More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0843 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0843  recombination protein RecR  100 
 
 
195 aa  401  1e-111  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0245  recombination protein RecR  93.33 
 
 
195 aa  381  1e-105  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0727285  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1180  recombination protein RecR  64.4 
 
 
201 aa  268  2.9999999999999997e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0258  recombination protein RecR  52.11 
 
 
199 aa  225  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7344  recombination protein RecR  48.44 
 
 
199 aa  218  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4846  recombination protein RecR  48.44 
 
 
201 aa  217  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0254  recombination protein RecR  50 
 
 
201 aa  214  5e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0085  recombination protein RecR  46.88 
 
 
201 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  0.0328355 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0156  recombination protein RecR  48.19 
 
 
201 aa  213  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0367  recombination protein RecR  47.4 
 
 
201 aa  211  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3471  RecR protein  47.15 
 
 
197 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177625  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0464  recombination protein RecR  47.37 
 
 
200 aa  211  5.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4074  recombination protein RecR  46.63 
 
 
201 aa  210  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0666  recombination protein RecR  45.83 
 
 
201 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.290354 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0621  recombination protein RecR  45.31 
 
 
200 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990483  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1240  recombination protein RecR  47.37 
 
 
201 aa  207  6e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0023  recombination protein RecR  46.11 
 
 
201 aa  207  8e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.622257  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0032  recombination protein RecR  46.11 
 
 
201 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0840728  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0276  recombination protein RecR  47.37 
 
 
201 aa  207  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4091  recombination protein RecR  47.37 
 
 
201 aa  206  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607523  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1839  recombination protein RecR  50 
 
 
201 aa  204  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165637  normal  0.471383 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4394  recombination protein RecR  45.08 
 
 
201 aa  204  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3145  recombination protein RecR  46.84 
 
 
201 aa  202  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216017  normal  0.38463 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0032  recombination protein RecR  45.6 
 
 
232 aa  202  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196759  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4573  recombination protein RecR  45.26 
 
 
200 aa  201  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0250  recombination protein RecR  43.68 
 
 
198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0519  recombination protein RecR  45.26 
 
 
199 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217217  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4043  recombination protein RecR  43.81 
 
 
198 aa  197  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0164  recombination protein RecR  47.37 
 
 
199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3435  recombination protein RecR  45.86 
 
 
201 aa  195  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2367  recombination protein RecR  44.74 
 
 
199 aa  195  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.424518  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0712  recombination protein RecR  44.74 
 
 
199 aa  195  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4750  recombination protein RecR  46.32 
 
 
201 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1920  recombination protein RecR  44.74 
 
 
201 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.700264  normal  0.039212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1638  recombination protein RecR  44.74 
 
 
201 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0212504  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1594  recombination protein RecR  44.74 
 
 
201 aa  194  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2911  recombination protein RecR  47.37 
 
 
197 aa  193  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0675697 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4241  recombination protein RecR  44.74 
 
 
201 aa  191  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140476 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2895  recombination protein RecR  42.11 
 
 
198 aa  189  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3647  recombination protein RecR  45.26 
 
 
199 aa  189  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.664913  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3878  recombination protein RecR  44.74 
 
 
199 aa  187  7e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.114118 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0437  DNA replication and repair protein RecR  44.04 
 
 
201 aa  187  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.792606  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0648  recombination protein RecR  43.68 
 
 
199 aa  186  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0126117  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1998  recombination protein RecR  46.15 
 
 
196 aa  184  6e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0899  recombination protein RecR  43.75 
 
 
196 aa  180  1e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213296  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  45.5 
 
 
200 aa  180  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  40.93 
 
 
199 aa  174  6e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  42.86 
 
 
199 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  43.09 
 
 
200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  42.33 
 
 
198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  42.33 
 
 
198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  42.33 
 
 
198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0376  recombination protein RecR  39.15 
 
 
199 aa  170  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000959909  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  40.74 
 
 
199 aa  169  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  43.23 
 
 
199 aa  169  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  42.86 
 
 
198 aa  168  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  40 
 
 
199 aa  168  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  42.86 
 
 
198 aa  167  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0127  recombination protein RecR  40.21 
 
 
202 aa  167  7e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  42.86 
 
 
198 aa  167  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  42.86 
 
 
198 aa  167  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  42.86 
 
 
198 aa  167  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  42.86 
 
 
198 aa  167  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  42.86 
 
 
198 aa  167  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  42.86 
 
 
198 aa  167  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  42.86 
 
 
198 aa  167  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  42.86 
 
 
198 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  42.86 
 
 
198 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  37.57 
 
 
200 aa  166  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  39.68 
 
 
200 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  41.8 
 
 
199 aa  164  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  38.62 
 
 
198 aa  164  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  41.27 
 
 
198 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  39.68 
 
 
198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4182  recombination protein RecR  39.9 
 
 
205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  39.68 
 
 
199 aa  162  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  36.1 
 
 
215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  40.74 
 
 
199 aa  161  6e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  41.27 
 
 
197 aa  160  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  37.57 
 
 
199 aa  160  8.000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  38.1 
 
 
199 aa  160  9e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  40.74 
 
 
197 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  40.21 
 
 
199 aa  160  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  39.68 
 
 
198 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1719  recombination protein RecR  40.21 
 
 
194 aa  159  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6566  recombination protein RecR  38.34 
 
 
199 aa  159  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00960042  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0792  recombination protein RecR  38.62 
 
 
201 aa  159  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  38.62 
 
 
199 aa  159  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0583  recombination protein RecR  39.15 
 
 
204 aa  159  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  37.82 
 
 
199 aa  159  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  41.15 
 
 
198 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  41.15 
 
 
198 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0268  recombination protein RecR  37.82 
 
 
199 aa  158  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  39.68 
 
 
199 aa  158  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1144  recombination protein RecR  40.21 
 
 
201 aa  158  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0987935  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  38.1 
 
 
203 aa  158  5e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1973  recombination protein RecR  35.83 
 
 
199 aa  158  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181253  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  38.1 
 
 
199 aa  158  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  37.82 
 
 
199 aa  158  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  39.06 
 
 
198 aa  158  6e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>