More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1594 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1594  recombination protein RecR  100 
 
 		 201 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1920  recombination protein RecR  95.02 
 
 		 201 aa  384  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.700264  normal  0.039212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1638  recombination protein RecR  95.02 
 
 		 201 aa  384  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0212504  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3145  recombination protein RecR  87.06 
 
 		 201 aa  353  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216017  normal  0.38463 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4750  recombination protein RecR  83.08 
 
 		 201 aa  343  8.999999999999999e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4241  recombination protein RecR  81.59 
 
 		 201 aa  333  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140476 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0276  recombination protein RecR  72.14 
 
 		 201 aa  297  7e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0023  recombination protein RecR  69.65 
 
 		 201 aa  290  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.622257  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7344  recombination protein RecR  71.72 
 
 		 199 aa  290  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0085  recombination protein RecR  70.15 
 
 		 201 aa  288  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  0.0328355 
 
 
-
 
NC_004310  BR0032  recombination protein RecR  68.66 
 
 		 201 aa  288  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0840728  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0367  recombination protein RecR  70.65 
 
 		 201 aa  286  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4846  recombination protein RecR  69.15 
 
 		 201 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0666  recombination protein RecR  69.65 
 
 		 201 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.290354 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0621  recombination protein RecR  70.41 
 
 		 200 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990483  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0032  recombination protein RecR  68.16 
 
 		 232 aa  283  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196759  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0464  recombination protein RecR  68.69 
 
 		 200 aa  278  3e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0258  recombination protein RecR  68.69 
 
 		 199 aa  278  3e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4091  recombination protein RecR  67.66 
 
 		 201 aa  276  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607523  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0254  recombination protein RecR  67.16 
 
 		 201 aa  275  3e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0156  recombination protein RecR  66.83 
 
 		 201 aa  273  9e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4074  recombination protein RecR  64.18 
 
 		 201 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4394  recombination protein RecR  64.18 
 
 		 201 aa  271  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1240  recombination protein RecR  63.68 
 
 		 201 aa  270  9e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3435  recombination protein RecR  65.61 
 
 		 201 aa  259  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1839  recombination protein RecR  69.65 
 
 		 201 aa  255  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165637  normal  0.471383 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0437  DNA replication and repair protein RecR  64.82 
 
 		 201 aa  247  9e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.792606  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4573  recombination protein RecR  61.54 
 
 		 200 aa  241  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0712  recombination protein RecR  61.66 
 
 		 199 aa  239  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2367  recombination protein RecR  61.66 
 
 		 199 aa  239  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.424518  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4043  recombination protein RecR  58.76 
 
 		 198 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0250  recombination protein RecR  60 
 
 		 198 aa  238  4e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0519  recombination protein RecR  60.1 
 
 		 199 aa  235  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217217  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0164  recombination protein RecR  61.05 
 
 		 199 aa  231  7.000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0648  recombination protein RecR  59.09 
 
 		 199 aa  230  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0126117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2895  recombination protein RecR  57.73 
 
 		 198 aa  228  6e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3878  recombination protein RecR  58.03 
 
 		 199 aa  224  6e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.114118 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3471  RecR protein  59.47 
 
 		 197 aa  224  7e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177625  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3647  recombination protein RecR  57.44 
 
 		 199 aa  214  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.664913  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0899  recombination protein RecR  49.74 
 
 		 196 aa  201  6e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213296  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1998  recombination protein RecR  56.52 
 
 		 196 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0245  recombination protein RecR  45.26 
 
 		 195 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0727285  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1180  recombination protein RecR  44.56 
 
 		 201 aa  194  6e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0843  recombination protein RecR  44.74 
 
 		 195 aa  194  6e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2911  recombination protein RecR  54.64 
 
 		 197 aa  192  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0675697 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  40.74 
 
 		 199 aa  174  7e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  45.03 
 
 		 197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  45.03 
 
 		 197 aa  171  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  45.08 
 
 		 200 aa  170  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  42.19 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1144  recombination protein RecR  43.39 
 
 		 201 aa  168  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0987935  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  41.54 
 
 		 198 aa  168  6e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  43.98 
 
 		 199 aa  168  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6148  recombination protein RecR  44.09 
 
 		 199 aa  167  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1172  recombination protein RecR  42.42 
 
 		 205 aa  167  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000693632  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0673  recombination protein RecR  44.56 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  42.33 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  40.51 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  40.51 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  41.15 
 
 		 198 aa  165  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  43.39 
 
 		 199 aa  165  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  41.33 
 
 		 200 aa  165  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  42.71 
 
 		 199 aa  165  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  42.33 
 
 		 199 aa  165  5e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  41.59 
 
 		 215 aa  164  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  44.5 
 
 		 199 aa  165  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  43.23 
 
 		 199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  41.27 
 
 		 199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  44.09 
 
 		 189 aa  164  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2791  recombination protein RecR  43.3 
 
 		 201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0094882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  44.33 
 
 		 198 aa  162  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  40.62 
 
 		 198 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0510  DNA replication and repair protein RecR  46.03 
 
 		 199 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.186911  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  43.92 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3124  recombination protein RecR  44.44 
 
 		 199 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0192329  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  44.27 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  44.44 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  43.92 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1284  recombination protein RecR  43.37 
 
 		 204 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.722454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  43.39 
 
 		 199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  41.8 
 
 		 200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3776  recombination protein RecR  45.64 
 
 		 198 aa  161  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0326868  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6868  recombination protein RecR  41.03 
 
 		 201 aa  161  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.296067 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0876  recombination protein RecR  41.12 
 
 		 205 aa  160  8.000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236208  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0094  recombination protein RecR  42.33 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.427132  hitchhiker  0.00000395528 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0210  recombination protein RecR  44.68 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00238733  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0103  recombination protein RecR  44.33 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2253  recombination protein RecR  43.96 
 
 		 185 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00314078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0386  recombination protein RecR  40.62 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.147094  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0254  recombination protein RecR  41.88 
 
 		 197 aa  159  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136191  hitchhiker  0.0016505 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0052  recombination protein RecR  45.7 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011836  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0193  recombination protein RecR  44.21 
 
 		 197 aa  159  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.54722e-32 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0096  recombination protein RecR  41.58 
 
 		 197 aa  159  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1175  recombination protein RecR  39.49 
 
 		 204 aa  159  4e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000261474  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4182  recombination protein RecR  40.84 
 
 		 205 aa  158  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  39.68 
 
 		 199 aa  158  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3693  recombination protein RecR  45.13 
 
 		 198 aa  158  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09731  recombination protein RecR  43.39 
 
 		 189 aa  158  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3420  recombination protein RecR  42.55 
 
 		 197 aa  158  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000418809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0215  recombination protein RecR  42.33 
 
 		 197 aa  158  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>