More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0180 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0180  hydrogenase 4 subunit D  100 
 
 
457 aa  912    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210029  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2187  hydrogenase 4 subunit D  47.52 
 
 
480 aa  356  3.9999999999999996e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.562518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4573  hydrogenase 4 subunit D  45.43 
 
 
479 aa  346  5e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1185  NADH dehydrogenase (quinone)  45.26 
 
 
479 aa  335  1e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02376  hydrogenase 4 membrane subunit  45.26 
 
 
449 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2631  hydrogenase 4 subunit D  45.01 
 
 
479 aa  334  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.960654  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1192  hydrogenase 4 subunit D  45.26 
 
 
450 aa  334  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3706  hydrogenase 4 subunit D  44.77 
 
 
479 aa  331  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.897531  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2710  hydrogenase 4 subunit D  45.37 
 
 
479 aa  331  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1283  hydrogenase 4 subunit D  43.27 
 
 
479 aa  330  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0280034  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00960  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  43.45 
 
 
484 aa  322  7e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0314  hydrogenase 4 subunit D  39.36 
 
 
505 aa  271  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0167658  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0645  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.4 
 
 
800 aa  181  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0660  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.4 
 
 
800 aa  181  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0122576  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  31.25 
 
 
480 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3532  NADH dehydrogenase (quinone)  31.22 
 
 
480 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0985  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.88 
 
 
624 aa  180  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0132  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.57 
 
 
788 aa  180  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  31.9 
 
 
620 aa  179  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.13 
 
 
656 aa  178  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1076  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.42 
 
 
553 aa  178  2e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.031536  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3695  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.24 
 
 
782 aa  177  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.983526 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1138  NADH dehydrogenase (quinone)  33.59 
 
 
470 aa  177  3e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0639  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.06 
 
 
639 aa  176  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1634  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.06 
 
 
639 aa  176  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3182  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.06 
 
 
639 aa  176  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.63 
 
 
654 aa  176  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  33.59 
 
 
654 aa  173  5e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.78 
 
 
969 aa  173  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0074  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.48 
 
 
765 aa  173  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_802  NADH:quinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)  33.59 
 
 
654 aa  173  5e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2220  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.78 
 
 
627 aa  172  9e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5534  NADH dehydrogenase subunit L  33.25 
 
 
604 aa  172  9e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0676  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.41 
 
 
958 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.685359  normal  0.485202 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5142  NADH dehydrogenase subunit L  33.25 
 
 
620 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3805  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.73 
 
 
969 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.761799 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.9 
 
 
800 aa  171  3e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.305042  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4974  NADH dehydrogenase subunit L  33.02 
 
 
620 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4992  NADH dehydrogenase subunit L  33.02 
 
 
620 aa  171  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.46 
 
 
628 aa  171  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.06 
 
 
959 aa  171  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.84 
 
 
966 aa  170  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.041044 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5383  NADH dehydrogenase subunit L  32.78 
 
 
620 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.0362e-16 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0148  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.75 
 
 
961 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525301  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5413  NADH dehydrogenase subunit L  32.38 
 
 
620 aa  169  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0870  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.78 
 
 
775 aa  169  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.867337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1768  NADH dehydrogenase (quinone)  34.06 
 
 
792 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2090  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.6 
 
 
770 aa  169  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.26 
 
 
790 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5269  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.5 
 
 
967 aa  168  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5417  NADH dehydrogenase subunit L  31.83 
 
 
620 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5468  NADH dehydrogenase subunit L  31.67 
 
 
620 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5090  NADH dehydrogenase subunit L  31.59 
 
 
620 aa  167  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0400  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.86 
 
 
768 aa  167  5e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3293  NADH dehydrogenase subunit L  31.89 
 
 
617 aa  167  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3128  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.58 
 
 
975 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1775  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.86 
 
 
768 aa  166  6.9999999999999995e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.671135  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2529  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.52 
 
 
766 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.997639  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0094  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.24 
 
 
765 aa  166  6.9999999999999995e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.527296  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3531  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.17 
 
 
971 aa  166  9e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1591  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.26 
 
 
1024 aa  166  9e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156246  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1100  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.65 
 
 
953 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0546017  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0192  NADH dehydrogenase subunit L  30.79 
 
 
610 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14740  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  37.63 
 
 
796 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413195  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1553  NADH dehydrogenase subunit L  32.24 
 
 
596 aa  164  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00128293  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1538  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.8 
 
 
953 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0483  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.68 
 
 
798 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.514379 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1386  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.91 
 
 
984 aa  163  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0924669  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1606  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.52 
 
 
610 aa  163  7e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.483904  normal  0.915409 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.07 
 
 
952 aa  163  7e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2855  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.73 
 
 
769 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2474  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.91 
 
 
984 aa  162  9e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.585409  normal  0.405301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4380  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.66 
 
 
698 aa  162  9e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3218  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.46 
 
 
767 aa  162  9e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3625  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.25 
 
 
962 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2922  NADH dehydrogenase (quinone)  35.37 
 
 
790 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.529423  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1739  NADH dehydrogenase subunit L  32.24 
 
 
596 aa  161  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.409991  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2035  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.84 
 
 
772 aa  161  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1112  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.69 
 
 
911 aa  160  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.726371  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0500  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.17 
 
 
972 aa  160  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438717  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0497  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.25 
 
 
931 aa  160  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.999924 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1010  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.41 
 
 
978 aa  160  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246067  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0435  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.17 
 
 
970 aa  160  4e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.305696  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07490  NADH dehydrogenase subunit L  34.87 
 
 
641 aa  160  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0146936 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2966  NADH dehydrogenase (quinone)  31.67 
 
 
501 aa  160  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.278298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5214  NADH dehydrogenase (quinone)  38.39 
 
 
980 aa  160  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282248  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.87 
 
 
623 aa  160  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.32 
 
 
958 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.84 
 
 
943 aa  159  7e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0538  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.57 
 
 
801 aa  159  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2654  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.58 
 
 
980 aa  159  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0167  NADH-quinone oxidoreductase chain l  30.77 
 
 
603 aa  159  1e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3982  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.92 
 
 
932 aa  158  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.728427 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  31.19 
 
 
500 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3405  NADH dehydrogenase subunit L  31.5 
 
 
617 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0475  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.13 
 
 
622 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.230809 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0607  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.18 
 
 
791 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1000  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.33 
 
 
785 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0697  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.46 
 
 
946 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.156614  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0030  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.69 
 
 
973 aa  157  3e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>