More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0437 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0437  DNA replication and repair protein RecR  100 
 
 		 201 aa  400  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.792606  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3145  recombination protein RecR  67.34 
 
 		 201 aa  276  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216017  normal  0.38463 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0258  recombination protein RecR  69.23 
 
 		 199 aa  273  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4750  recombination protein RecR  64.32 
 
 		 201 aa  267  7e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1240  recombination protein RecR  61.31 
 
 		 201 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4573  recombination protein RecR  67.18 
 
 		 200 aa  265  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4091  recombination protein RecR  64.82 
 
 		 201 aa  264  8e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607523  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7344  recombination protein RecR  66.33 
 
 		 199 aa  262  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4241  recombination protein RecR  63.32 
 
 		 201 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140476 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0621  recombination protein RecR  67.18 
 
 		 200 aa  261  6e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990483  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0276  recombination protein RecR  67.88 
 
 		 201 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0032  recombination protein RecR  63.18 
 
 		 232 aa  260  8e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196759  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1594  recombination protein RecR  64.82 
 
 		 201 aa  260  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0085  recombination protein RecR  66.33 
 
 		 201 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  0.0328355 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0023  recombination protein RecR  62.69 
 
 		 201 aa  259  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.622257  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4074  recombination protein RecR  61.19 
 
 		 201 aa  259  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0032  recombination protein RecR  63.18 
 
 		 201 aa  259  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0840728  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0666  recombination protein RecR  65.83 
 
 		 201 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.290354 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1638  recombination protein RecR  63.82 
 
 		 201 aa  259  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0212504  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1920  recombination protein RecR  63.82 
 
 		 201 aa  259  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.700264  normal  0.039212 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0254  recombination protein RecR  63.68 
 
 		 201 aa  257  8e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4846  recombination protein RecR  65.33 
 
 		 201 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0367  recombination protein RecR  64.82 
 
 		 201 aa  255  4e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4394  recombination protein RecR  60.7 
 
 		 201 aa  254  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0156  recombination protein RecR  61.69 
 
 		 201 aa  250  8.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0464  recombination protein RecR  64.95 
 
 		 200 aa  248  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3878  recombination protein RecR  60.61 
 
 		 199 aa  245  3e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.114118 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2367  recombination protein RecR  62.56 
 
 		 199 aa  244  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.424518  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0712  recombination protein RecR  62.56 
 
 		 199 aa  244  8e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0164  recombination protein RecR  59.6 
 
 		 199 aa  244  8e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3435  recombination protein RecR  63.49 
 
 		 201 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0648  recombination protein RecR  60.1 
 
 		 199 aa  241  3.9999999999999997e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0126117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0519  recombination protein RecR  61.54 
 
 		 199 aa  241  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217217  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1839  recombination protein RecR  63.18 
 
 		 201 aa  239  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165637  normal  0.471383 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3471  RecR protein  60.91 
 
 		 197 aa  235  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177625  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4043  recombination protein RecR  59.18 
 
 		 198 aa  233  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0250  recombination protein RecR  57.51 
 
 		 198 aa  231  4.0000000000000004e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3647  recombination protein RecR  57.95 
 
 		 199 aa  227  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.664913  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2911  recombination protein RecR  61.46 
 
 		 197 aa  221  7e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0675697 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2895  recombination protein RecR  56.12 
 
 		 198 aa  221  7e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1998  recombination protein RecR  56.52 
 
 		 196 aa  206  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0245  recombination protein RecR  45.08 
 
 		 195 aa  203  1e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0727285  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0843  recombination protein RecR  44.04 
 
 		 195 aa  197  9e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1180  recombination protein RecR  44.74 
 
 		 201 aa  195  3e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0899  recombination protein RecR  45.6 
 
 		 196 aa  192  3e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213296  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1611  recombination protein RecR  46.88 
 
 		 200 aa  180  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315975  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28430  DNA replication and repair protein RecR  45.31 
 
 		 197 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  43.16 
 
 		 200 aa  171  6.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  44.44 
 
 		 199 aa  171  9e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  44.97 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2791  recombination protein RecR  43.22 
 
 		 201 aa  169  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0094882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  44.27 
 
 		 199 aa  169  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0794  recombination protein RecR  45.03 
 
 		 197 aa  167  8e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0617027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  44.79 
 
 		 199 aa  167  8e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1728  recombination protein RecR  43.98 
 
 		 195 aa  167  9e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000187366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0800  recombination protein RecR  44.5 
 
 		 197 aa  167  9e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.924037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  43.75 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  41.58 
 
 		 199 aa  166  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0894  recombination protein RecR  39.15 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1172  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000693632  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  42.71 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0531  recombination protein RecR  41.75 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0553702  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6868  recombination protein RecR  42.05 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.296067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6148  recombination protein RecR  44.44 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0876  recombination protein RecR  42.51 
 
 		 205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236208  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1460  recombination protein RecR  43.46 
 
 		 203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0883  recombination protein RecR  41.67 
 
 		 204 aa  165  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254341  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  42.64 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  42.19 
 
 		 204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  41.03 
 
 		 198 aa  165  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  41.03 
 
 		 198 aa  165  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  41.33 
 
 		 198 aa  165  5e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0230  recombination protein RecR  44.5 
 
 		 201 aa  164  5.9999999999999996e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.601647  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  42.19 
 
 		 199 aa  164  6.9999999999999995e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1175  recombination protein RecR  43.2 
 
 		 204 aa  164  8e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000261474  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1189  recombination protein RecR  43.65 
 
 		 204 aa  164  9e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00843682  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  41.03 
 
 		 198 aa  163  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0127  recombination protein RecR  42.71 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1639  DNA replication and repair protein RecR  43.16 
 
 		 219 aa  163  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  43.75 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2532  recombination protein RecR  42.78 
 
 		 197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.200135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  42.33 
 
 		 199 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1795  recombination protein RecR  45.83 
 
 		 199 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000406464  unclonable  0.00000000671172 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0268  recombination protein RecR  42.71 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  41.71 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1537  recombination protein RecR  44.79 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0998333  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0792  recombination protein RecR  37.95 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2804  recombination protein RecR  39.06 
 
 		 197 aa  162  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2673  recombination protein RecR  39.06 
 
 		 197 aa  162  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  41.45 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12031  recombination protein RecR  41.15 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3124  recombination protein RecR  42.33 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0192329  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  41.8 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1180  recombination protein RecR  40.61 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000222469  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6566  recombination protein RecR  42.71 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00960042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12041  recombination protein RecR  41.67 
 
 		 199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02441  recombination protein RecR  44.27 
 
 		 197 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  43.59 
 
 		 199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10891  RecR protein  44.51 
 
 		 182 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.683026  normal  0.323303 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0103  recombination protein RecR  45.88 
 
 		 205 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>