More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0254 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0254  recombination protein RecR  100 
 
 		 201 aa  402  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0276  recombination protein RecR  74.13 
 
 		 201 aa  308  2.9999999999999997e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0023  recombination protein RecR  72.14 
 
 		 201 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.622257  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0032  recombination protein RecR  71.64 
 
 		 201 aa  299  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0840728  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4091  recombination protein RecR  69.65 
 
 		 201 aa  295  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607523  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4074  recombination protein RecR  68.84 
 
 		 201 aa  295  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3145  recombination protein RecR  72.14 
 
 		 201 aa  294  5e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216017  normal  0.38463 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0032  recombination protein RecR  71.14 
 
 		 232 aa  293  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196759  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4394  recombination protein RecR  68.84 
 
 		 201 aa  293  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0156  recombination protein RecR  68.84 
 
 		 201 aa  291  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4750  recombination protein RecR  70.15 
 
 		 201 aa  290  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1240  recombination protein RecR  69.15 
 
 		 201 aa  290  1e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4241  recombination protein RecR  69.15 
 
 		 201 aa  286  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140476 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4846  recombination protein RecR  68.66 
 
 		 201 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7344  recombination protein RecR  70.56 
 
 		 199 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0085  recombination protein RecR  69.15 
 
 		 201 aa  284  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  0.0328355 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0464  recombination protein RecR  69.35 
 
 		 200 aa  283  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0367  recombination protein RecR  69.15 
 
 		 201 aa  282  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0666  recombination protein RecR  68.66 
 
 		 201 aa  281  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.290354 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3435  recombination protein RecR  68.25 
 
 		 201 aa  280  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1638  recombination protein RecR  66.67 
 
 		 201 aa  278  5e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0212504  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1920  recombination protein RecR  66.67 
 
 		 201 aa  278  5e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.700264  normal  0.039212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0621  recombination protein RecR  68.88 
 
 		 200 aa  277  8e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990483  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1594  recombination protein RecR  67.16 
 
 		 201 aa  275  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0258  recombination protein RecR  66.5 
 
 		 199 aa  273  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1839  recombination protein RecR  67.16 
 
 		 201 aa  255  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165637  normal  0.471383 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4043  recombination protein RecR  62.37 
 
 		 198 aa  252  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0250  recombination protein RecR  62.11 
 
 		 198 aa  246  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0437  DNA replication and repair protein RecR  64.32 
 
 		 201 aa  244  4.9999999999999997e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.792606  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4573  recombination protein RecR  61.22 
 
 		 200 aa  237  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3471  RecR protein  62.63 
 
 		 197 aa  234  6e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177625  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2895  recombination protein RecR  60.82 
 
 		 198 aa  232  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0712  recombination protein RecR  60.1 
 
 		 199 aa  227  7e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2367  recombination protein RecR  60.1 
 
 		 199 aa  227  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.424518  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0164  recombination protein RecR  58.76 
 
 		 199 aa  226  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3878  recombination protein RecR  59.59 
 
 		 199 aa  225  4e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.114118 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0519  recombination protein RecR  59.59 
 
 		 199 aa  224  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217217  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0245  recombination protein RecR  50.53 
 
 		 195 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0727285  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2911  recombination protein RecR  61.86 
 
 		 197 aa  218  6e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0675697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0648  recombination protein RecR  56.5 
 
 		 199 aa  216  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0126117  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1180  recombination protein RecR  48.44 
 
 		 201 aa  215  4e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0843  recombination protein RecR  50 
 
 		 195 aa  214  5e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3647  recombination protein RecR  57.14 
 
 		 199 aa  214  5.9999999999999996e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.664913  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1998  recombination protein RecR  59.14 
 
 		 196 aa  210  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0899  recombination protein RecR  47.64 
 
 		 196 aa  200  9.999999999999999e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213296  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  45.83 
 
 		 200 aa  188  5.999999999999999e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1337  recombinational DNA repair protein  45.88 
 
 		 197 aa  185  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.43328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0800  recombination protein RecR  46.6 
 
 		 197 aa  180  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.924037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1460  recombination protein RecR  47.42 
 
 		 203 aa  179  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  46.84 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  47.12 
 
 		 200 aa  177  8e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0794  recombination protein RecR  46.07 
 
 		 197 aa  177  1e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0617027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1728  recombination protein RecR  46.07 
 
 		 195 aa  176  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000187366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  47.62 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1853  recombination protein RecR  44.56 
 
 		 196 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.38333 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0230  recombination protein RecR  44.16 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.601647  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1856  recombination protein RecR  46.46 
 
 		 199 aa  175  5e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  46.35 
 
 		 199 aa  174  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  41.54 
 
 		 198 aa  174  7e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0773  recombination protein RecR  47.15 
 
 		 201 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  42.05 
 
 		 198 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  42.05 
 
 		 198 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0667  recombination protein RecR  47.15 
 
 		 201 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  43.88 
 
 		 200 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1075  recombination protein RecR  46.88 
 
 		 197 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  44.5 
 
 		 199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  42.63 
 
 		 199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  44.27 
 
 		 199 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12031  recombination protein RecR  43.23 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2804  recombination protein RecR  43.92 
 
 		 197 aa  172  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2673  recombination protein RecR  43.92 
 
 		 197 aa  172  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  42.71 
 
 		 199 aa  171  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1574  recombination protein RecR  43.98 
 
 		 199 aa  171  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  unclonable  0.000000162046 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2595  RecR protein  44.44 
 
 		 199 aa  171  6.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00242938  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  45.31 
 
 		 199 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11881  recombination protein RecR  42.19 
 
 		 199 aa  171  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 199 aa  171  9e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12041  recombination protein RecR  43.23 
 
 		 199 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  44.44 
 
 		 204 aa  170  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1108  recombination protein RecR  43.23 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425444  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  43.92 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1508  recombination protein RecR  46.39 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0537537  normal  0.426443 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4901  recombination protein RecR  47.09 
 
 		 196 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2532  recombination protein RecR  43.81 
 
 		 197 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.200135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0894  recombination protein RecR  39.68 
 
 		 205 aa  169  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 199 aa  168  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2332  recombination protein RecR  48.15 
 
 		 196 aa  168  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  40.84 
 
 		 199 aa  169  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  44.5 
 
 		 199 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0367  recombination protein RecR  42.27 
 
 		 197 aa  168  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000104569  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  41.36 
 
 		 199 aa  168  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  40.82 
 
 		 199 aa  168  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0808  recombination protein RecR  48.15 
 
 		 199 aa  168  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000914779  hitchhiker  0.00000103011 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  44.44 
 
 		 199 aa  167  7e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  41.27 
 
 		 198 aa  167  8e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  41.58 
 
 		 198 aa  167  8e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  41.58 
 
 		 198 aa  167  8e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1849  recombination protein RecR  46.24 
 
 		 198 aa  167  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41197  normal  0.133584 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  43.39 
 
 		 199 aa  167  9e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1825  recombination protein RecR  46.24 
 
 		 198 aa  167  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>