More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4043 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4043  recombination protein RecR  100 
 
 		 198 aa  393  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0250  recombination protein RecR  80.71 
 
 		 198 aa  333  1e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2895  recombination protein RecR  77.16 
 
 		 198 aa  304  7e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0032  recombination protein RecR  64.43 
 
 		 201 aa  253  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0840728  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0254  recombination protein RecR  62.37 
 
 		 201 aa  252  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0276  recombination protein RecR  64.95 
 
 		 201 aa  252  3e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0023  recombination protein RecR  64.43 
 
 		 201 aa  252  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.622257  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4091  recombination protein RecR  61.86 
 
 		 201 aa  250  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607523  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0032  recombination protein RecR  63.92 
 
 		 232 aa  249  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196759  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1240  recombination protein RecR  60.82 
 
 		 201 aa  247  7e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4074  recombination protein RecR  61.34 
 
 		 201 aa  245  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0258  recombination protein RecR  60.71 
 
 		 199 aa  244  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7344  recombination protein RecR  58.76 
 
 		 199 aa  244  6.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0156  recombination protein RecR  60.82 
 
 		 201 aa  243  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4846  recombination protein RecR  59.79 
 
 		 201 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0621  recombination protein RecR  58.55 
 
 		 200 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990483  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4394  recombination protein RecR  59.79 
 
 		 201 aa  241  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0666  recombination protein RecR  57.73 
 
 		 201 aa  240  9e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.290354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4750  recombination protein RecR  59.79 
 
 		 201 aa  240  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3471  RecR protein  61.42 
 
 		 197 aa  239  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177625  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0085  recombination protein RecR  57.73 
 
 		 201 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  0.0328355 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1594  recombination protein RecR  58.76 
 
 		 201 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3435  recombination protein RecR  61.62 
 
 		 201 aa  237  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4573  recombination protein RecR  60 
 
 		 200 aa  235  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4241  recombination protein RecR  57.73 
 
 		 201 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140476 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3145  recombination protein RecR  57.73 
 
 		 201 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216017  normal  0.38463 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0464  recombination protein RecR  57.14 
 
 		 200 aa  232  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1638  recombination protein RecR  56.7 
 
 		 201 aa  231  6e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0212504  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1920  recombination protein RecR  56.7 
 
 		 201 aa  231  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.700264  normal  0.039212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0367  recombination protein RecR  58.25 
 
 		 201 aa  231  6e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0164  recombination protein RecR  57.95 
 
 		 199 aa  225  3e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0437  DNA replication and repair protein RecR  59.18 
 
 		 201 aa  225  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.792606  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2367  recombination protein RecR  59.16 
 
 		 199 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.424518  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0712  recombination protein RecR  59.16 
 
 		 199 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3878  recombination protein RecR  57.14 
 
 		 199 aa  220  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.114118 
 
 
-
 
NC_002978  WD1180  recombination protein RecR  48.95 
 
 		 201 aa  218  6e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0519  recombination protein RecR  58.12 
 
 		 199 aa  216  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217217  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3647  recombination protein RecR  58.64 
 
 		 199 aa  216  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.664913  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1839  recombination protein RecR  56.7 
 
 		 201 aa  208  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165637  normal  0.471383 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0648  recombination protein RecR  54.97 
 
 		 199 aa  207  8e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0126117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0899  recombination protein RecR  47.67 
 
 		 196 aa  202  2e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213296  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0245  recombination protein RecR  44.33 
 
 		 195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0727285  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0843  recombination protein RecR  43.81 
 
 		 195 aa  197  7.999999999999999e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2911  recombination protein RecR  53.06 
 
 		 197 aa  194  8.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0675697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1998  recombination protein RecR  53.76 
 
 		 196 aa  193  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  45.79 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  47.03 
 
 		 199 aa  182  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  46.15 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  45.64 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  45.64 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  46.15 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  44.62 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  43.59 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  46.67 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0894  recombination protein RecR  40.1 
 
 		 205 aa  175  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  42.11 
 
 		 199 aa  174  7e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0673  recombination protein RecR  47.15 
 
 		 202 aa  174  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0667  recombination protein RecR  43.72 
 
 		 201 aa  173  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0773  recombination protein RecR  43.72 
 
 		 201 aa  173  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1728  recombination protein RecR  43.3 
 
 		 195 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000187366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  44.16 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  42.93 
 
 		 204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  46.15 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  45.13 
 
 		 199 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  42.56 
 
 		 198 aa  171  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  42.56 
 
 		 198 aa  171  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1853  recombination protein RecR  45.55 
 
 		 196 aa  171  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.38333 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  44.78 
 
 		 200 aa  171  6.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28430  DNA replication and repair protein RecR  44.27 
 
 		 197 aa  171  6.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  44.85 
 
 		 198 aa  171  7.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1337  recombinational DNA repair protein  41.12 
 
 		 197 aa  171  9e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.43328  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  42.05 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  42.56 
 
 		 199 aa  171  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1153  recombination protein RecR  48.47 
 
 		 195 aa  170  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.332903 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2532  recombination protein RecR  42.13 
 
 		 197 aa  169  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.200135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  43.08 
 
 		 197 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6868  recombination protein RecR  45.05 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.296067 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  43.08 
 
 		 197 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  43.23 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  44.62 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  44.1 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0479  recombination protein RecR  42.64 
 
 		 199 aa  169  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0004265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  44.1 
 
 		 199 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  43.15 
 
 		 199 aa  168  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36550  recombination protein RecR  45.55 
 
 		 198 aa  168  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  44.62 
 
 		 200 aa  168  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07580  recombination protein RecR  39.29 
 
 		 205 aa  167  7e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1574  recombination protein RecR  41.33 
 
 		 199 aa  167  8e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  unclonable  0.000000162046 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  41.92 
 
 		 198 aa  167  9e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  41.03 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  41.84 
 
 		 198 aa  166  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0203  recombination protein RecR  44.9 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0268  recombination protein RecR  43.01 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1460  recombination protein RecR  44.39 
 
 		 203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  41.92 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  41.33 
 
 		 198 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  44.1 
 
 		 199 aa  165  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0103  recombination protein RecR  46.63 
 
 		 205 aa  165  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  41.92 
 
 		 198 aa  165  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  41.92 
 
 		 198 aa  165  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>