)  28.65 
 
 
486 aa  186  9e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.958268  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000416  Na(+) H(+) antiporter subunit D  30.51 
 
 
498 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  34.11 
 
 
473 aa  183  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2708  hydrogenase 4 subunit B  32.6 
 
 
679 aa  183  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2223  NADH dehydrogenase (quinone)  31.16 
 
 
496 aa  183  7e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3531  NADH dehydrogenase (quinone)  34.66 
 
 
610 aa  183  7e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  31.94 
 
 
673 aa  183  8.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2032  NADH dehydrogenase (quinone)  31.66 
 
 
504 aa  182  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2858  NADH dehydrogenase (quinone)  30.92 
 
 
504 aa  182  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.356875  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0538  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.62 
 
 
801 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1136  NADH dehydrogenase (quinone)  32.51 
 
 
476 aa  181  4e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1781  hydrogenase subunit F  33.74 
 
 
482 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1042  hydrogenase subunit F  33.74 
 
 
482 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1635  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.81 
 
 
502 aa  179  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193581  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0875  hydrogenase subunit F  34.15 
 
 
482 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00115046 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1673  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.75 
 
 
604 aa  177  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2161  NADH dehydrogenase (quinone)  29.13 
 
 
501 aa  177  5e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  31.18 
 
 
498 aa  177  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805314  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1606  NADH dehydrogenase subunit M  29.91 
 
 
626 aa  176  9e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  30.8 
 
 
683 aa  176  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1420  NADH dehydrogenase (quinone)  31.44 
 
 
1265 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0132  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.98 
 
 
788 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0070  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
667 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0320  NADH dehydrogenase (quinone)  31.08 
 
 
531 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3530  NADH dehydrogenase (quinone)  30.89 
 
 
470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2712  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.38 
 
 
574 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2925  NADH dehydrogenase (quinone)  32.66 
 
 
505 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0483803  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  29.07 
 
 
672 aa  172  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1217  NADH dehydrogenase subunit M  32.15 
 
 
614 aa  172  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3781  NADH dehydrogenase (quinone)  33.04 
 
 
654 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0217094  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1771  NADH dehydrogenase (quinone)  30.96 
 
 
500 aa  172  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  31.38 
 
 
1264 aa  171  4e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0379  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.44 
 
 
605 aa  170  6e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000619684  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  32.5 
 
 
1253 aa  170  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0218073 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  29.78 
 
 
672 aa  170  7e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1741  NADH dehydrogenase subunit M  29.7 
 
 
604 aa  170  7e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.56797  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3197  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.6 
 
 
666 aa  169  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  29.41 
 
 
662 aa  169  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  28.86 
 
 
672 aa  169  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2286  NADH dehydrogenase (quinone)  30.98 
 
 
437 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12060  NADH dehydrogenase I subunit L  28.89 
 
 
506 aa  169  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000252399  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0980  NADH dehydrogenase (quinone)  31.7 
 
 
502 aa  169  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.723018  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2616  NADH dehydrogenase (quinone)  30.35 
 
 
577 aa  168  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0097  NADH dehydrogenase (quinone)  30.16 
 
 
505 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.988192  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  29.45 
 
 
672 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1822  hydrogenase membrane subunit  31.14 
 
 
643 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0165692  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1065  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.79 
 
 
666 aa  167  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.82932e-25 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  29.37 
 
 
672 aa  167  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3692  NADH dehydrogenase (quinone)  28 
 
 
500 aa  167  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  29.37 
 
 
672 aa  167  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2855  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.32 
 
 
769 aa  166  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  32.63 
 
 
669 aa  166  9e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1107  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.52 
 
 
488 aa  166  1.0000000000000001e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.980044  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  32.47 
 
 
1265 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  31.55 
 
 
737 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0890  NADH dehydrogenase subunit M  30.52 
 
 
613 aa  165  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.514114  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  26.75 
 
 
480 aa  164  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0563  NADH dehydrogenase (quinone)  31.6 
 
 
539 aa  164  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.850315  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0937  hydrogenase subunit F  34.16 
 
 
482 aa  164  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.86 
 
 
628 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.74 
 
 
523 aa  164  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0000590255  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1321  hydrogenase membrane subunit  28.54 
 
 
644 aa  163  6e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0742  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.79 
 
 
538 aa  163  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0734  NAD-dependent dehydrogenase subunit  36.86 
 
 
668 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0393018  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  27.87 
 
 
644 aa  163  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0731  quinone dependent NADH dehydrogenase  31.46 
 
 
511 aa  163  9e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156813  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  30.54 
 
 
662 aa  163  9e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1353  hydrogenase subunit F  33.41 
 
 
481 aa  162  1e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.178859  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1575  hydrogenase membrane subunit  29.04 
 
 
617 aa  161  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1772  Na(+)/H(+) antiporter subunit D  29.01 
 
 
499 aa  162  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0132  hydrogenase 4 membrane subunit  30.41 
 
 
650 aa  162  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.167866  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0077  NADH dehydrogenase (quinone)  29.29 
 
 
500 aa  161  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0751  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.29 
 
 
501 aa  161  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00659406  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1791  ATP-binding protein  28.79 
 
 
655 aa  159  9e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0608774  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0164  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.69 
 
 
538 aa  159  9e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.74 
 
 
661 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>