More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0593 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  100 
 
 		 199 aa  407  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  86.29 
 
 		 197 aa  357  5e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  86.29 
 
 		 197 aa  357  6e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2253  recombination protein RecR  87.57 
 
 		 185 aa  338  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00314078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  84.66 
 
 		 189 aa  336  9.999999999999999e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4182  recombination protein RecR  79.7 
 
 		 205 aa  333  9e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1416  recombination protein RecR  80.77 
 
 		 182 aa  313  7e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.48434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1369  recombination protein RecR  78.06 
 
 		 211 aa  307  5e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1639  DNA replication and repair protein RecR  67.88 
 
 		 219 aa  291  5e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1399  recombination protein RecR  65.62 
 
 		 192 aa  280  7.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.612922  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09731  recombination protein RecR  64.89 
 
 		 189 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14831  RecR protein  65.38 
 
 		 182 aa  268  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.409588 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0651  DNA replication and repair protein RecR  65.38 
 
 		 182 aa  267  8e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121722  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12041  recombination protein RecR  59.69 
 
 		 199 aa  264  8e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12031  recombination protein RecR  59.18 
 
 		 199 aa  263  1e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10891  RecR protein  65.38 
 
 		 182 aa  263  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.683026  normal  0.323303 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1108  recombination protein RecR  58.16 
 
 		 199 aa  261  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425444  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11881  recombination protein RecR  60 
 
 		 199 aa  261  6e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  57.65 
 
 		 199 aa  238  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  54.31 
 
 		 199 aa  236  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  54.59 
 
 		 199 aa  235  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  56.78 
 
 		 199 aa  232  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  54.04 
 
 		 199 aa  230  9e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  54.59 
 
 		 198 aa  230  9e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  53.06 
 
 		 198 aa  229  1e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  53.03 
 
 		 199 aa  229  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  52.76 
 
 		 199 aa  229  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  53.57 
 
 		 199 aa  229  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000716421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  54.08 
 
 		 198 aa  228  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  54.08 
 
 		 198 aa  228  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  54.08 
 
 		 198 aa  228  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  54.08 
 
 		 198 aa  228  4e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  54.08 
 
 		 198 aa  228  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  54.08 
 
 		 198 aa  228  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  54.08 
 
 		 198 aa  228  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  54.08 
 
 		 198 aa  228  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  54.08 
 
 		 198 aa  227  8e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  52.04 
 
 		 198 aa  227  8e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  54.08 
 
 		 198 aa  227  8e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  52.04 
 
 		 198 aa  227  8e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  53.54 
 
 		 199 aa  227  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  53.57 
 
 		 198 aa  226  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  55.45 
 
 		 215 aa  226  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  53.57 
 
 		 198 aa  226  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  53.57 
 
 		 198 aa  225  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  53.54 
 
 		 199 aa  225  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  54.04 
 
 		 199 aa  224  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  52.53 
 
 		 199 aa  224  5.0000000000000005e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  52.26 
 
 		 199 aa  224  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  52.04 
 
 		 199 aa  222  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  52.31 
 
 		 199 aa  222  3e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0673  recombination protein RecR  51.26 
 
 		 202 aa  219  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  51.52 
 
 		 199 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  52.82 
 
 		 199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  54.08 
 
 		 200 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  52.55 
 
 		 198 aa  218  3.9999999999999997e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  52.06 
 
 		 198 aa  218  6e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  52.6 
 
 		 203 aa  216  1e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  52.11 
 
 		 200 aa  216  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3124  recombination protein RecR  52.28 
 
 		 199 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0192329  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  49.74 
 
 		 199 aa  214  5.9999999999999996e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  50 
 
 		 199 aa  214  5.9999999999999996e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1144  recombination protein RecR  52.6 
 
 		 201 aa  214  5.9999999999999996e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0987935  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  50.77 
 
 		 200 aa  214  7e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  52.31 
 
 		 199 aa  213  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3776  recombination protein RecR  54.92 
 
 		 198 aa  213  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0326868  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  51.28 
 
 		 199 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3693  recombination protein RecR  54.92 
 
 		 198 aa  213  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0052  recombination protein RecR  53.57 
 
 		 198 aa  211  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011836  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  50.77 
 
 		 204 aa  211  5.999999999999999e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0203  recombination protein RecR  50.51 
 
 		 197 aa  210  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6566  recombination protein RecR  49.23 
 
 		 199 aa  210  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00960042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  50.26 
 
 		 198 aa  209  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3635  recombination protein RecR  53.37 
 
 		 198 aa  209  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0682949  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0268  recombination protein RecR  49.74 
 
 		 199 aa  209  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1513  recombination protein RecR  51.53 
 
 		 222 aa  209  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0279848  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1973  recombination protein RecR  49.49 
 
 		 199 aa  209  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28430  DNA replication and repair protein RecR  47.72 
 
 		 197 aa  208  5e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0215  recombination protein RecR  48.72 
 
 		 197 aa  207  7e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  50.27 
 
 		 202 aa  207  8e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0605  recombination protein RecR  49.74 
 
 		 198 aa  207  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.813504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5291  recombination protein RecR  50.48 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6148  recombination protein RecR  48.21 
 
 		 199 aa  206  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  50.52 
 
 		 198 aa  205  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  50.52 
 
 		 198 aa  205  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  51.3 
 
 		 198 aa  205  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0386  recombination protein RecR  46.97 
 
 		 198 aa  206  3e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.147094  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0479  recombination protein RecR  46.46 
 
 		 199 aa  205  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0004265  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0792  recombination protein RecR  46.7 
 
 		 201 aa  205  4e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0094  recombination protein RecR  51.56 
 
 		 199 aa  204  5e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.427132  hitchhiker  0.00000395528 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0254  recombination protein RecR  46.7 
 
 		 197 aa  204  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136191  hitchhiker  0.0016505 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  48.74 
 
 		 199 aa  204  6e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0277  recombination protein RecR  48.74 
 
 		 213 aa  203  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0376  recombination protein RecR  46.94 
 
 		 199 aa  202  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000959909  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0103  recombination protein RecR  51.03 
 
 		 205 aa  202  3e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36550  recombination protein RecR  46.97 
 
 		 198 aa  202  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0370  recombination protein RecR  47.94 
 
 		 199 aa  202  3e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133419 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0663  recombination protein RecR  46.19 
 
 		 198 aa  201  4e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0143934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0894  recombination protein RecR  48.68 
 
 		 205 aa  201  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0766  recombination protein RecR  46.7 
 
 		 198 aa  201  7e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.290455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>