More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_1240 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_1240  recombination protein RecR  100 
 
 
201 aa  402  1e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0032  recombination protein RecR  78.61 
 
 
201 aa  332  3e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0840728  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0032  recombination protein RecR  78.11 
 
 
232 aa  328  3e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196759  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0023  recombination protein RecR  78.11 
 
 
201 aa  328  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.622257  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4091  recombination protein RecR  72.14 
 
 
201 aa  317  6e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607523  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4074  recombination protein RecR  74.37 
 
 
201 aa  308  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4394  recombination protein RecR  73.87 
 
 
201 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0156  recombination protein RecR  72.36 
 
 
201 aa  303  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0254  recombination protein RecR  69.15 
 
 
201 aa  290  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0276  recombination protein RecR  68.66 
 
 
201 aa  289  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3435  recombination protein RecR  70.9 
 
 
201 aa  287  7e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4846  recombination protein RecR  65.17 
 
 
201 aa  287  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0085  recombination protein RecR  65.67 
 
 
201 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  0.0328355 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0666  recombination protein RecR  65.67 
 
 
201 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.290354 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7344  recombination protein RecR  65.99 
 
 
199 aa  285  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0621  recombination protein RecR  66.15 
 
 
200 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990483  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3145  recombination protein RecR  64.18 
 
 
201 aa  281  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216017  normal  0.38463 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0367  recombination protein RecR  65.67 
 
 
201 aa  280  7.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0464  recombination protein RecR  65.48 
 
 
200 aa  278  3e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4750  recombination protein RecR  63.68 
 
 
201 aa  275  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0258  recombination protein RecR  64.97 
 
 
199 aa  273  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1638  recombination protein RecR  62.69 
 
 
201 aa  271  6e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0212504  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1920  recombination protein RecR  62.69 
 
 
201 aa  271  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.700264  normal  0.039212 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1594  recombination protein RecR  63.68 
 
 
201 aa  270  9e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4241  recombination protein RecR  62.19 
 
 
201 aa  264  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140476 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1839  recombination protein RecR  64.18 
 
 
201 aa  259  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165637  normal  0.471383 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0437  DNA replication and repair protein RecR  61.31 
 
 
201 aa  252  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.792606  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4043  recombination protein RecR  60.82 
 
 
198 aa  247  7e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4573  recombination protein RecR  59.07 
 
 
200 aa  244  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3471  RecR protein  60.82 
 
 
197 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177625  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0250  recombination protein RecR  57.89 
 
 
198 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0519  recombination protein RecR  59.59 
 
 
199 aa  238  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217217  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0712  recombination protein RecR  59.07 
 
 
199 aa  237  9e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2367  recombination protein RecR  59.07 
 
 
199 aa  237  9e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.424518  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0164  recombination protein RecR  59.07 
 
 
199 aa  237  9e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0648  recombination protein RecR  58.55 
 
 
199 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0126117  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2895  recombination protein RecR  57.73 
 
 
198 aa  233  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3878  recombination protein RecR  56.63 
 
 
199 aa  228  4e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.114118 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3647  recombination protein RecR  54.87 
 
 
199 aa  219  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.664913  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_002978  WD1180  recombination protein RecR  50 
 
 
201 aa  219  1.9999999999999999e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2911  recombination protein RecR  57.73 
 
 
197 aa  216  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0675697 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0245  recombination protein RecR  48.42 
 
 
195 aa  209  3e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0727285  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0843  recombination protein RecR  47.37 
 
 
195 aa  207  7e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1998  recombination protein RecR  51.08 
 
 
196 aa  192  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0899  recombination protein RecR  47.37 
 
 
196 aa  189  2e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213296  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1611  recombination protein RecR  48.17 
 
 
200 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315975  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  44.79 
 
 
200 aa  185  4e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  47.64 
 
 
197 aa  185  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  47.15 
 
 
200 aa  185  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  46.07 
 
 
199 aa  184  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  47.12 
 
 
197 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1853  recombination protein RecR  46.11 
 
 
196 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.38333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  44.97 
 
 
199 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  42.19 
 
 
199 aa  181  6e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  47.62 
 
 
198 aa  180  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  44.79 
 
 
199 aa  180  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3693  recombination protein RecR  46.35 
 
 
198 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  44.97 
 
 
204 aa  179  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2532  recombination protein RecR  45.36 
 
 
197 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.200135  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3776  recombination protein RecR  46.35 
 
 
198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0326868  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2791  recombination protein RecR  43.81 
 
 
201 aa  178  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0094882  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  45.31 
 
 
199 aa  178  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  45.5 
 
 
189 aa  178  5.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  44.62 
 
 
198 aa  177  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  44.62 
 
 
198 aa  177  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3635  recombination protein RecR  45.83 
 
 
198 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0682949  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  48.15 
 
 
198 aa  177  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0894  recombination protein RecR  42.86 
 
 
205 aa  176  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0794  recombination protein RecR  45.64 
 
 
197 aa  176  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0617027  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  44.97 
 
 
199 aa  176  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2253  recombination protein RecR  45.6 
 
 
185 aa  176  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00314078  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0800  recombination protein RecR  45.64 
 
 
197 aa  176  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.924037  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  43.94 
 
 
199 aa  176  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  44.04 
 
 
198 aa  175  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  43.59 
 
 
198 aa  175  4e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  44.44 
 
 
199 aa  175  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1460  recombination protein RecR  43.81 
 
 
203 aa  175  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1728  recombination protein RecR  45.03 
 
 
195 aa  174  5e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000187366  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4182  recombination protein RecR  42.86 
 
 
205 aa  174  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  43.46 
 
 
199 aa  174  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  43.46 
 
 
199 aa  174  7e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  43.39 
 
 
199 aa  174  9e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3760  recombination protein RecR  46.35 
 
 
198 aa  174  9e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.110635  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0667  recombination protein RecR  46.11 
 
 
201 aa  173  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  44.27 
 
 
198 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  44.27 
 
 
198 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0773  recombination protein RecR  46.11 
 
 
201 aa  173  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28430  DNA replication and repair protein RecR  43.46 
 
 
197 aa  173  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1045  recombination protein RecR  44.62 
 
 
205 aa  174  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.414763  normal  0.641702 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  42.93 
 
 
199 aa  173  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  43.75 
 
 
199 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2595  RecR protein  43.65 
 
 
199 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00242938  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  41.9 
 
 
215 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0376  recombination protein RecR  41.36 
 
 
199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000959909  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0673  recombination protein RecR  44.1 
 
 
202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36550  recombination protein RecR  44.21 
 
 
198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2171  recombination protein RecR  42.71 
 
 
206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0386  recombination protein RecR  42.19 
 
 
198 aa  171  5.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.147094  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  41.8 
 
 
199 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0268  recombination protein RecR  42.33 
 
 
199 aa  171  9e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>