More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0899 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0899  recombination protein RecR  100 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213296  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4074  recombination protein RecR  50.26 
 
 		 201 aa  211  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7344  recombination protein RecR  49.47 
 
 		 199 aa  210  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0250  recombination protein RecR  48.7 
 
 		 198 aa  210  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_002978  WD1180  recombination protein RecR  49.48 
 
 		 201 aa  209  3e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0032  recombination protein RecR  51.58 
 
 		 201 aa  208  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0840728  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0032  recombination protein RecR  51.31 
 
 		 232 aa  209  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196759  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0258  recombination protein RecR  49.74 
 
 		 199 aa  208  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0621  recombination protein RecR  48.42 
 
 		 200 aa  207  9e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990483  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4394  recombination protein RecR  49.22 
 
 		 201 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0023  recombination protein RecR  51.05 
 
 		 201 aa  206  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.622257  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2895  recombination protein RecR  48.97 
 
 		 198 aa  204  6e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0367  recombination protein RecR  48.69 
 
 		 201 aa  203  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3471  RecR protein  47.67 
 
 		 197 aa  203  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177625  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0666  recombination protein RecR  47.12 
 
 		 201 aa  203  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.290354 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4043  recombination protein RecR  47.67 
 
 		 198 aa  202  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0464  recombination protein RecR  48.17 
 
 		 200 aa  202  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4750  recombination protein RecR  50 
 
 		 201 aa  201  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3435  recombination protein RecR  51.38 
 
 		 201 aa  201  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0085  recombination protein RecR  47.12 
 
 		 201 aa  201  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  0.0328355 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1594  recombination protein RecR  49.74 
 
 		 201 aa  201  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0164  recombination protein RecR  49.23 
 
 		 199 aa  201  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4091  recombination protein RecR  47.92 
 
 		 201 aa  200  9e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607523  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1920  recombination protein RecR  49.48 
 
 		 201 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.700264  normal  0.039212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1638  recombination protein RecR  49.48 
 
 		 201 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0212504  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0276  recombination protein RecR  47.89 
 
 		 201 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0254  recombination protein RecR  47.64 
 
 		 201 aa  200  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4846  recombination protein RecR  47.12 
 
 		 201 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0519  recombination protein RecR  48.42 
 
 		 199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217217  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0156  recombination protein RecR  50 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3145  recombination protein RecR  48.44 
 
 		 201 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216017  normal  0.38463 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4241  recombination protein RecR  48.44 
 
 		 201 aa  195  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140476 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0648  recombination protein RecR  48.7 
 
 		 199 aa  195  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0126117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0712  recombination protein RecR  47.37 
 
 		 199 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2367  recombination protein RecR  47.37 
 
 		 199 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.424518  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1240  recombination protein RecR  47.37 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3878  recombination protein RecR  45.88 
 
 		 199 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.114118 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0437  DNA replication and repair protein RecR  45.6 
 
 		 201 aa  188  4e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.792606  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0245  recombination protein RecR  44.27 
 
 		 195 aa  187  1e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0727285  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4573  recombination protein RecR  45.03 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1839  recombination protein RecR  48.42 
 
 		 201 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165637  normal  0.471383 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3647  recombination protein RecR  44.79 
 
 		 199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.664913  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6148  recombination protein RecR  44.26 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0843  recombination protein RecR  43.75 
 
 		 195 aa  180  1e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  42.71 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  43.23 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  44.21 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  47.89 
 
 		 200 aa  176  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  42.71 
 
 		 199 aa  175  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  42.63 
 
 		 199 aa  174  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  41.58 
 
 		 199 aa  174  9e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  43.68 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  41.88 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  44.21 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  43.23 
 
 		 204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28430  DNA replication and repair protein RecR  41.67 
 
 		 197 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0254  recombination protein RecR  42.19 
 
 		 197 aa  171  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136191  hitchhiker  0.0016505 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1998  recombination protein RecR  45.95 
 
 		 196 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1460  recombination protein RecR  43.92 
 
 		 203 aa  171  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0479  recombination protein RecR  42.19 
 
 		 199 aa  171  6.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0004265  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  41.05 
 
 		 199 aa  171  6.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  46.37 
 
 		 200 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  43.68 
 
 		 199 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  42.71 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  43.81 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0605  recombination protein RecR  41.67 
 
 		 198 aa  167  7e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.813504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0215  recombination protein RecR  41.67 
 
 		 197 aa  167  8e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  41.67 
 
 		 202 aa  167  8e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  40.62 
 
 		 198 aa  167  9e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  39.58 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3124  recombination protein RecR  42.63 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0192329  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0531  recombination protein RecR  42.19 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0553702  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  40 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0673  recombination protein RecR  40.21 
 
 		 202 aa  165  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  40.62 
 
 		 199 aa  164  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  42.08 
 
 		 199 aa  164  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  42.93 
 
 		 199 aa  164  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1312  recombination protein RecR  43.16 
 
 		 199 aa  164  8e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000599572  normal  0.10008 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1856  recombination protein RecR  40.72 
 
 		 199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  39.47 
 
 		 199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0773  recombination protein RecR  44.56 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  40.21 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0510  DNA replication and repair protein RecR  40.62 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.186911  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36550  recombination protein RecR  40.93 
 
 		 198 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0667  recombination protein RecR  44.56 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  41.24 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2911  recombination protein RecR  42.41 
 
 		 197 aa  162  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0675697 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  39.69 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  42.19 
 
 		 199 aa  161  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  38.54 
 
 		 199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  38.54 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1525  recombination protein RecR  42.11 
 
 		 199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.3253  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0557  recombination protein RecR  39.47 
 
 		 204 aa  161  6e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1853  recombination protein RecR  40.72 
 
 		 196 aa  161  7e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.38333 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0203  recombination protein RecR  41.45 
 
 		 197 aa  161  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1075  recombination protein RecR  41.05 
 
 		 197 aa  160  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  39.69 
 
 		 198 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  39.69 
 
 		 198 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  39.69 
 
 		 198 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  39.69 
 
 		 198 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>