More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0103 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0103  recombination protein RecR  100 
 
 		 205 aa  394  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  56.48 
 
 		 199 aa  209  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  57.89 
 
 		 199 aa  207  8e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  56.32 
 
 		 199 aa  206  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  56.84 
 
 		 199 aa  204  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  53.68 
 
 		 199 aa  203  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  54.64 
 
 		 199 aa  202  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  55.79 
 
 		 199 aa  203  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  51.03 
 
 		 199 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3124  recombination protein RecR  56.15 
 
 		 199 aa  201  5e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0192329  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  53.09 
 
 		 198 aa  201  5e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  54.21 
 
 		 199 aa  201  8e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36550  recombination protein RecR  55.85 
 
 		 198 aa  201  8e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  54.4 
 
 		 199 aa  201  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  55.61 
 
 		 204 aa  200  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  55.85 
 
 		 199 aa  200  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  53.48 
 
 		 199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  56.38 
 
 		 199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  56.15 
 
 		 202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  54.97 
 
 		 199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  50 
 
 		 197 aa  197  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  50 
 
 		 197 aa  197  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  54.21 
 
 		 199 aa  197  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1399  recombination protein RecR  50.26 
 
 		 192 aa  197  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.612922  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1639  DNA replication and repair protein RecR  50.27 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0673  recombination protein RecR  54.45 
 
 		 202 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  50.79 
 
 		 189 aa  195  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0268  recombination protein RecR  54.55 
 
 		 199 aa  194  6e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1416  recombination protein RecR  51.1 
 
 		 182 aa  194  9e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.48434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6566  recombination protein RecR  54.26 
 
 		 199 aa  192  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00960042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2253  recombination protein RecR  50.81 
 
 		 185 aa  192  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00314078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0479  recombination protein RecR  54.45 
 
 		 199 aa  191  9e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0004265  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0254  recombination protein RecR  53.48 
 
 		 197 aa  190  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136191  hitchhiker  0.0016505 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4182  recombination protein RecR  49.48 
 
 		 205 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1369  recombination protein RecR  51.85 
 
 		 211 aa  190  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10891  RecR protein  48.9 
 
 		 182 aa  188  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.683026  normal  0.323303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6148  recombination protein RecR  53.68 
 
 		 199 aa  188  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  46.19 
 
 		 199 aa  188  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0792  recombination protein RecR  44.78 
 
 		 201 aa  188  5e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  51.87 
 
 		 199 aa  187  9e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0605  recombination protein RecR  48.97 
 
 		 198 aa  187  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.813504 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0048  recombination protein RecR  45.69 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28430  DNA replication and repair protein RecR  50.8 
 
 		 197 aa  186  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0203  recombination protein RecR  51.58 
 
 		 197 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  47.92 
 
 		 198 aa  185  3e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11881  recombination protein RecR  43.59 
 
 		 199 aa  185  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12041  recombination protein RecR  43.72 
 
 		 199 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0651  DNA replication and repair protein RecR  48.63 
 
 		 182 aa  185  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121722  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  45.23 
 
 		 199 aa  185  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09731  recombination protein RecR  50.54 
 
 		 189 aa  185  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12031  recombination protein RecR  44.27 
 
 		 199 aa  185  4e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14831  RecR protein  48.63 
 
 		 182 aa  185  5e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.409588 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  46.7 
 
 		 198 aa  184  6e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1108  recombination protein RecR  43.22 
 
 		 199 aa  184  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425444  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0215  recombination protein RecR  51.34 
 
 		 197 aa  184  9e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  47.89 
 
 		 200 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  46.52 
 
 		 199 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  52.82 
 
 		 198 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5271  recombination protein RecR  52.6 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4903  recombination protein RecR  52.6 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4992  recombination protein RecR  52.6 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19850  recombination protein RecR  51.01 
 
 		 199 aa  182  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3693  recombination protein RecR  51.32 
 
 		 198 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1460  recombination protein RecR  50.76 
 
 		 203 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3776  recombination protein RecR  51.32 
 
 		 198 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0326868  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1549  recombination protein RecR  48.44 
 
 		 195 aa  181  5.0000000000000004e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00118167  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  52.11 
 
 		 203 aa  181  7e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  47.72 
 
 		 199 aa  181  8.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2532  recombination protein RecR  48.98 
 
 		 197 aa  181  9.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.200135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0230  recombination protein RecR  47.5 
 
 		 201 aa  180  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.601647  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  45.08 
 
 		 198 aa  180  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1719  recombination protein RecR  41.75 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3233  recombination protein RecR  48.21 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00290146  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1078  recombination protein RecR  48.21 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00501486  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13747  recombination protein RecR  50.52 
 
 		 203 aa  179  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.24685  normal  0.507184 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  47.45 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3635  recombination protein RecR  50.26 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0682949  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  45.08 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2791  recombination protein RecR  47.18 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0094882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  48.68 
 
 		 200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1973  recombination protein RecR  44.72 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0127  recombination protein RecR  47.06 
 
 		 202 aa  179  4e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1189  recombination protein RecR  48.45 
 
 		 204 aa  178  4e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00843682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0052  recombination protein RecR  48.21 
 
 		 198 aa  178  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011836  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  44.9 
 
 		 198 aa  179  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  44.9 
 
 		 198 aa  179  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7344  recombination protein RecR  47.42 
 
 		 199 aa  177  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44610  recombination protein RecR  51.01 
 
 		 198 aa  177  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.235567 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0876  recombination protein RecR  45.05 
 
 		 205 aa  177  8e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236208  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  45.99 
 
 		 199 aa  177  9e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000716421  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  44.56 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  44.56 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  44.56 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  44.56 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0800  recombination protein RecR  45.6 
 
 		 197 aa  177  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.924037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  44.56 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  48.66 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  43.75 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  44.56 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  43.75 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>