More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0276 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0276  recombination protein RecR  100 
 
 		 201 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0254  recombination protein RecR  74.13 
 
 		 201 aa  308  2.9999999999999997e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3145  recombination protein RecR  74.63 
 
 		 201 aa  307  8e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216017  normal  0.38463 
 
 
-
 
NC_004310  BR0032  recombination protein RecR  74.63 
 
 		 201 aa  306  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0840728  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0032  recombination protein RecR  74.13 
 
 		 232 aa  303  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196759  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0023  recombination protein RecR  74.13 
 
 		 201 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.622257  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4091  recombination protein RecR  72.14 
 
 		 201 aa  301  3.0000000000000004e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607523  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4241  recombination protein RecR  71.14 
 
 		 201 aa  300  9e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4750  recombination protein RecR  72.14 
 
 		 201 aa  299  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0156  recombination protein RecR  72.86 
 
 		 201 aa  299  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1594  recombination protein RecR  72.14 
 
 		 201 aa  297  7e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4074  recombination protein RecR  70.35 
 
 		 201 aa  295  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1638  recombination protein RecR  71.64 
 
 		 201 aa  293  9e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0212504  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1920  recombination protein RecR  71.64 
 
 		 201 aa  293  9e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.700264  normal  0.039212 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7344  recombination protein RecR  70.05 
 
 		 199 aa  291  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4394  recombination protein RecR  69.85 
 
 		 201 aa  290  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1240  recombination protein RecR  68.66 
 
 		 201 aa  289  2e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0621  recombination protein RecR  70.77 
 
 		 200 aa  288  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990483  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0367  recombination protein RecR  69.15 
 
 		 201 aa  285  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0666  recombination protein RecR  68.16 
 
 		 201 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.290354 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4846  recombination protein RecR  68.16 
 
 		 201 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0085  recombination protein RecR  68.16 
 
 		 201 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  0.0328355 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0464  recombination protein RecR  69.04 
 
 		 200 aa  285  4e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3435  recombination protein RecR  69.31 
 
 		 201 aa  281  5.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0258  recombination protein RecR  70.05 
 
 		 199 aa  278  5e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1839  recombination protein RecR  70.05 
 
 		 201 aa  262  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165637  normal  0.471383 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4043  recombination protein RecR  64.95 
 
 		 198 aa  252  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0250  recombination protein RecR  64.21 
 
 		 198 aa  250  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0437  DNA replication and repair protein RecR  67.88 
 
 		 201 aa  248  5e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.792606  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2367  recombination protein RecR  62.69 
 
 		 199 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.424518  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0712  recombination protein RecR  62.69 
 
 		 199 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0519  recombination protein RecR  62.69 
 
 		 199 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217217  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4573  recombination protein RecR  60.94 
 
 		 200 aa  236  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0164  recombination protein RecR  60.62 
 
 		 199 aa  234  5.0000000000000005e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2895  recombination protein RecR  60.82 
 
 		 198 aa  232  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3471  RecR protein  61.58 
 
 		 197 aa  229  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177625  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3878  recombination protein RecR  59.07 
 
 		 199 aa  222  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.114118 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0648  recombination protein RecR  56.48 
 
 		 199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0126117  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1180  recombination protein RecR  46.35 
 
 		 201 aa  210  1e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2911  recombination protein RecR  59.38 
 
 		 197 aa  209  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0675697 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3647  recombination protein RecR  58.33 
 
 		 199 aa  209  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.664913  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0245  recombination protein RecR  47.89 
 
 		 195 aa  207  1e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0727285  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0843  recombination protein RecR  47.37 
 
 		 195 aa  207  1e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0899  recombination protein RecR  47.89 
 
 		 196 aa  200  9.999999999999999e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213296  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1998  recombination protein RecR  55.98 
 
 		 196 aa  197  9e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  44.79 
 
 		 199 aa  191  5e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  45.83 
 
 		 200 aa  186  3e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  49.74 
 
 		 198 aa  184  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  47.09 
 
 		 199 aa  184  7e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  46.56 
 
 		 199 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  48.42 
 
 		 198 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  43.59 
 
 		 198 aa  182  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  43.59 
 
 		 198 aa  182  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2791  recombination protein RecR  46.91 
 
 		 201 aa  181  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0094882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  45.88 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  43.75 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  46.03 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6868  recombination protein RecR  47.21 
 
 		 201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.296067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  47.62 
 
 		 199 aa  178  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  47.62 
 
 		 199 aa  178  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  45.55 
 
 		 200 aa  177  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  42.05 
 
 		 198 aa  177  8e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  44.62 
 
 		 200 aa  177  9e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  45.64 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  46.15 
 
 		 197 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0094  recombination protein RecR  44.27 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.427132  hitchhiker  0.00000395528 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  46.15 
 
 		 197 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  46.56 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  44.97 
 
 		 199 aa  176  3e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  42.93 
 
 		 199 aa  175  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  43.23 
 
 		 199 aa  175  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000716421  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  42.93 
 
 		 199 aa  175  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  45.5 
 
 		 199 aa  174  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3776  recombination protein RecR  48.7 
 
 		 198 aa  174  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0326868  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  41.03 
 
 		 198 aa  174  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  42.38 
 
 		 215 aa  174  8e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  46.88 
 
 		 198 aa  174  8e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1728  recombination protein RecR  44.5 
 
 		 195 aa  174  9e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000187366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  43.39 
 
 		 204 aa  174  9e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  40.51 
 
 		 198 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6148  recombination protein RecR  45.7 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  44.97 
 
 		 199 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4901  recombination protein RecR  46.45 
 
 		 196 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  45.88 
 
 		 203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0510  DNA replication and repair protein RecR  48.96 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.186911  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  42.71 
 
 		 199 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  43.68 
 
 		 198 aa  171  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1175  recombination protein RecR  42.29 
 
 		 204 aa  171  5e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000261474  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0230  recombination protein RecR  42.64 
 
 		 201 aa  171  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.601647  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  42.63 
 
 		 198 aa  171  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  42.63 
 
 		 198 aa  171  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  44.44 
 
 		 199 aa  171  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3693  recombination protein RecR  48.19 
 
 		 198 aa  171  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1508  recombination protein RecR  46.91 
 
 		 199 aa  171  5.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0537537  normal  0.426443 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  43.75 
 
 		 199 aa  171  9e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0792  recombination protein RecR  40.62 
 
 		 201 aa  171  9e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0800  recombination protein RecR  45.31 
 
 		 197 aa  171  9e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.924037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0328  recombination protein RecR  41.71 
 
 		 200 aa  171  9e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1460  recombination protein RecR  43.81 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0210  recombination protein RecR  46.35 
 
 		 197 aa  170  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00238733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>