More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0258 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0258  recombination protein RecR  100 
 
 		 199 aa  397  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0023  recombination protein RecR  70.62 
 
 		 201 aa  285  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.622257  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0032  recombination protein RecR  70.1 
 
 		 201 aa  282  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0840728  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4573  recombination protein RecR  68.53 
 
 		 200 aa  281  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0156  recombination protein RecR  69.07 
 
 		 201 aa  281  6.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4091  recombination protein RecR  69.04 
 
 		 201 aa  281  6.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607523  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0032  recombination protein RecR  69.59 
 
 		 232 aa  280  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196759  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1920  recombination protein RecR  68.84 
 
 		 201 aa  280  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.700264  normal  0.039212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1638  recombination protein RecR  68.84 
 
 		 201 aa  280  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0212504  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1594  recombination protein RecR  68.69 
 
 		 201 aa  278  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4750  recombination protein RecR  67.68 
 
 		 201 aa  278  5e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0276  recombination protein RecR  70.05 
 
 		 201 aa  278  5e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3145  recombination protein RecR  68.34 
 
 		 201 aa  277  6e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216017  normal  0.38463 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4074  recombination protein RecR  67.53 
 
 		 201 aa  277  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4394  recombination protein RecR  67.53 
 
 		 201 aa  274  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1240  recombination protein RecR  64.97 
 
 		 201 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7344  recombination protein RecR  65.33 
 
 		 199 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0254  recombination protein RecR  66.5 
 
 		 201 aa  273  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4846  recombination protein RecR  66.16 
 
 		 201 aa  272  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4241  recombination protein RecR  65.66 
 
 		 201 aa  271  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140476 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0085  recombination protein RecR  64.14 
 
 		 201 aa  266  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  0.0328355 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0367  recombination protein RecR  65.66 
 
 		 201 aa  266  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0666  recombination protein RecR  63.82 
 
 		 201 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.290354 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3435  recombination protein RecR  68.11 
 
 		 201 aa  265  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0464  recombination protein RecR  64.14 
 
 		 200 aa  263  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0437  DNA replication and repair protein RecR  69.23 
 
 		 201 aa  263  1e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.792606  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0621  recombination protein RecR  63.08 
 
 		 200 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990483  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4043  recombination protein RecR  60.71 
 
 		 198 aa  244  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0519  recombination protein RecR  60.8 
 
 		 199 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217217  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0712  recombination protein RecR  60.8 
 
 		 199 aa  244  8e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2367  recombination protein RecR  60.8 
 
 		 199 aa  244  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.424518  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0164  recombination protein RecR  61.11 
 
 		 199 aa  243  9e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3471  RecR protein  61.66 
 
 		 197 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177625  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0250  recombination protein RecR  59.9 
 
 		 198 aa  242  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1839  recombination protein RecR  66.15 
 
 		 201 aa  239  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165637  normal  0.471383 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2895  recombination protein RecR  60.62 
 
 		 198 aa  238  5.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3878  recombination protein RecR  57.79 
 
 		 199 aa  233  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.114118 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2911  recombination protein RecR  61.34 
 
 		 197 aa  232  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0675697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0648  recombination protein RecR  56.78 
 
 		 199 aa  230  9e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0126117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0245  recombination protein RecR  51.05 
 
 		 195 aa  226  2e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0727285  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0843  recombination protein RecR  52.11 
 
 		 195 aa  225  4e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1998  recombination protein RecR  59.14 
 
 		 196 aa  223  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3647  recombination protein RecR  54.77 
 
 		 199 aa  216  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.664913  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0899  recombination protein RecR  49.74 
 
 		 196 aa  208  5e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213296  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1180  recombination protein RecR  46.35 
 
 		 201 aa  207  1e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  49.23 
 
 		 200 aa  185  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  46.84 
 
 		 199 aa  182  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  42.63 
 
 		 199 aa  182  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  45.26 
 
 		 199 aa  181  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  45.26 
 
 		 199 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  44.27 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  41.12 
 
 		 199 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  45.26 
 
 		 199 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1460  recombination protein RecR  45.36 
 
 		 203 aa  178  5.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  43.75 
 
 		 198 aa  177  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  43.75 
 
 		 198 aa  177  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3776  recombination protein RecR  47.72 
 
 		 198 aa  177  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0326868  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  42.64 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  48.4 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  43.16 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  45.31 
 
 		 199 aa  176  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3635  recombination protein RecR  47.21 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0682949  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3420  recombination protein RecR  44.9 
 
 		 197 aa  174  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000418809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  44.74 
 
 		 199 aa  174  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0376  recombination protein RecR  42.13 
 
 		 199 aa  174  7e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000959909  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0103  recombination protein RecR  48.45 
 
 		 205 aa  174  7e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2791  recombination protein RecR  45.36 
 
 		 201 aa  174  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0094882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3693  recombination protein RecR  47.21 
 
 		 198 aa  174  9e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  42.64 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  42.55 
 
 		 198 aa  173  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0210  recombination protein RecR  47.62 
 
 		 197 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00238733  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3233  recombination protein RecR  45.69 
 
 		 201 aa  173  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00290146  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0605  recombination protein RecR  43.59 
 
 		 198 aa  173  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.813504 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  40.7 
 
 		 200 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0367  recombination protein RecR  44.9 
 
 		 197 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000104569  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  45.36 
 
 		 198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  41.97 
 
 		 198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  45.26 
 
 		 204 aa  172  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1078  recombination protein RecR  45.69 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00501486  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  43.68 
 
 		 199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0096  recombination protein RecR  46.03 
 
 		 197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  41.58 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  42.49 
 
 		 198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  42.49 
 
 		 198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  42.49 
 
 		 198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  42.49 
 
 		 198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  42.49 
 
 		 198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  42.49 
 
 		 198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  41.45 
 
 		 198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  42.49 
 
 		 198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  42.49 
 
 		 198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07580  recombination protein RecR  39.2 
 
 		 205 aa  171  5e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  41.58 
 
 		 199 aa  171  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000716421  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0193  recombination protein RecR  47.62 
 
 		 197 aa  171  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.54722e-32 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0876  recombination protein RecR  44.06 
 
 		 205 aa  171  5e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236208  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2532  recombination protein RecR  44.85 
 
 		 197 aa  171  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.200135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0052  recombination protein RecR  48.13 
 
 		 198 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011836  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1075  recombination protein RecR  45.31 
 
 		 197 aa  171  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  42.49 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  42.49 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>