230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0155 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0155  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 686 aa  1330    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91616  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2821  Rhs element protein VgrE  27.17 
 
 		 690 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0028  Rhs element Vgr protein  26.06 
 
 		 1207 aa  104  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.645983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0023  Rhs element Vgr protein  24.53 
 
 		 1041 aa  103  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2822  putative Rhs element protein, VgrG-like  24.32 
 
 		 789 aa  99  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3254  type VI secretion system Vgr family protein  28.03 
 
 		 787 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  24.37 
 
 		 619 aa  96.7  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3130  type VI secretion system Vgr family protein  25.1 
 
 		 835 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3533  type VI secretion system Vgr family protein  22.17 
 
 		 725 aa  94.4  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1790  Rhs element Vgr protein  25.64 
 
 		 792 aa  91.7  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0154  hypothetical protein  30.34 
 
 		 649 aa  90.9  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3651  Rhs element Vgr protein  23.17 
 
 		 779 aa  90.5  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.982905 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0169  hypothetical protein  25.6 
 
 		 782 aa  89.7  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232253 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0733  type VI secretion system family protein  25.6 
 
 		 782 aa  89.7  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  23.15 
 
 		 1017 aa  88.2  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2504  Rhs element Vgr protein  25.81 
 
 		 782 aa  87  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0785  Rhs element Vgr protein  25.48 
 
 		 832 aa  86.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0788  Rhs element Vgr protein  25.27 
 
 		 900 aa  86.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1212  Rhs element Vgr protein  20.84 
 
 		 699 aa  86.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2983  Rhs element Vgr protein  25.81 
 
 		 782 aa  86.3  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.389792  hitchhiker  0.000144528 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1234  Vgr family type VI secretion system  24.5 
 
 		 704 aa  85.9  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2032  Rhs element Vgr protein  27.09 
 
 		 1007 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0863  Rhs element Vgr protein  26.48 
 
 		 1012 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201208  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0251  type VI secretion system Vgr family protein  22.34 
 
 		 713 aa  84  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830075 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2130  Rhs element Vgr protein  26.88 
 
 		 1007 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0805  type VI secretion system Vgr family protein  25.16 
 
 		 782 aa  83.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.637165  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0737  Rhs element Vgr protein  27.33 
 
 		 1007 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0541  Rhs element Vgr protein  29.54 
 
 		 1007 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1680  Rhs element Vgr protein  27.33 
 
 		 1007 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0611  Rhs element Vgr protein  27.33 
 
 		 1007 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0583244  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0722  Rhs element Vgr protein  27.33 
 
 		 1007 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0115  vgrG protein  23.57 
 
 		 694 aa  81.6  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0179  Rhs element Vgr protein  23.41 
 
 		 783 aa  82  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.109522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0626  Rhs element Vgr protein  24.89 
 
 		 889 aa  81.3  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.160391 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1183  Rhs element Vgr protein  21.09 
 
 		 694 aa  81.3  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1114  type VI secretion system Vgr family protein  24.16 
 
 		 713 aa  80.5  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0243  type VI secretion system Vgr family protein  21.94 
 
 		 713 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0245  type VI secretion system Vgr family protein  22.87 
 
 		 713 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1194  Rhs element Vgr protein  21.65 
 
 		 655 aa  79.3  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3719  Rhs element Vgr protein  23.95 
 
 		 723 aa  79  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2202  type VI secretion system Vgr family protein  22.94 
 
 		 702 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0264417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  22.32 
 
 		 741 aa  78.2  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  22.32 
 
 		 741 aa  77.8  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1638  type VI secretion system Vgr family protein  22.94 
 
 		 702 aa  77.4  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.674786  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3077  type VI secretion system Vgr family protein  25.14 
 
 		 633 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2064  type VI secretion system Vgr family protein  21.68 
 
 		 702 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0713545 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4385  Rhs element Vgr protein  22.41 
 
 		 763 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1145  Rhs element Vgr protein  26.62 
 
 		 706 aa  76.6  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0616  type VI secretion system Vgr family protein  25.14 
 
 		 633 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0499415  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1026  vgrG protein  22.91 
 
 		 1095 aa  75.5  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  22.56 
 
 		 692 aa  74.7  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0401  type VI secretion system Vgr family protein  23.71 
 
 		 740 aa  74.3  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0649  type VI secretion system Vgr family protein  25.81 
 
 		 633 aa  73.9  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0328  Rhs element Vgr protein  23.71 
 
 		 740 aa  73.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  23.16 
 
 		 668 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  26.52 
 
 		 727 aa  72.8  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0587  type VI secretion system Vgr family protein  25.34 
 
 		 633 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  21.77 
 
 		 732 aa  72.8  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  22.43 
 
 		 706 aa  73.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2565  Rhs element Vgr protein  24.45 
 
 		 687 aa  72.4  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2572  Rhs element Vgr protein  24.45 
 
 		 687 aa  72.4  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0544876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2579  Rhs element Vgr protein  24.45 
 
 		 687 aa  72.4  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472026  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  22.47 
 
 		 735 aa  72.4  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  20.9 
 
 		 771 aa  71.6  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0707  Rhs element Vgr protein  25.69 
 
 		 763 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3479  Rhs element Vgr protein  24.78 
 
 		 897 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  23.22 
 
 		 853 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0153  Rhs element Vgr protein  25.93 
 
 		 689 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  24.24 
 
 		 669 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2010  Rhs element Vgr protein  25.31 
 
 		 748 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0445  Rhs element Vgr protein  25.31 
 
 		 748 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0741  Rhs element Vgr protein  25.31 
 
 		 748 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1036  Rhs element Vgr protein  25.31 
 
 		 748 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288355  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  23.42 
 
 		 769 aa  70.1  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  23.79 
 
 		 683 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3949  Rhs element Vgr protein  22.92 
 
 		 691 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2081  Rhs element Vgr protein  25.69 
 
 		 763 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4796  Rhs element Vgr protein  24.35 
 
 		 911 aa  69.7  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0796  Rhs element Vgr protein  25.69 
 
 		 763 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  21.09 
 
 		 684 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  22.79 
 
 		 641 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1894  Rhs element Vgr protein  25.69 
 
 		 763 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  24.05 
 
 		 790 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  23.17 
 
 		 692 aa  68.2  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00256  Rhs-family protein  24.01 
 
 		 645 aa  68.2  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  25.29 
 
 		 697 aa  67.8  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  22.78 
 
 		 683 aa  67.8  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5574  Rhs element Vgr protein  24.25 
 
 		 741 aa  67.4  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  24.54 
 
 		 668 aa  66.6  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0418  type VI secretion system Vgr family protein  23.54 
 
 		 617 aa  65.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  23.77 
 
 		 1118 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  22.24 
 
 		 668 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21450  hypothetical protein  23.53 
 
 		 688 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3849  Rhs element Vgr protein  24.02 
 
 		 675 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1162  type VI secretion system Vgr family protein  22.71 
 
 		 617 aa  65.5  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.754803  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1893  Rhs element Vgr protein  25.21 
 
 		 762 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  23.54 
 
 		 617 aa  65.9  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  24.53 
 
 		 712 aa  65.5  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6319  Rhs element Vgr protein  23.84 
 
 		 1197 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0965231 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  21.77 
 
 		 661 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>