More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1998 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1998  recombination protein RecR  100 
 
 		 196 aa  377  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0258  recombination protein RecR  58.97 
 
 		 199 aa  233  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3471  RecR protein  62.05 
 
 		 197 aa  223  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177625  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4573  recombination protein RecR  61.03 
 
 		 200 aa  222  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4846  recombination protein RecR  59.38 
 
 		 201 aa  220  9e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7344  recombination protein RecR  58.33 
 
 		 199 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0254  recombination protein RecR  59.28 
 
 		 201 aa  218  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0666  recombination protein RecR  58.33 
 
 		 201 aa  217  7e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.290354 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0085  recombination protein RecR  58.33 
 
 		 201 aa  217  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  0.0328355 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4091  recombination protein RecR  57.14 
 
 		 201 aa  214  8e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607523  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0621  recombination protein RecR  58.33 
 
 		 200 aa  214  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990483  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4750  recombination protein RecR  57.73 
 
 		 201 aa  214  9e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0367  recombination protein RecR  58.25 
 
 		 201 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_004310  BR0032  recombination protein RecR  56.19 
 
 		 201 aa  211  5.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0840728  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0023  recombination protein RecR  56.19 
 
 		 201 aa  211  5.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.622257  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0464  recombination protein RecR  56.25 
 
 		 200 aa  211  7e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0032  recombination protein RecR  56.77 
 
 		 232 aa  209  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196759  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1638  recombination protein RecR  56.19 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0212504  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1920  recombination protein RecR  56.19 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.700264  normal  0.039212 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2911  recombination protein RecR  58.88 
 
 		 197 aa  209  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0675697 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3145  recombination protein RecR  56.7 
 
 		 201 aa  207  6e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216017  normal  0.38463 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0250  recombination protein RecR  55.05 
 
 		 198 aa  207  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0276  recombination protein RecR  56.77 
 
 		 201 aa  206  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0437  DNA replication and repair protein RecR  56.25 
 
 		 201 aa  206  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.792606  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1594  recombination protein RecR  55.67 
 
 		 201 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4241  recombination protein RecR  55.67 
 
 		 201 aa  203  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4043  recombination protein RecR  54.87 
 
 		 198 aa  203  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0156  recombination protein RecR  54.12 
 
 		 201 aa  202  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4074  recombination protein RecR  52.58 
 
 		 201 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1240  recombination protein RecR  52.06 
 
 		 201 aa  201  5e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4394  recombination protein RecR  52.58 
 
 		 201 aa  200  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2895  recombination protein RecR  55.05 
 
 		 198 aa  194  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0843  recombination protein RecR  46.84 
 
 		 195 aa  194  7e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3435  recombination protein RecR  54.05 
 
 		 201 aa  191  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0245  recombination protein RecR  45.26 
 
 		 195 aa  191  6e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0727285  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3878  recombination protein RecR  52.6 
 
 		 199 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.114118 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1839  recombination protein RecR  56.77 
 
 		 201 aa  188  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165637  normal  0.471383 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0519  recombination protein RecR  55.5 
 
 		 199 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217217  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0648  recombination protein RecR  53.65 
 
 		 199 aa  186  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0126117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2367  recombination protein RecR  54.45 
 
 		 199 aa  184  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.424518  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0712  recombination protein RecR  54.45 
 
 		 199 aa  184  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3647  recombination protein RecR  54.4 
 
 		 199 aa  184  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.664913  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_002978  WD1180  recombination protein RecR  43.81 
 
 		 201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0164  recombination protein RecR  52.33 
 
 		 199 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0899  recombination protein RecR  46.15 
 
 		 196 aa  181  5.0000000000000004e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213296  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  46.88 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  45.31 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1853  recombination protein RecR  48.97 
 
 		 196 aa  164  8e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.38333 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  45.55 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  47.64 
 
 		 199 aa  161  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1153  recombination protein RecR  50.8 
 
 		 195 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.332903 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  45.92 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0127  recombination protein RecR  43.98 
 
 		 202 aa  157  7e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1719  recombination protein RecR  38.1 
 
 		 194 aa  157  8e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3124  recombination protein RecR  48.42 
 
 		 199 aa  157  8e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0192329  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  46.63 
 
 		 200 aa  157  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  42.35 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  42.35 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  42.35 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  42.35 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  42.35 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  42.35 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  42.35 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  42.35 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  42.35 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  45.26 
 
 		 199 aa  155  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  45.08 
 
 		 199 aa  155  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1337  recombinational DNA repair protein  42.56 
 
 		 197 aa  155  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.43328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  42.35 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  41.33 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0953  recombination protein RecR  46.28 
 
 		 198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0143869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  43.75 
 
 		 200 aa  154  6e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  41.33 
 
 		 198 aa  154  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2532  recombination protein RecR  44.62 
 
 		 197 aa  154  9e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.200135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1075  recombination protein RecR  45.13 
 
 		 197 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0531  recombination protein RecR  40.82 
 
 		 197 aa  154  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0553702  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0268  recombination protein RecR  45.26 
 
 		 199 aa  153  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1460  recombination protein RecR  46.63 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  41.49 
 
 		 198 aa  153  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  41.49 
 
 		 198 aa  153  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  45.26 
 
 		 199 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  43.01 
 
 		 199 aa  152  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0230  recombination protein RecR  45.83 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.601647  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0376  recombination protein RecR  43.3 
 
 		 199 aa  153  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000959909  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  40 
 
 		 199 aa  153  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  45.74 
 
 		 198 aa  152  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  44.21 
 
 		 199 aa  153  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  45.6 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  44.21 
 
 		 199 aa  153  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2242  recombination protein RecR  46.07 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0434311  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2204  recombination protein RecR  46.07 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0167487  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0367  recombination protein RecR  43.68 
 
 		 197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000104569  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1359  recombination protein RecR  46.07 
 
 		 200 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.604607  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2371  recombination protein RecR  46.07 
 
 		 202 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6566  recombination protein RecR  43.16 
 
 		 199 aa  152  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00960042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1121  recombination protein RecR  46.07 
 
 		 200 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1849  recombination protein RecR  46.07 
 
 		 200 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00281563  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0047  recombination protein RecR  46.07 
 
 		 200 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.612857  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1849  recombination protein RecR  46.28 
 
 		 198 aa  151  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41197  normal  0.133584 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1825  recombination protein RecR  46.28 
 
 		 198 aa  151  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>