More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2367 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2367  recombination protein RecR  100 
 
 		 199 aa  391  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.424518  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0712  recombination protein RecR  100 
 
 		 199 aa  391  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0519  recombination protein RecR  94.97 
 
 		 199 aa  374  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217217  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3878  recombination protein RecR  75.38 
 
 		 199 aa  303  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.114118 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0648  recombination protein RecR  73.37 
 
 		 199 aa  300  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0126117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0164  recombination protein RecR  71.86 
 
 		 199 aa  290  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3647  recombination protein RecR  70.85 
 
 		 199 aa  277  9e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.664913  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1638  recombination protein RecR  62.69 
 
 		 201 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0212504  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1920  recombination protein RecR  62.69 
 
 		 201 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.700264  normal  0.039212 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0258  recombination protein RecR  60.8 
 
 		 199 aa  244  8e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3471  RecR protein  65.1 
 
 		 197 aa  241  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177625  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0276  recombination protein RecR  62.69 
 
 		 201 aa  239  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0621  recombination protein RecR  60.5 
 
 		 200 aa  239  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990483  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1594  recombination protein RecR  61.66 
 
 		 201 aa  239  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0032  recombination protein RecR  63.68 
 
 		 232 aa  238  5e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196759  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7344  recombination protein RecR  60.8 
 
 		 199 aa  237  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1240  recombination protein RecR  59.07 
 
 		 201 aa  237  9e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4573  recombination protein RecR  60.71 
 
 		 200 aa  236  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4091  recombination protein RecR  60.1 
 
 		 201 aa  236  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607523  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0032  recombination protein RecR  63.16 
 
 		 201 aa  235  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0840728  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0023  recombination protein RecR  63.16 
 
 		 201 aa  234  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.622257  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3145  recombination protein RecR  60.62 
 
 		 201 aa  234  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216017  normal  0.38463 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0085  recombination protein RecR  60.1 
 
 		 201 aa  234  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  0.0328355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4750  recombination protein RecR  61.66 
 
 		 201 aa  234  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0437  DNA replication and repair protein RecR  62.56 
 
 		 201 aa  232  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.792606  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0666  recombination protein RecR  58.29 
 
 		 201 aa  231  5e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.290354 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4846  recombination protein RecR  60.1 
 
 		 201 aa  231  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0156  recombination protein RecR  60 
 
 		 201 aa  229  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0367  recombination protein RecR  60.62 
 
 		 201 aa  229  3e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4074  recombination protein RecR  57.37 
 
 		 201 aa  228  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0254  recombination protein RecR  60.1 
 
 		 201 aa  227  7e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4241  recombination protein RecR  58.55 
 
 		 201 aa  227  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140476 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4394  recombination protein RecR  57.89 
 
 		 201 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0464  recombination protein RecR  58 
 
 		 200 aa  224  6e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4043  recombination protein RecR  59.16 
 
 		 198 aa  220  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2895  recombination protein RecR  57.73 
 
 		 198 aa  218  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0250  recombination protein RecR  57.59 
 
 		 198 aa  218  5e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3435  recombination protein RecR  58.56 
 
 		 201 aa  216  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1839  recombination protein RecR  62.18 
 
 		 201 aa  216  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165637  normal  0.471383 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2911  recombination protein RecR  59.16 
 
 		 197 aa  200  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0675697 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0245  recombination protein RecR  44.74 
 
 		 195 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0727285  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0843  recombination protein RecR  44.74 
 
 		 195 aa  195  3e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0899  recombination protein RecR  47.37 
 
 		 196 aa  194  6e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213296  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1180  recombination protein RecR  44.04 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2791  recombination protein RecR  46.67 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0094882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  40 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1998  recombination protein RecR  54.4 
 
 		 196 aa  177  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  44.67 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  44.27 
 
 		 199 aa  174  8e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0792  recombination protein RecR  39.2 
 
 		 201 aa  174  8e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  44.27 
 
 		 199 aa  173  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0510  DNA replication and repair protein RecR  48.22 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.186911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  40 
 
 		 198 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  44.27 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  43.75 
 
 		 199 aa  172  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0605  recombination protein RecR  43.15 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.813504 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  43.75 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  43.65 
 
 		 198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  44.79 
 
 		 199 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  43.4 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  44.27 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  38.19 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  39.58 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  42.71 
 
 		 199 aa  170  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1921  recombination protein RecR  45.69 
 
 		 199 aa  170  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1593  recombination protein RecR  45.69 
 
 		 199 aa  170  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.198008  normal  0.0655144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  43.23 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  43.15 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  42.21 
 
 		 200 aa  168  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0376  recombination protein RecR  42.13 
 
 		 199 aa  168  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000959909  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  40.1 
 
 		 198 aa  168  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  40.1 
 
 		 198 aa  168  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1611  recombination protein RecR  44.21 
 
 		 200 aa  168  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315975  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3124  recombination protein RecR  43.81 
 
 		 199 aa  168  5e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0192329  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3776  recombination protein RecR  46.35 
 
 		 198 aa  168  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0326868  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3693  recombination protein RecR  46.35 
 
 		 198 aa  167  6e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  43.23 
 
 		 200 aa  167  8e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  44.79 
 
 		 199 aa  167  9e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  39.58 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12041  recombination protein RecR  42.71 
 
 		 199 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  42.19 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12031  recombination protein RecR  42.71 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  46.11 
 
 		 198 aa  166  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  39.2 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3635  recombination protein RecR  45.31 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0682949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  43.23 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  38.34 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  42.63 
 
 		 203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  38.86 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  38.86 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  38.86 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  38.86 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  38.86 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  43.75 
 
 		 202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11881  recombination protein RecR  41.33 
 
 		 199 aa  165  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1130  recombination protein RecR  42.72 
 
 		 206 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  38.86 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  38.86 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2804  recombination protein RecR  42.49 
 
 		 197 aa  165  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1108  recombination protein RecR  42.19 
 
 		 199 aa  165  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>