More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4091 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_4091  recombination protein RecR  100 
 
 		 201 aa  403  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607523  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0032  recombination protein RecR  82.09 
 
 		 201 aa  339  1e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0840728  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0032  recombination protein RecR  82.09 
 
 		 232 aa  337  5e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196759  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0023  recombination protein RecR  81.09 
 
 		 201 aa  335  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.622257  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4074  recombination protein RecR  77.11 
 
 		 201 aa  333  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0156  recombination protein RecR  78.39 
 
 		 201 aa  331  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4394  recombination protein RecR  76.62 
 
 		 201 aa  331  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1240  recombination protein RecR  72.14 
 
 		 201 aa  317  6e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3435  recombination protein RecR  77.78 
 
 		 201 aa  314  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0276  recombination protein RecR  72.14 
 
 		 201 aa  301  3.0000000000000004e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4846  recombination protein RecR  68.66 
 
 		 201 aa  296  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0254  recombination protein RecR  69.65 
 
 		 201 aa  295  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0621  recombination protein RecR  69.39 
 
 		 200 aa  294  5e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990483  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0666  recombination protein RecR  67.66 
 
 		 201 aa  294  7e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.290354 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0085  recombination protein RecR  68.16 
 
 		 201 aa  293  8e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  0.0328355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7344  recombination protein RecR  70.56 
 
 		 199 aa  293  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3145  recombination protein RecR  68.16 
 
 		 201 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216017  normal  0.38463 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0367  recombination protein RecR  66.67 
 
 		 201 aa  282  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0464  recombination protein RecR  66.5 
 
 		 200 aa  281  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0258  recombination protein RecR  69.04 
 
 		 199 aa  281  6.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4750  recombination protein RecR  68.16 
 
 		 201 aa  279  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1920  recombination protein RecR  67.66 
 
 		 201 aa  277  6e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.700264  normal  0.039212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1638  recombination protein RecR  67.66 
 
 		 201 aa  277  6e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0212504  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1594  recombination protein RecR  67.66 
 
 		 201 aa  276  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1839  recombination protein RecR  68.66 
 
 		 201 aa  268  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165637  normal  0.471383 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4241  recombination protein RecR  65.17 
 
 		 201 aa  268  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140476 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0437  DNA replication and repair protein RecR  64.82 
 
 		 201 aa  256  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.792606  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0250  recombination protein RecR  61.05 
 
 		 198 aa  251  4.0000000000000004e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4043  recombination protein RecR  61.86 
 
 		 198 aa  250  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4573  recombination protein RecR  62.18 
 
 		 200 aa  244  9e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3471  RecR protein  61.58 
 
 		 197 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177625  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0164  recombination protein RecR  61.05 
 
 		 199 aa  238  5e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0519  recombination protein RecR  60.1 
 
 		 199 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217217  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2895  recombination protein RecR  59.79 
 
 		 198 aa  237  6.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2367  recombination protein RecR  60.1 
 
 		 199 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.424518  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0712  recombination protein RecR  60.1 
 
 		 199 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3878  recombination protein RecR  57.51 
 
 		 199 aa  229  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.114118 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3647  recombination protein RecR  59.07 
 
 		 199 aa  226  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.664913  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0648  recombination protein RecR  56.48 
 
 		 199 aa  222  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0126117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2911  recombination protein RecR  57.73 
 
 		 197 aa  213  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0675697 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0245  recombination protein RecR  47.37 
 
 		 195 aa  211  7.999999999999999e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0727285  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1180  recombination protein RecR  46.35 
 
 		 201 aa  207  8e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0843  recombination protein RecR  47.37 
 
 		 195 aa  206  1e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1998  recombination protein RecR  56.99 
 
 		 196 aa  205  4e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0899  recombination protein RecR  47.92 
 
 		 196 aa  200  9.999999999999999e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213296  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  46.03 
 
 		 200 aa  191  8e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  48.68 
 
 		 199 aa  190  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  47.4 
 
 		 199 aa  188  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  47.64 
 
 		 199 aa  188  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  45.5 
 
 		 199 aa  188  5.999999999999999e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  47.62 
 
 		 199 aa  187  8e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  47.09 
 
 		 199 aa  184  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  45.79 
 
 		 198 aa  184  6e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  45.79 
 
 		 198 aa  184  6e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  46.03 
 
 		 199 aa  184  7e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  46.03 
 
 		 204 aa  184  7e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  46.03 
 
 		 199 aa  184  9e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  45.83 
 
 		 199 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1460  recombination protein RecR  46.91 
 
 		 203 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2791  recombination protein RecR  46.39 
 
 		 201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0094882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  46.56 
 
 		 199 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  47.12 
 
 		 197 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  44.97 
 
 		 199 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  46.6 
 
 		 197 aa  181  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  49.2 
 
 		 198 aa  181  8.000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  46.88 
 
 		 199 aa  181  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  47.09 
 
 		 202 aa  180  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3124  recombination protein RecR  46.56 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0192329  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0386  recombination protein RecR  42.71 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.147094  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  43.75 
 
 		 199 aa  178  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  44.5 
 
 		 199 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0268  recombination protein RecR  44.97 
 
 		 199 aa  178  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  46.03 
 
 		 199 aa  178  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  43.23 
 
 		 198 aa  177  7e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  46.03 
 
 		 199 aa  177  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  48.66 
 
 		 198 aa  177  7e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  44.5 
 
 		 200 aa  177  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  44.44 
 
 		 199 aa  177  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000716421  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28430  DNA replication and repair protein RecR  44.5 
 
 		 197 aa  177  9e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  42.19 
 
 		 198 aa  177  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3693  recombination protein RecR  46.91 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2532  recombination protein RecR  46.07 
 
 		 197 aa  176  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.200135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1611  recombination protein RecR  45.55 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315975  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3776  recombination protein RecR  46.91 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0326868  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  43.59 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6566  recombination protein RecR  43.92 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00960042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  42.33 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  43.88 
 
 		 200 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 199 aa  176  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6868  recombination protein RecR  42.64 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.296067 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3635  recombination protein RecR  46.39 
 
 		 198 aa  175  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0682949  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  42.05 
 
 		 198 aa  174  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  42.05 
 
 		 198 aa  174  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1337  recombinational DNA repair protein  42.93 
 
 		 197 aa  174  9e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.43328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0673  recombination protein RecR  47.15 
 
 		 202 aa  174  9e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  43.92 
 
 		 200 aa  174  9e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  42.05 
 
 		 198 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3420  recombination protein RecR  46.28 
 
 		 197 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000418809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0479  recombination protein RecR  45.79 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0004265  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1728  recombination protein RecR  44.5 
 
 		 195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000187366  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>