More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2710 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1185  NADH dehydrogenase (quinone)  70.15 
 
 		 479 aa  671    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3706  hydrogenase 4 subunit D  69.73 
 
 		 479 aa  667    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.897531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2710  hydrogenase 4 subunit D  100 
 
 		 479 aa  947    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2631  hydrogenase 4 subunit D  69.73 
 
 		 479 aa  668    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.960654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1283  hydrogenase 4 subunit D  92.28 
 
 		 479 aa  860    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0280034  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02376  hydrogenase 4 membrane subunit  71.08 
 
 		 449 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1192  hydrogenase 4 subunit D  70.92 
 
 		 450 aa  634  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4573  hydrogenase 4 subunit D  64.02 
 
 		 479 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2187  hydrogenase 4 subunit D  57.83 
 
 		 480 aa  520  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.562518 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00960  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  54.58 
 
 		 484 aa  504  9.999999999999999e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0180  hydrogenase 4 subunit D  45.37 
 
 		 457 aa  331  2e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210029  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0314  hydrogenase 4 subunit D  42.37 
 
 		 505 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0167658  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  35.02 
 
 		 654 aa  205  1e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_802  NADH:quinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)  35.02 
 
 		 654 aa  206  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.17 
 
 		 654 aa  206  1e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0560  NADH dehydrogenase (quinone)  34.01 
 
 		 801 aa  204  2e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.640167  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2557  NADH dehydrogenase subunit L  32.65 
 
 		 613 aa  202  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.996088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2664  NADH dehydrogenase subunit L  32.65 
 
 		 613 aa  202  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2502  NADH dehydrogenase subunit L  32.65 
 
 		 613 aa  202  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2546  NADH dehydrogenase subunit L  32.78 
 
 		 611 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2457  NADH dehydrogenase subunit L  32.78 
 
 		 611 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02203  NADH dehydrogenase subunit L  32.44 
 
 		 613 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.705855  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1379  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.44 
 
 		 613 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.285953  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1374  NADH dehydrogenase subunit L  32.44 
 
 		 613 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02163  hypothetical protein  32.44 
 
 		 613 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.560332  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.79 
 
 		 656 aa  200  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2822  NADH dehydrogenase subunit L  32.44 
 
 		 613 aa  200  6e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2427  NADH dehydrogenase subunit L  32.44 
 
 		 613 aa  199  6e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3417  NADH dehydrogenase subunit L  32.57 
 
 		 611 aa  199  7e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2571  NADH dehydrogenase subunit L  32.44 
 
 		 613 aa  199  7e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1076  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.16 
 
 		 553 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.031536  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2432  NADH dehydrogenase subunit L  32.57 
 
 		 611 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2654  NADH dehydrogenase subunit L  32.23 
 
 		 613 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  35.21 
 
 		 620 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.75 
 
 		 628 aa  195  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5090  NADH dehydrogenase subunit L  34.98 
 
 		 620 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0132  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.64 
 
 		 788 aa  195  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  34.65 
 
 		 480 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3532  NADH dehydrogenase (quinone)  32.52 
 
 		 480 aa  195  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.12 
 
 		 642 aa  193  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  33.09 
 
 		 636 aa  193  6e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.33 
 
 		 790 aa  193  7e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1138  NADH dehydrogenase (quinone)  36.19 
 
 		 470 aa  192  9e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3898  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.19 
 
 		 639 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.91 
 
 		 969 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0639  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.6 
 
 		 639 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1634  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.6 
 
 		 639 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3182  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.6 
 
 		 639 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0150  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  33.56 
 
 		 695 aa  191  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.949191  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0864  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.59 
 
 		 781 aa  189  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1606  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.89 
 
 		 610 aa  189  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.483904  normal  0.915409 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5413  NADH dehydrogenase subunit L  34.98 
 
 		 620 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1746  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  33.79 
 
 		 696 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.275907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0985  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.7 
 
 		 624 aa  188  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0660  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  31.66 
 
 		 687 aa  188  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5468  NADH dehydrogenase subunit L  34.74 
 
 		 620 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1739  NADH dehydrogenase subunit L  33.25 
 
 		 596 aa  186  6e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.409991  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.93 
 
 		 645 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.062647  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5417  NADH dehydrogenase subunit L  34.04 
 
 		 620 aa  186  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1919  NADH dehydrogenase subunit L  33.5 
 
 		 596 aa  186  7e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0146018  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0483  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.96 
 
 		 798 aa  186  8e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.514379 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.43 
 
 		 634 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1553  NADH dehydrogenase subunit L  33.25 
 
 		 596 aa  185  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00128293  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0676  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.1 
 
 		 958 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.685359  normal  0.485202 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3695  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.01 
 
 		 782 aa  184  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.983526 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4974  NADH dehydrogenase subunit L  34.98 
 
 		 620 aa  183  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3811  NADH dehydrogenase subunit L  33.04 
 
 		 620 aa  183  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.85 
 
 		 630 aa  182  9.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4992  NADH dehydrogenase subunit L  34.74 
 
 		 620 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.43 
 
 		 642 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4492  NADH dehydrogenase subunit L  36.2 
 
 		 638 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.655452  normal  0.47705 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5383  NADH dehydrogenase subunit L  34.74 
 
 		 620 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.0362e-16 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1768  NADH dehydrogenase (quinone)  33.42 
 
 		 792 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0751  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  32.74 
 
 		 768 aa  181  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75438  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5142  NADH dehydrogenase subunit L  34.74 
 
 		 620 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5534  NADH dehydrogenase subunit L  34.27 
 
 		 604 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.42 
 
 		 710 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3252  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.89 
 
 		 972 aa  181  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.33 
 
 		 966 aa  179  8e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.041044 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2540  NADH dehydrogenase subunit L  35.6 
 
 		 616 aa  179  8e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4156  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.25 
 
 		 676 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0322847 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2874  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.78 
 
 		 799 aa  179  9e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2102  NADH dehydrogenase (quinone)  33.84 
 
 		 793 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3293  NADH dehydrogenase subunit L  35.53 
 
 		 617 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1502  NADH dehydrogenase subunit L  35.31 
 
 		 616 aa  179  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0148  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.31 
 
 		 961 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3405  NADH dehydrogenase subunit L  34.39 
 
 		 617 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0903  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.78 
 
 		 932 aa  179  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0217477  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3471  monovalent cation:proton antiporter, putative  35.67 
 
 		 972 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.665295  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1570  NADH dehydrogenase subunit L  35.14 
 
 		 614 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0400  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.63 
 
 		 768 aa  178  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1775  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.63 
 
 		 768 aa  178  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.671135  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1464  NADH dehydrogenase subunit L  35.14 
 
 		 614 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1806  NADH dehydrogenase subunit L  35.14 
 
 		 614 aa  178  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.503368 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0475  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.43 
 
 		 622 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230809 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2762  NADH dehydrogenase subunit L  32.95 
 
 		 615 aa  177  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4129  NADH dehydrogenase subunit L  33.02 
 
 		 617 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0538  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.57 
 
 		 801 aa  177  4e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1160  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.96 
 
 		 671 aa  177  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0852  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.07 
 
 		 770 aa  177  4e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.826241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>