More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3145 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3145  recombination protein RecR  100 
 
 		 201 aa  400  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216017  normal  0.38463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1638  recombination protein RecR  88.56 
 
 		 201 aa  355  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0212504  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1920  recombination protein RecR  88.56 
 
 		 201 aa  355  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.700264  normal  0.039212 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1594  recombination protein RecR  87.06 
 
 		 201 aa  353  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4241  recombination protein RecR  85.07 
 
 		 201 aa  345  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4750  recombination protein RecR  85.07 
 
 		 201 aa  345  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0276  recombination protein RecR  74.63 
 
 		 201 aa  307  8e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0023  recombination protein RecR  70.65 
 
 		 201 aa  296  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.622257  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0254  recombination protein RecR  72.14 
 
 		 201 aa  294  5e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0032  recombination protein RecR  70.15 
 
 		 201 aa  293  9e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0840728  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7344  recombination protein RecR  71.72 
 
 		 199 aa  293  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0367  recombination protein RecR  70.65 
 
 		 201 aa  291  6e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0085  recombination protein RecR  71.14 
 
 		 201 aa  291  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  0.0328355 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0032  recombination protein RecR  69.65 
 
 		 232 aa  290  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196759  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0666  recombination protein RecR  70.65 
 
 		 201 aa  289  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.290354 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4846  recombination protein RecR  68.66 
 
 		 201 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0621  recombination protein RecR  70.41 
 
 		 200 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990483  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4074  recombination protein RecR  64.68 
 
 		 201 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0464  recombination protein RecR  69.19 
 
 		 200 aa  283  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4091  recombination protein RecR  68.16 
 
 		 201 aa  283  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607523  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4394  recombination protein RecR  65.67 
 
 		 201 aa  282  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1240  recombination protein RecR  64.18 
 
 		 201 aa  281  3.0000000000000004e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0258  recombination protein RecR  68.34 
 
 		 199 aa  277  6e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0156  recombination protein RecR  66.83 
 
 		 201 aa  276  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1839  recombination protein RecR  73.13 
 
 		 201 aa  268  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165637  normal  0.471383 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3435  recombination protein RecR  65.61 
 
 		 201 aa  263  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0437  DNA replication and repair protein RecR  67.34 
 
 		 201 aa  263  1e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.792606  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4573  recombination protein RecR  62.05 
 
 		 200 aa  241  7e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0250  recombination protein RecR  60 
 
 		 198 aa  239  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0712  recombination protein RecR  60.62 
 
 		 199 aa  234  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2367  recombination protein RecR  60.62 
 
 		 199 aa  234  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.424518  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4043  recombination protein RecR  57.73 
 
 		 198 aa  233  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0519  recombination protein RecR  59.59 
 
 		 199 aa  230  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217217  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2895  recombination protein RecR  58.76 
 
 		 198 aa  229  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0164  recombination protein RecR  61.05 
 
 		 199 aa  229  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3471  RecR protein  60.53 
 
 		 197 aa  225  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177625  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0648  recombination protein RecR  56.28 
 
 		 199 aa  223  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0126117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3878  recombination protein RecR  58.03 
 
 		 199 aa  223  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.114118 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3647  recombination protein RecR  56.92 
 
 		 199 aa  211  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.664913  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0843  recombination protein RecR  46.84 
 
 		 195 aa  202  2e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1180  recombination protein RecR  44.79 
 
 		 201 aa  202  3e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0245  recombination protein RecR  45.26 
 
 		 195 aa  202  3e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0727285  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1998  recombination protein RecR  57.61 
 
 		 196 aa  201  6e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2911  recombination protein RecR  56.7 
 
 		 197 aa  199  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0675697 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0899  recombination protein RecR  48.44 
 
 		 196 aa  199  3e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213296  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  42.71 
 
 		 199 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  39.68 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  43.39 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  41.45 
 
 		 198 aa  167  9e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  41.45 
 
 		 198 aa  167  9e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  42.93 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  41.45 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2791  recombination protein RecR  43.3 
 
 		 201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0094882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1172  recombination protein RecR  42.93 
 
 		 205 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000693632  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3776  recombination protein RecR  45.13 
 
 		 198 aa  165  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0326868  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0386  recombination protein RecR  42.71 
 
 		 198 aa  165  4e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.147094  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1728  recombination protein RecR  43.46 
 
 		 195 aa  165  5e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000187366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  43.3 
 
 		 200 aa  165  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  42.33 
 
 		 204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  43.46 
 
 		 197 aa  164  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  43.46 
 
 		 197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  42.33 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2532  recombination protein RecR  42.78 
 
 		 197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.200135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0510  DNA replication and repair protein RecR  46.56 
 
 		 199 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.186911  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  43.39 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  41.67 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  46.03 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  41.59 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6868  recombination protein RecR  39.59 
 
 		 201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.296067 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3693  recombination protein RecR  44.62 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  44.92 
 
 		 198 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12031  recombination protein RecR  41.15 
 
 		 199 aa  161  6e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  43.75 
 
 		 199 aa  161  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1460  recombination protein RecR  43.3 
 
 		 203 aa  160  9e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0193  recombination protein RecR  44.21 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.54722e-32 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  42.49 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11881  recombination protein RecR  41.05 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0773  recombination protein RecR  43.01 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0667  recombination protein RecR  43.01 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0210  recombination protein RecR  44.21 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00238733  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12041  recombination protein RecR  41.58 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  42.49 
 
 		 198 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  42.33 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1611  recombination protein RecR  43.98 
 
 		 200 aa  159  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315975  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  42.33 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  42.49 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0800  recombination protein RecR  44.27 
 
 		 197 aa  159  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.924037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0792  recombination protein RecR  37.5 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  40.21 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  39.68 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  39.8 
 
 		 200 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  43.01 
 
 		 189 aa  158  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  39.58 
 
 		 198 aa  158  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  41.27 
 
 		 199 aa  158  5e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  41.67 
 
 		 199 aa  158  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1108  recombination protein RecR  41.05 
 
 		 199 aa  158  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425444  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0766  recombination protein RecR  40 
 
 		 198 aa  157  7e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.290455  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3635  recombination protein RecR  43.08 
 
 		 198 aa  157  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0682949  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0794  recombination protein RecR  43.75 
 
 		 197 aa  157  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0617027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0103  recombination protein RecR  44.33 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>