More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2911 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2911  recombination protein RecR  100 
 
 		 197 aa  382  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0675697 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0258  recombination protein RecR  61.34 
 
 		 199 aa  247  9e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0023  recombination protein RecR  60.31 
 
 		 201 aa  238  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.622257  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0032  recombination protein RecR  60.31 
 
 		 201 aa  238  5e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0840728  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0254  recombination protein RecR  61.86 
 
 		 201 aa  235  3e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0032  recombination protein RecR  59.79 
 
 		 232 aa  234  6e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196759  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1240  recombination protein RecR  57.73 
 
 		 201 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4074  recombination protein RecR  57.81 
 
 		 201 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0156  recombination protein RecR  59.38 
 
 		 201 aa  231  7.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4091  recombination protein RecR  57.73 
 
 		 201 aa  230  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607523  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4394  recombination protein RecR  57.29 
 
 		 201 aa  228  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4573  recombination protein RecR  62.05 
 
 		 200 aa  227  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0276  recombination protein RecR  59.38 
 
 		 201 aa  226  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0437  DNA replication and repair protein RecR  61.46 
 
 		 201 aa  225  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.792606  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7344  recombination protein RecR  57.22 
 
 		 199 aa  222  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3435  recombination protein RecR  56.83 
 
 		 201 aa  221  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0085  recombination protein RecR  57.73 
 
 		 201 aa  220  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  0.0328355 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0666  recombination protein RecR  57.22 
 
 		 201 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.290354 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0621  recombination protein RecR  57.29 
 
 		 200 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990483  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0367  recombination protein RecR  57.81 
 
 		 201 aa  218  6e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3471  RecR protein  60.2 
 
 		 197 aa  217  7.999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177625  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0519  recombination protein RecR  59.69 
 
 		 199 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217217  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4846  recombination protein RecR  56.19 
 
 		 201 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0250  recombination protein RecR  52.55 
 
 		 198 aa  215  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3145  recombination protein RecR  56.7 
 
 		 201 aa  214  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216017  normal  0.38463 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0712  recombination protein RecR  59.16 
 
 		 199 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2367  recombination protein RecR  59.16 
 
 		 199 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.424518  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0464  recombination protein RecR  55.1 
 
 		 200 aa  214  7e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4750  recombination protein RecR  55.15 
 
 		 201 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4241  recombination protein RecR  56.7 
 
 		 201 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140476 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0164  recombination protein RecR  55.96 
 
 		 199 aa  213  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1920  recombination protein RecR  55.67 
 
 		 201 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.700264  normal  0.039212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1638  recombination protein RecR  55.67 
 
 		 201 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0212504  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3878  recombination protein RecR  57.07 
 
 		 199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.114118 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4043  recombination protein RecR  53.06 
 
 		 198 aa  209  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0843  recombination protein RecR  47.37 
 
 		 195 aa  209  2e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0245  recombination protein RecR  45.79 
 
 		 195 aa  208  4e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0727285  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1594  recombination protein RecR  54.64 
 
 		 201 aa  208  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1998  recombination protein RecR  58.06 
 
 		 196 aa  208  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0648  recombination protein RecR  56.54 
 
 		 199 aa  206  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0126117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1839  recombination protein RecR  59.28 
 
 		 201 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165637  normal  0.471383 
 
 
-
 
NC_002978  WD1180  recombination protein RecR  44.56 
 
 		 201 aa  200  9.999999999999999e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2895  recombination protein RecR  52.04 
 
 		 198 aa  200  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3647  recombination protein RecR  54.92 
 
 		 199 aa  199  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.664913  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  46.81 
 
 		 198 aa  178  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  41.58 
 
 		 200 aa  177  7e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0899  recombination protein RecR  42.41 
 
 		 196 aa  177  1e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213296  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2777  recombination protein RecR  53.4 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1153  recombination protein RecR  47.4 
 
 		 195 aa  168  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.332903 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  43.68 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2791  recombination protein RecR  45.45 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0094882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  44.74 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1513  recombination protein RecR  46.52 
 
 		 222 aa  165  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0279848  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  40.96 
 
 		 198 aa  165  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1600  recombination protein RecR  40.62 
 
 		 203 aa  164  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.351131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19850  recombination protein RecR  47.12 
 
 		 199 aa  164  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0894  recombination protein RecR  37.7 
 
 		 205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1574  recombination protein RecR  43.68 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  unclonable  0.000000162046 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1365  recombination protein RecR  38.42 
 
 		 200 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  39.15 
 
 		 198 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  39.15 
 
 		 198 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  44.68 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1284  recombination protein RecR  41.71 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.722454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2171  recombination protein RecR  38.74 
 
 		 206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0052  recombination protein RecR  44.39 
 
 		 198 aa  161  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011836  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  41.15 
 
 		 200 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0794  recombination protein RecR  43.39 
 
 		 197 aa  161  7e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0617027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0800  recombination protein RecR  43.39 
 
 		 197 aa  160  8.000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.924037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0605  recombination protein RecR  42.41 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.813504 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12031  recombination protein RecR  40.21 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  37.82 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0362  recombination protein RecR  35.6 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0376  recombination protein RecR  41.05 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000959909  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1399  recombination protein RecR  44.97 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.612922  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12041  recombination protein RecR  40.74 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  38.42 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  40 
 
 		 199 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1108  recombination protein RecR  40.21 
 
 		 199 aa  158  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425444  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  38.42 
 
 		 198 aa  157  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1175  recombination protein RecR  40.21 
 
 		 204 aa  157  6e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000261474  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0230  recombination protein RecR  45.26 
 
 		 201 aa  158  6e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.601647  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  37.37 
 
 		 198 aa  157  8e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  41.49 
 
 		 199 aa  157  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  38.95 
 
 		 199 aa  156  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  38.95 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  42.02 
 
 		 197 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1189  recombination protein RecR  40.21 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00843682  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6868  recombination protein RecR  40.82 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.296067 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  42.02 
 
 		 197 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2905  recombination protein RecR  40.41 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  38.95 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  38.95 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  38.95 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  38.95 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  38.95 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0531  recombination protein RecR  41.05 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0553702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  38.95 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3635  recombination protein RecR  45.79 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0682949  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  38.95 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  38.95 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>