More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1719 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1719  recombination protein RecR  100 
 
 
194 aa  380  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0414  recombination protein RecR  55.5 
 
 
195 aa  222  3e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  51.3 
 
 
199 aa  219  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  50.52 
 
 
198 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  48.19 
 
 
199 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  48.44 
 
 
199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  50 
 
 
198 aa  210  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  49.22 
 
 
199 aa  210  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  47.94 
 
 
198 aa  209  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  47.94 
 
 
198 aa  209  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  47.94 
 
 
198 aa  209  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  47.94 
 
 
198 aa  209  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  47.94 
 
 
198 aa  209  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  47.94 
 
 
198 aa  209  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  47.94 
 
 
198 aa  209  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  47.94 
 
 
198 aa  209  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  48.45 
 
 
198 aa  209  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  47.94 
 
 
198 aa  209  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  47.94 
 
 
198 aa  209  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  49.74 
 
 
204 aa  208  3e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  48.42 
 
 
199 aa  208  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  48.44 
 
 
198 aa  207  6e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  48.44 
 
 
198 aa  207  6e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  45.55 
 
 
199 aa  207  7e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  47.67 
 
 
199 aa  206  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000716421  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  46.91 
 
 
198 aa  206  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  45.6 
 
 
199 aa  206  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  45.03 
 
 
199 aa  205  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  46.39 
 
 
198 aa  204  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  46.39 
 
 
198 aa  204  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  44.85 
 
 
199 aa  204  9e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  44.79 
 
 
199 aa  203  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6566  recombination protein RecR  47.37 
 
 
199 aa  202  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00960042  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  47.89 
 
 
199 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  50 
 
 
199 aa  203  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  45.6 
 
 
199 aa  202  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  46.07 
 
 
199 aa  201  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0883  recombination protein RecR  47.98 
 
 
204 aa  201  6e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254341  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1189  recombination protein RecR  48.72 
 
 
204 aa  201  8e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00843682  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  47.15 
 
 
197 aa  200  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  47.94 
 
 
198 aa  200  9e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  45.83 
 
 
200 aa  200  9e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  45.6 
 
 
198 aa  200  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3124  recombination protein RecR  44.04 
 
 
199 aa  199  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0192329  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28430  DNA replication and repair protein RecR  46.35 
 
 
197 aa  200  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  46.35 
 
 
199 aa  200  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  45.6 
 
 
199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  46.63 
 
 
197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36550  recombination protein RecR  46.11 
 
 
198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0268  recombination protein RecR  47.37 
 
 
199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  45.08 
 
 
199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4182  recombination protein RecR  44.44 
 
 
205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1175  recombination protein RecR  49.23 
 
 
204 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000261474  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  47.42 
 
 
199 aa  199  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0792  recombination protein RecR  48.97 
 
 
201 aa  198  3.9999999999999996e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1284  recombination protein RecR  46.46 
 
 
204 aa  198  5e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.722454  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  48.68 
 
 
200 aa  197  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0605  recombination protein RecR  45.88 
 
 
198 aa  197  6e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.813504 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1549  recombination protein RecR  46.88 
 
 
195 aa  197  7.999999999999999e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00118167  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  44.74 
 
 
199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4992  recombination protein RecR  44.95 
 
 
203 aa  195  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4903  recombination protein RecR  44.95 
 
 
203 aa  195  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149021  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  44.5 
 
 
202 aa  195  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5271  recombination protein RecR  44.95 
 
 
203 aa  195  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139044  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0048  recombination protein RecR  45.83 
 
 
198 aa  195  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1639  DNA replication and repair protein RecR  45.36 
 
 
219 aa  194  5.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  42.93 
 
 
199 aa  194  5.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  44.68 
 
 
199 aa  194  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0876  recombination protein RecR  47.74 
 
 
205 aa  194  9e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236208  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1399  recombination protein RecR  45.31 
 
 
192 aa  193  1e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.612922  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0479  recombination protein RecR  42.49 
 
 
199 aa  193  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0004265  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0766  recombination protein RecR  47.62 
 
 
198 aa  192  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.290455  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  47.4 
 
 
200 aa  192  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13747  recombination protein RecR  45.92 
 
 
203 aa  193  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.24685  normal  0.507184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0203  recombination protein RecR  44.04 
 
 
197 aa  192  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1144  recombination protein RecR  46.63 
 
 
201 aa  192  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0987935  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  41.55 
 
 
215 aa  192  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  44.33 
 
 
203 aa  192  3e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6148  recombination protein RecR  44.56 
 
 
199 aa  191  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0094  recombination protein RecR  47.4 
 
 
199 aa  191  7e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.427132  hitchhiker  0.00000395528 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0052  recombination protein RecR  43.52 
 
 
198 aa  190  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011836  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1180  recombination protein RecR  47.69 
 
 
204 aa  190  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000222469  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0254  recombination protein RecR  43.52 
 
 
197 aa  190  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136191  hitchhiker  0.0016505 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  44.85 
 
 
198 aa  190  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  45.36 
 
 
198 aa  189  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1600  recombination protein RecR  43.81 
 
 
203 aa  189  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.351131 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0370  recombination protein RecR  45.26 
 
 
199 aa  189  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000133419 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1288  recombination protein RecR  43.94 
 
 
203 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404677  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5527  recombination protein RecR  43.94 
 
 
203 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0215  recombination protein RecR  43.52 
 
 
197 aa  188  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0673  recombination protein RecR  41.75 
 
 
202 aa  188  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1369  recombination protein RecR  44.33 
 
 
211 aa  187  5.999999999999999e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09731  recombination protein RecR  44.44 
 
 
189 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  43.92 
 
 
189 aa  187  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10891  RecR protein  46.7 
 
 
182 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.683026  normal  0.323303 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1172  recombination protein RecR  45.23 
 
 
205 aa  187  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000693632  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  41.24 
 
 
198 aa  186  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0376  recombination protein RecR  45.08 
 
 
199 aa  186  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000959909  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1973  recombination protein RecR  42.27 
 
 
199 aa  186  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181253  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0386  recombination protein RecR  46.56 
 
 
198 aa  186  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.147094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>