More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1822 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1822  hydrogenase membrane subunit  100 
 
 		 643 aa  1266    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0165692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  48.29 
 
 		 649 aa  540  9.999999999999999e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1321  hydrogenase membrane subunit  43.4 
 
 		 644 aa  481  1e-134  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  40.9 
 
 		 644 aa  463  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1575  hydrogenase membrane subunit  43.88 
 
 		 617 aa  442  1e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  36.82 
 
 		 673 aa  327  3e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  37.85 
 
 		 683 aa  327  3e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.61 
 
 		 661 aa  319  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  33.45 
 
 		 669 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0375  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.59 
 
 		 669 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.044448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1691  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.96 
 
 		 688 aa  300  4e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000143823  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0892  NADH dehydrogenase (quinone)  33.39 
 
 		 669 aa  298  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  35.54 
 
 		 662 aa  296  7e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4288  NADH dehydrogenase (quinone)  34.72 
 
 		 637 aa  296  8e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277072  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  31.82 
 
 		 673 aa  296  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0943  NADH dehydrogenase (quinone)  33.77 
 
 		 723 aa  294  4e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.730208  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0734  NAD-dependent dehydrogenase subunit  34.72 
 
 		 668 aa  291  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0393018  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  35.04 
 
 		 674 aa  290  7e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  33.79 
 
 		 672 aa  290  8e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0070  NADH dehydrogenase (quinone)  33.61 
 
 		 667 aa  289  9e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1142  hydrogenase 4 subunit B  32.34 
 
 		 748 aa  286  9e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.239539  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4671  hydrogenase 4 subunit B  34.43 
 
 		 674 aa  283  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2708  hydrogenase 4 subunit B  32.2 
 
 		 679 aa  284  5.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  33.22 
 
 		 671 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3292  hydrogenase 4 subunit B  34.11 
 
 		 674 aa  278  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1069  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.9 
 
 		 659 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7000400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  32.95 
 
 		 662 aa  275  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1065  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.77 
 
 		 666 aa  273  6e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.82932e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3193  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.62 
 
 		 659 aa  273  8.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.141056  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2616  NADH dehydrogenase (quinone)  34.64 
 
 		 577 aa  271  4e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  30.96 
 
 		 672 aa  270  8e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  30.83 
 
 		 672 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3197  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.55 
 
 		 666 aa  268  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  30.79 
 
 		 672 aa  267  5e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  31.29 
 
 		 672 aa  266  7e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0739  NAD-dependent dehydrogenase subunit  33.08 
 
 		 661 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188084  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1791  ATP-binding protein  31.78 
 
 		 655 aa  266  1e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0608774  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  31.13 
 
 		 672 aa  264  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  31.13 
 
 		 672 aa  264  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0329  hydrogenase 4 subunit B  31.85 
 
 		 669 aa  265  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1307  NADH dehydrogenase (quinone)  31.52 
 
 		 633 aa  263  6e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0179  hydrogenase 4 subunit B  32.94 
 
 		 669 aa  261  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.987712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1914  L-alanyl-D-glutamate peptidase  31.21 
 
 		 655 aa  261  3e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2618  NADH dehydrogenase (quinone)  33.16 
 
 		 646 aa  261  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.430528  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2560  NADH dehydrogenase (quinone)  34.15 
 
 		 663 aa  259  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4703  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.88 
 
 		 662 aa  258  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4469  NADH dehydrogenase (quinone)  35.84 
 
 		 664 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3655  NADH dehydrogenase (quinone)  39.29 
 
 		 654 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0270969  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2601  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.72 
 
 		 660 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0929  hydrogenase 4 subunit B  35.58 
 
 		 687 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2985  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.44 
 
 		 674 aa  253  7e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0690807  hitchhiker  0.0074409 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6065  hydrogenase 4 subunit B  31.32 
 
 		 669 aa  250  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388772  hitchhiker  0.000500664 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2558  NADH dehydrogenase (quinone)  32.27 
 
 		 666 aa  249  9e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1261  hydrogenase 4 subunit B  31.26 
 
 		 668 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3855  hydrogenase 4 subunit B  33.21 
 
 		 672 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0132  hydrogenase 4 membrane subunit  28.82 
 
 		 650 aa  244  3e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.167866  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2474  hydrogenase 4 subunit B  32.89 
 
 		 669 aa  243  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10084  oxidoreductase  38.48 
 
 		 640 aa  241  4e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  normal  0.170471 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1260  hydrogenase 4 subunit B  34.34 
 
 		 672 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0751084 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1617  hydrogenase 4 subunit B  32.24 
 
 		 668 aa  239  9e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1532  hydrogenase 4 subunit B  32.24 
 
 		 668 aa  239  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3713  NADH dehydrogenase (quinone)  39.29 
 
 		 654 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.117424  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3796  NADH dehydrogenase (quinone)  38.52 
 
 		 654 aa  233  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273036  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0336  NADH dehydrogenase (quinone)  32.57 
 
 		 665 aa  233  7.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  36.27 
 
 		 737 aa  231  3e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1807  hydrogenase 4 subunit B  34.3 
 
 		 660 aa  230  7e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.370569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2149  hydrogenase 4 subunit B  34.3 
 
 		 660 aa  230  7e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.33721  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1396  hydrogenase 4 subunit B  32.29 
 
 		 671 aa  229  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0166  hydrogenase 4 subunit B  31.63 
 
 		 681 aa  228  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1862  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.6 
 
 		 646 aa  224  4e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000307213  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0315  NADH dehydrogenase (quinone)  31.06 
 
 		 674 aa  220  7.999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39787  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0778  NADH dehydrogenase (quinone)  31.4 
 
 		 682 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.590886  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3654  NADH dehydrogenase (quinone)  37.78 
 
 		 665 aa  214  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3795  NADH dehydrogenase (quinone)  37.53 
 
 		 666 aa  212  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3712  NADH dehydrogenase (quinone)  37.02 
 
 		 666 aa  209  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.753561  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3276  NADH dehydrogenase (quinone)  31.19 
 
 		 671 aa  200  7e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.36 
 
 		 522 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  33.05 
 
 		 1264 aa  178  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2787  NADH dehydrogenase (quinone)  30.14 
 
 		 633 aa  178  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2795  NADH dehydrogenase (quinone)  30.14 
 
 		 633 aa  178  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3780  NADH dehydrogenase (quinone)  31.13 
 
 		 670 aa  176  9e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0116247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1768  NADH dehydrogenase (quinone)  32.17 
 
 		 792 aa  170  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0671  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.07 
 
 		 525 aa  168  2.9999999999999998e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.42 
 
 		 656 aa  167  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.98 
 
 		 790 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  32.59 
 
 		 1253 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0218073 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0284  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  33.59 
 
 		 517 aa  162  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000106102 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1433  NADH dehydrogenase (quinone)  32.04 
 
 		 906 aa  161  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.548118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  31.54 
 
 		 748 aa  160  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3974  formate hydrogenlyase subunit 3  28.6 
 
 		 608 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3405  NADH dehydrogenase subunit L  31.69 
 
 		 617 aa  160  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02573  NADH dehydrogenase subunit N  28.6 
 
 		 608 aa  159  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.621394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0966  NADH dehydrogenase (quinone)  28.6 
 
 		 608 aa  159  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3011  formate hydrogenlyase subunit 3  28.6 
 
 		 608 aa  159  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  33.13 
 
 		 620 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2859  formate hydrogenlyase subunit 3  28.6 
 
 		 608 aa  159  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0989  formate hydrogenlyase subunit 3  28.6 
 
 		 608 aa  159  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.180245 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2848  formate hydrogenlyase subunit 3  28.6 
 
 		 608 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264273 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0538  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.52 
 
 		 801 aa  157  7e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4571  hydrogenase 4 subunit F  31.73 
 
 		 512 aa  157  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>