More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1399 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1399  recombination protein RecR  100 
 
 		 192 aa  389  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.612922  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1639  DNA replication and repair protein RecR  84.82 
 
 		 219 aa  339  1e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09731  recombination protein RecR  81.38 
 
 		 189 aa  315  3e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  65.62 
 
 		 197 aa  287  6e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  65.62 
 
 		 197 aa  287  8e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14831  RecR protein  74.18 
 
 		 182 aa  285  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.409588 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10891  RecR protein  74.18 
 
 		 182 aa  283  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.683026  normal  0.323303 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0651  DNA replication and repair protein RecR  73.63 
 
 		 182 aa  282  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121722  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  65.62 
 
 		 199 aa  280  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4182  recombination protein RecR  64.47 
 
 		 205 aa  280  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12041  recombination protein RecR  65.1 
 
 		 199 aa  275  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1108  recombination protein RecR  64.58 
 
 		 199 aa  274  7e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425444  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12031  recombination protein RecR  64.06 
 
 		 199 aa  272  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11881  recombination protein RecR  64.89 
 
 		 199 aa  270  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2253  recombination protein RecR  64.86 
 
 		 185 aa  268  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00314078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  62.43 
 
 		 189 aa  265  4e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1416  recombination protein RecR  62.64 
 
 		 182 aa  263  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.48434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1369  recombination protein RecR  64.4 
 
 		 211 aa  250  9.000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  52.08 
 
 		 198 aa  216  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  52.08 
 
 		 198 aa  216  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  50.52 
 
 		 198 aa  213  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  49.48 
 
 		 199 aa  213  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  53.65 
 
 		 198 aa  213  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  51.58 
 
 		 199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000716421  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  47.4 
 
 		 199 aa  212  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  50.53 
 
 		 200 aa  211  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0894  recombination protein RecR  49.74 
 
 		 205 aa  211  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0094  recombination protein RecR  52.6 
 
 		 199 aa  211  7e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.427132  hitchhiker  0.00000395528 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0673  recombination protein RecR  52.88 
 
 		 202 aa  209  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  50 
 
 		 199 aa  209  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  52.63 
 
 		 199 aa  209  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  50.53 
 
 		 199 aa  207  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  53.44 
 
 		 200 aa  207  6e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  50.53 
 
 		 199 aa  207  9e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  52.48 
 
 		 215 aa  206  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  51.04 
 
 		 198 aa  206  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  52.11 
 
 		 199 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0268  recombination protein RecR  52.41 
 
 		 199 aa  205  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  50.78 
 
 		 199 aa  204  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  48.44 
 
 		 199 aa  204  6e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  51.05 
 
 		 199 aa  203  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  50 
 
 		 199 aa  202  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  49.47 
 
 		 198 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  49.47 
 
 		 198 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  49.47 
 
 		 198 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  50.27 
 
 		 198 aa  202  2e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  49.47 
 
 		 198 aa  203  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  49.47 
 
 		 198 aa  203  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  49.47 
 
 		 198 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  49.47 
 
 		 198 aa  203  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6566  recombination protein RecR  51.34 
 
 		 199 aa  202  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00960042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  51.34 
 
 		 202 aa  203  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  48.95 
 
 		 198 aa  202  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  48.96 
 
 		 198 aa  202  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  49.47 
 
 		 198 aa  202  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  49.47 
 
 		 199 aa  202  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  48.95 
 
 		 198 aa  202  3e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  51.05 
 
 		 199 aa  202  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  50.8 
 
 		 199 aa  202  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0605  recombination protein RecR  49.47 
 
 		 198 aa  201  4e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.813504 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  49.47 
 
 		 198 aa  201  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  49.47 
 
 		 198 aa  201  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  50.53 
 
 		 199 aa  202  4e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3124  recombination protein RecR  51.87 
 
 		 199 aa  201  5e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0192329  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  47.62 
 
 		 198 aa  201  5e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  47.62 
 
 		 198 aa  201  5e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  48.68 
 
 		 199 aa  201  6e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2171  recombination protein RecR  49.21 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  49.73 
 
 		 199 aa  199  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  50.26 
 
 		 199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0479  recombination protein RecR  48.95 
 
 		 199 aa  198  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0004265  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3924  recombination protein RecR  51.04 
 
 		 204 aa  199  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00096202  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  50.27 
 
 		 199 aa  199  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2905  recombination protein RecR  48.5 
 
 		 204 aa  198  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1513  recombination protein RecR  52.41 
 
 		 222 aa  198  5e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0279848  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  50.27 
 
 		 204 aa  197  6e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36550  recombination protein RecR  50 
 
 		 198 aa  196  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0103  recombination protein RecR  50.26 
 
 		 205 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  47.4 
 
 		 199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  50.52 
 
 		 198 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  48.66 
 
 		 199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1189  recombination protein RecR  50.52 
 
 		 204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00843682  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3028  recombination protein RecR  48.13 
 
 		 205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303727 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  48.96 
 
 		 203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28430  DNA replication and repair protein RecR  48.68 
 
 		 197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0052  recombination protein RecR  50.53 
 
 		 198 aa  195  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1600  recombination protein RecR  47.92 
 
 		 203 aa  195  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.351131 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  47.87 
 
 		 200 aa  194  5.000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0203  recombination protein RecR  50 
 
 		 197 aa  194  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1144  recombination protein RecR  47.4 
 
 		 201 aa  194  7e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0987935  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  47.92 
 
 		 198 aa  194  8.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0883  recombination protein RecR  49.23 
 
 		 204 aa  194  8.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254341  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0876  recombination protein RecR  50.26 
 
 		 205 aa  193  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236208  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1719  recombination protein RecR  45.31 
 
 		 194 aa  193  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07580  recombination protein RecR  45.08 
 
 		 205 aa  192  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1172  recombination protein RecR  49.49 
 
 		 205 aa  192  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000693632  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0254  recombination protein RecR  46.56 
 
 		 197 aa  192  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136191  hitchhiker  0.0016505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0215  recombination protein RecR  46.56 
 
 		 197 aa  190  9e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0625  recombination protein RecR  47.57 
 
 		 200 aa  190  9e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0583  recombination protein RecR  47.34 
 
 		 204 aa  189  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>