More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4074 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4074  recombination protein RecR  100 
 
 		 201 aa  403  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4394  recombination protein RecR  96.52 
 
 		 201 aa  394  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0156  recombination protein RecR  87.06 
 
 		 201 aa  360  6e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3435  recombination protein RecR  86.77 
 
 		 201 aa  343  7e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4091  recombination protein RecR  77.11 
 
 		 201 aa  333  7.999999999999999e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607523  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0032  recombination protein RecR  77.61 
 
 		 201 aa  327  5.0000000000000004e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0840728  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0023  recombination protein RecR  77.61 
 
 		 201 aa  327  9e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.622257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0032  recombination protein RecR  77.11 
 
 		 232 aa  325  3e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196759  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1240  recombination protein RecR  74.37 
 
 		 201 aa  308  2.9999999999999997e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0276  recombination protein RecR  70.35 
 
 		 201 aa  295  3e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0254  recombination protein RecR  68.84 
 
 		 201 aa  295  4e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0666  recombination protein RecR  69.15 
 
 		 201 aa  293  8e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.290354 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0621  recombination protein RecR  69.74 
 
 		 200 aa  293  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990483  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0085  recombination protein RecR  68.66 
 
 		 201 aa  293  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  0.0328355 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0367  recombination protein RecR  67.16 
 
 		 201 aa  288  4e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7344  recombination protein RecR  68.02 
 
 		 199 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4846  recombination protein RecR  66.67 
 
 		 201 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3145  recombination protein RecR  64.68 
 
 		 201 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216017  normal  0.38463 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0464  recombination protein RecR  68.72 
 
 		 200 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4750  recombination protein RecR  66.17 
 
 		 201 aa  278  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0258  recombination protein RecR  67.53 
 
 		 199 aa  277  9e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1638  recombination protein RecR  63.18 
 
 		 201 aa  275  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0212504  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4241  recombination protein RecR  65.67 
 
 		 201 aa  275  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140476 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1920  recombination protein RecR  63.18 
 
 		 201 aa  275  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.700264  normal  0.039212 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1594  recombination protein RecR  64.18 
 
 		 201 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1839  recombination protein RecR  66.33 
 
 		 201 aa  265  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165637  normal  0.471383 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0437  DNA replication and repair protein RecR  61.19 
 
 		 201 aa  247  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.792606  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4043  recombination protein RecR  61.34 
 
 		 198 aa  245  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0250  recombination protein RecR  57.37 
 
 		 198 aa  237  8e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0164  recombination protein RecR  60.1 
 
 		 199 aa  236  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2895  recombination protein RecR  60 
 
 		 198 aa  234  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4573  recombination protein RecR  57.81 
 
 		 200 aa  233  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3471  RecR protein  57.37 
 
 		 197 aa  228  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177625  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0712  recombination protein RecR  57.37 
 
 		 199 aa  228  4e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2367  recombination protein RecR  57.37 
 
 		 199 aa  228  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.424518  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0519  recombination protein RecR  56.84 
 
 		 199 aa  228  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217217  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3878  recombination protein RecR  55.96 
 
 		 199 aa  220  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.114118 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0648  recombination protein RecR  56.7 
 
 		 199 aa  218  6e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0126117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0245  recombination protein RecR  49.22 
 
 		 195 aa  216  2e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0727285  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2911  recombination protein RecR  57.81 
 
 		 197 aa  214  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0675697 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0899  recombination protein RecR  50.26 
 
 		 196 aa  211  7.999999999999999e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213296  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0843  recombination protein RecR  46.63 
 
 		 195 aa  210  1e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3647  recombination protein RecR  55.73 
 
 		 199 aa  209  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.664913  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_002978  WD1180  recombination protein RecR  48.15 
 
 		 201 aa  205  4e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1998  recombination protein RecR  51.61 
 
 		 196 aa  193  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  47.09 
 
 		 200 aa  194  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  46.94 
 
 		 199 aa  193  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  46.35 
 
 		 199 aa  189  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  47.12 
 
 		 200 aa  189  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  45.83 
 
 		 199 aa  187  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000716421  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  44.97 
 
 		 199 aa  186  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  45.83 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  45.83 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  47.59 
 
 		 198 aa  185  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  46.32 
 
 		 198 aa  184  6e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1460  recombination protein RecR  45.03 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2791  recombination protein RecR  44.85 
 
 		 201 aa  182  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0094882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  45.31 
 
 		 204 aa  181  5.0000000000000004e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  44.92 
 
 		 198 aa  181  9.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  47.4 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  43.75 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  43.52 
 
 		 198 aa  180  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  44.04 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  44.04 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  43.39 
 
 		 199 aa  178  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  44.44 
 
 		 199 aa  178  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12031  recombination protein RecR  44.21 
 
 		 199 aa  178  4e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  44.39 
 
 		 198 aa  178  4.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12041  recombination protein RecR  44.21 
 
 		 199 aa  177  8e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1175  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 204 aa  177  8e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000261474  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1108  recombination protein RecR  44.21 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425444  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  44.27 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2532  recombination protein RecR  46.07 
 
 		 197 aa  177  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.200135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0376  recombination protein RecR  42.41 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000959909  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0367  recombination protein RecR  44.04 
 
 		 197 aa  176  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000104569  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  43.52 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11881  recombination protein RecR  44.1 
 
 		 199 aa  175  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1611  recombination protein RecR  45.03 
 
 		 200 aa  175  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315975  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0876  recombination protein RecR  42.65 
 
 		 205 aa  175  4e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236208  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2777  recombination protein RecR  49.47 
 
 		 198 aa  175  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 199 aa  175  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  42.71 
 
 		 199 aa  174  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  43.52 
 
 		 198 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  43.52 
 
 		 198 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0766  recombination protein RecR  43.16 
 
 		 198 aa  173  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.290455  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  42.71 
 
 		 199 aa  173  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  43.52 
 
 		 198 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  43.52 
 
 		 198 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  43.52 
 
 		 198 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  43.52 
 
 		 198 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  43.37 
 
 		 198 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  43.52 
 
 		 198 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 199 aa  173  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1284  recombination protein RecR  41.29 
 
 		 204 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.722454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  41.67 
 
 		 198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  43.52 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  43.52 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  42.71 
 
 		 203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0386  recombination protein RecR  41.15 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.147094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>