More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4573 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4573  recombination protein RecR  100 
 
 		 200 aa  388  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0258  recombination protein RecR  68.53 
 
 		 199 aa  281  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0437  DNA replication and repair protein RecR  67.18 
 
 		 201 aa  255  3e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.792606  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3471  RecR protein  65.31 
 
 		 197 aa  246  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177625  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1240  recombination protein RecR  59.07 
 
 		 201 aa  244  4.9999999999999997e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4091  recombination protein RecR  62.18 
 
 		 201 aa  244  9e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607523  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0023  recombination protein RecR  62.18 
 
 		 201 aa  243  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.622257  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1594  recombination protein RecR  61.54 
 
 		 201 aa  241  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3145  recombination protein RecR  62.05 
 
 		 201 aa  241  7e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216017  normal  0.38463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1638  recombination protein RecR  61.54 
 
 		 201 aa  240  9e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0212504  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1920  recombination protein RecR  61.54 
 
 		 201 aa  240  9e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.700264  normal  0.039212 
 
 
-
 
NC_004310  BR0032  recombination protein RecR  61.66 
 
 		 201 aa  240  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0840728  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4846  recombination protein RecR  59.69 
 
 		 201 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0621  recombination protein RecR  59.39 
 
 		 200 aa  238  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990483  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4241  recombination protein RecR  61.03 
 
 		 201 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4750  recombination protein RecR  61.03 
 
 		 201 aa  238  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0254  recombination protein RecR  61.22 
 
 		 201 aa  237  9e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0032  recombination protein RecR  61.14 
 
 		 232 aa  236  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196759  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0156  recombination protein RecR  59.38 
 
 		 201 aa  236  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0712  recombination protein RecR  60.71 
 
 		 199 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7344  recombination protein RecR  58.46 
 
 		 199 aa  236  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2367  recombination protein RecR  60.71 
 
 		 199 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.424518  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0276  recombination protein RecR  60.94 
 
 		 201 aa  236  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0519  recombination protein RecR  60.71 
 
 		 199 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217217  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4043  recombination protein RecR  60 
 
 		 198 aa  235  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0085  recombination protein RecR  59.49 
 
 		 201 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  0.0328355 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0464  recombination protein RecR  56.28 
 
 		 200 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0367  recombination protein RecR  58.46 
 
 		 201 aa  232  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4074  recombination protein RecR  57.81 
 
 		 201 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0666  recombination protein RecR  58.46 
 
 		 201 aa  232  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.290354 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0164  recombination protein RecR  60.61 
 
 		 199 aa  232  3e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4394  recombination protein RecR  58.33 
 
 		 201 aa  231  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3878  recombination protein RecR  58.67 
 
 		 199 aa  231  6e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.114118 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0250  recombination protein RecR  58.85 
 
 		 198 aa  231  7.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2895  recombination protein RecR  58.97 
 
 		 198 aa  229  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1839  recombination protein RecR  61.54 
 
 		 201 aa  224  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165637  normal  0.471383 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3647  recombination protein RecR  58.16 
 
 		 199 aa  223  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.664913  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0648  recombination protein RecR  59.69 
 
 		 199 aa  223  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0126117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3435  recombination protein RecR  57.38 
 
 		 201 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1998  recombination protein RecR  60.87 
 
 		 196 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2911  recombination protein RecR  62.05 
 
 		 197 aa  209  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0675697 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0843  recombination protein RecR  45.26 
 
 		 195 aa  201  7e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0245  recombination protein RecR  44.21 
 
 		 195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0727285  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1180  recombination protein RecR  43.46 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0899  recombination protein RecR  45.03 
 
 		 196 aa  186  3e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213296  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  44.74 
 
 		 200 aa  181  8.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  46.84 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  44.21 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  45.74 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  47.15 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  41.97 
 
 		 198 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  49.47 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  44.21 
 
 		 199 aa  175  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  46.84 
 
 		 199 aa  175  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  42.93 
 
 		 199 aa  175  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  44.16 
 
 		 200 aa  175  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  42.11 
 
 		 199 aa  175  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  45.79 
 
 		 199 aa  174  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  40.93 
 
 		 198 aa  174  9e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0096  recombination protein RecR  49.74 
 
 		 197 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  42.42 
 
 		 199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000716421  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  42.19 
 
 		 198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1973  recombination protein RecR  43.94 
 
 		 199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  42.19 
 
 		 198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  45.79 
 
 		 199 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  41.97 
 
 		 198 aa  171  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  42.49 
 
 		 198 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  42.49 
 
 		 198 aa  171  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  42.49 
 
 		 198 aa  171  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  42.49 
 
 		 198 aa  171  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  42.49 
 
 		 198 aa  171  9e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  42.49 
 
 		 198 aa  171  9e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  42.49 
 
 		 198 aa  171  9e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  43.23 
 
 		 199 aa  171  9e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  42.49 
 
 		 198 aa  171  9e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  41.67 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0376  recombination protein RecR  42.71 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000959909  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0876  recombination protein RecR  43.59 
 
 		 205 aa  170  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236208  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  43.75 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  45.79 
 
 		 199 aa  170  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0052  recombination protein RecR  45.99 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011836  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  45.31 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  42.49 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28430  DNA replication and repair protein RecR  43.68 
 
 		 197 aa  169  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  43.68 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  42.49 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12041  recombination protein RecR  41.8 
 
 		 199 aa  168  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3635  recombination protein RecR  47.37 
 
 		 198 aa  168  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0682949  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6148  recombination protein RecR  43.85 
 
 		 199 aa  168  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1189  recombination protein RecR  43.3 
 
 		 204 aa  168  5e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00843682  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  44.04 
 
 		 203 aa  168  6e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  43.88 
 
 		 200 aa  167  7e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1108  recombination protein RecR  41.27 
 
 		 199 aa  167  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425444  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  44.74 
 
 		 199 aa  167  8e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0367  recombination protein RecR  45.03 
 
 		 197 aa  166  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000104569  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12031  recombination protein RecR  40.61 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  44.21 
 
 		 202 aa  166  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3693  recombination protein RecR  47.37 
 
 		 198 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0094  recombination protein RecR  43.16 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.427132  hitchhiker  0.00000395528 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3776  recombination protein RecR  47.37 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0326868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>