More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0464 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0464  recombination protein RecR  100 
 
 		 200 aa  401  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0367  recombination protein RecR  93.94 
 
 		 201 aa  376  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0085  recombination protein RecR  89.39 
 
 		 201 aa  357  6e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  0.0328355 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0666  recombination protein RecR  88.89 
 
 		 201 aa  356  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.290354 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7344  recombination protein RecR  88.38 
 
 		 199 aa  356  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4846  recombination protein RecR  88.44 
 
 		 201 aa  355  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0621  recombination protein RecR  87 
 
 		 200 aa  352  1e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990483  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4750  recombination protein RecR  71.21 
 
 		 201 aa  291  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0023  recombination protein RecR  68.53 
 
 		 201 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.622257  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0032  recombination protein RecR  68.53 
 
 		 201 aa  287  9e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0840728  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0276  recombination protein RecR  69.04 
 
 		 201 aa  285  4e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0254  recombination protein RecR  69.35 
 
 		 201 aa  283  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3145  recombination protein RecR  69.19 
 
 		 201 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216017  normal  0.38463 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0032  recombination protein RecR  68.72 
 
 		 232 aa  283  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196759  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4074  recombination protein RecR  68.72 
 
 		 201 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4091  recombination protein RecR  66.5 
 
 		 201 aa  281  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607523  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0156  recombination protein RecR  71.79 
 
 		 201 aa  281  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4241  recombination protein RecR  69.19 
 
 		 201 aa  279  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140476 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4394  recombination protein RecR  67.69 
 
 		 201 aa  279  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1240  recombination protein RecR  65.48 
 
 		 201 aa  278  3e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1594  recombination protein RecR  68.69 
 
 		 201 aa  278  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1920  recombination protein RecR  68.69 
 
 		 201 aa  278  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.700264  normal  0.039212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1638  recombination protein RecR  68.69 
 
 		 201 aa  278  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0212504  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1839  recombination protein RecR  71.72 
 
 		 201 aa  267  5.9999999999999995e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165637  normal  0.471383 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3435  recombination protein RecR  68.65 
 
 		 201 aa  265  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0258  recombination protein RecR  64.14 
 
 		 199 aa  263  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3471  RecR protein  62.18 
 
 		 197 aa  244  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177625  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0437  DNA replication and repair protein RecR  64.95 
 
 		 201 aa  238  5.999999999999999e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.792606  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4573  recombination protein RecR  56.28 
 
 		 200 aa  233  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0250  recombination protein RecR  59.38 
 
 		 198 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4043  recombination protein RecR  57.14 
 
 		 198 aa  232  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0712  recombination protein RecR  58 
 
 		 199 aa  224  6e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2367  recombination protein RecR  58 
 
 		 199 aa  224  6e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.424518  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0519  recombination protein RecR  58 
 
 		 199 aa  222  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217217  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2895  recombination protein RecR  58.16 
 
 		 198 aa  222  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3878  recombination protein RecR  59.07 
 
 		 199 aa  222  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.114118 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0164  recombination protein RecR  56.5 
 
 		 199 aa  221  7e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0648  recombination protein RecR  56.57 
 
 		 199 aa  213  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0126117  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1180  recombination protein RecR  45.83 
 
 		 201 aa  213  1.9999999999999998e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0843  recombination protein RecR  47.37 
 
 		 195 aa  211  7e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0245  recombination protein RecR  45.79 
 
 		 195 aa  207  1e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0727285  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3647  recombination protein RecR  54.36 
 
 		 199 aa  206  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.664913  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1998  recombination protein RecR  57.07 
 
 		 196 aa  206  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0899  recombination protein RecR  48.17 
 
 		 196 aa  202  2e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213296  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2911  recombination protein RecR  55.1 
 
 		 197 aa  198  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0675697 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  46.07 
 
 		 200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  46.03 
 
 		 200 aa  181  5.0000000000000004e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1856  recombination protein RecR  44.97 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  46.88 
 
 		 199 aa  178  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  45.5 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  43.75 
 
 		 198 aa  175  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  45.5 
 
 		 199 aa  174  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1460  recombination protein RecR  44.33 
 
 		 203 aa  174  7e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  43.52 
 
 		 198 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  43.23 
 
 		 198 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  43.23 
 
 		 198 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  43.23 
 
 		 198 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  43.23 
 
 		 198 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  42.13 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  43.23 
 
 		 198 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  43.23 
 
 		 198 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0103  recombination protein RecR  47.94 
 
 		 205 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  43.23 
 
 		 198 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  46.03 
 
 		 198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  43.23 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  42.49 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  42.49 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  43.23 
 
 		 198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  43.23 
 
 		 198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6868  recombination protein RecR  42.64 
 
 		 201 aa  171  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.296067 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  44.97 
 
 		 199 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  42.19 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28430  DNA replication and repair protein RecR  46.24 
 
 		 197 aa  170  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  42.71 
 
 		 198 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  43.92 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1853  recombination protein RecR  41.97 
 
 		 196 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.38333 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  45.31 
 
 		 203 aa  169  3e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0230  recombination protein RecR  43.43 
 
 		 201 aa  169  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.601647  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  43.55 
 
 		 199 aa  168  4e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  43.92 
 
 		 200 aa  168  4e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1611  recombination protein RecR  44.33 
 
 		 200 aa  169  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315975  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0127  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 202 aa  168  5e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  42.33 
 
 		 199 aa  168  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1728  recombination protein RecR  45.55 
 
 		 195 aa  168  6e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000187366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  44.27 
 
 		 199 aa  168  6e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1508  recombination protein RecR  45.36 
 
 		 199 aa  168  6e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0537537  normal  0.426443 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0773  recombination protein RecR  43.59 
 
 		 201 aa  168  6e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0667  recombination protein RecR  43.59 
 
 		 201 aa  168  6e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  42.41 
 
 		 199 aa  168  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1337  recombinational DNA repair protein  39.27 
 
 		 197 aa  167  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.43328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  40.5 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  41.71 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  45.03 
 
 		 197 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  43.52 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0094  recombination protein RecR  41.27 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.427132  hitchhiker  0.00000395528 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0792  recombination protein RecR  39.06 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  44.5 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6148  recombination protein RecR  44.09 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1974  recombination protein RecR  42.64 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.181193 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  45.45 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>