More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1045 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1045  recombination protein RecR  100 
 
 		 205 aa  416  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.414763  normal  0.641702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1600  recombination protein RecR  63.05 
 
 		 203 aa  281  5.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.351131 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2905  recombination protein RecR  60.78 
 
 		 204 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3028  recombination protein RecR  63.18 
 
 		 205 aa  271  6e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0894  recombination protein RecR  58.91 
 
 		 205 aa  254  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2171  recombination protein RecR  62.19 
 
 		 206 aa  252  3e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07580  recombination protein RecR  58.91 
 
 		 205 aa  247  7e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0362  recombination protein RecR  59.7 
 
 		 206 aa  247  8e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0625  recombination protein RecR  58.5 
 
 		 200 aa  244  4.9999999999999997e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1255  recombination protein RecR  54.55 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  45.28 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0883  recombination protein RecR  43.56 
 
 		 204 aa  192  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254341  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1175  recombination protein RecR  45.32 
 
 		 204 aa  192  3e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000261474  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1189  recombination protein RecR  44.83 
 
 		 204 aa  191  5e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00843682  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4182  recombination protein RecR  46.81 
 
 		 205 aa  191  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  48.37 
 
 		 197 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  47.28 
 
 		 199 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  48.37 
 
 		 197 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10891  RecR protein  47.28 
 
 		 182 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.683026  normal  0.323303 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  43.46 
 
 		 199 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0876  recombination protein RecR  43.84 
 
 		 205 aa  187  9e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236208  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0048  recombination protein RecR  43.65 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  43.16 
 
 		 204 aa  185  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1416  recombination protein RecR  46.2 
 
 		 182 aa  186  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.48434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  44.16 
 
 		 199 aa  185  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  42.39 
 
 		 198 aa  185  5e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  43.28 
 
 		 199 aa  185  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11881  recombination protein RecR  45.96 
 
 		 199 aa  185  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  46.84 
 
 		 199 aa  184  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0052  recombination protein RecR  43.15 
 
 		 198 aa  185  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011836  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  45.65 
 
 		 189 aa  184  6e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1172  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 205 aa  184  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000693632  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  43.5 
 
 		 198 aa  184  8e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  43.5 
 
 		 198 aa  184  8e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09731  recombination protein RecR  48.37 
 
 		 189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12031  recombination protein RecR  45.36 
 
 		 199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12041  recombination protein RecR  45.36 
 
 		 199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  44.28 
 
 		 198 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2253  recombination protein RecR  46.45 
 
 		 185 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00314078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  44.28 
 
 		 198 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1284  recombination protein RecR  42.08 
 
 		 204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.722454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1399  recombination protein RecR  46.2 
 
 		 192 aa  182  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.612922  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  44.21 
 
 		 200 aa  182  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1180  recombination protein RecR  43.14 
 
 		 204 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000222469  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  43.78 
 
 		 198 aa  182  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1108  recombination protein RecR  45.36 
 
 		 199 aa  182  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  41.33 
 
 		 199 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  40.84 
 
 		 199 aa  182  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  40.82 
 
 		 199 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  41.84 
 
 		 199 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  42.13 
 
 		 199 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  41.88 
 
 		 199 aa  181  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14831  RecR protein  47.78 
 
 		 182 aa  181  6e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.409588 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13747  recombination protein RecR  41.12 
 
 		 203 aa  181  7e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.24685  normal  0.507184 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0651  DNA replication and repair protein RecR  47.78 
 
 		 182 aa  181  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121722  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36550  recombination protein RecR  40.62 
 
 		 198 aa  180  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  44 
 
 		 198 aa  180  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  44 
 
 		 198 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  44 
 
 		 198 aa  180  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  44 
 
 		 198 aa  180  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  41.58 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  44 
 
 		 198 aa  180  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  44 
 
 		 198 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  44 
 
 		 198 aa  180  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  44 
 
 		 198 aa  180  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  44 
 
 		 198 aa  180  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  39.9 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  43.32 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  42.78 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  40.21 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0605  recombination protein RecR  42.39 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.813504 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  41.62 
 
 		 199 aa  178  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000716421  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1639  DNA replication and repair protein RecR  44.56 
 
 		 219 aa  178  4.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1365  recombination protein RecR  42.29 
 
 		 200 aa  178  4.999999999999999e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  40.53 
 
 		 199 aa  178  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  40 
 
 		 199 aa  177  8e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  43.5 
 
 		 198 aa  177  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  43.5 
 
 		 198 aa  177  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3635  recombination protein RecR  43.01 
 
 		 198 aa  177  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0682949  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  39.06 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  39.9 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1369  recombination protein RecR  45.11 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0268  recombination protein RecR  39.79 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0414  recombination protein RecR  43.88 
 
 		 195 aa  177  1e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6566  recombination protein RecR  39.9 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00960042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0127  recombination protein RecR  42.08 
 
 		 202 aa  176  2e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  38.86 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  39.47 
 
 		 199 aa  175  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3760  recombination protein RecR  43.55 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3776  recombination protein RecR  42.47 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0326868  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0673  recombination protein RecR  41.88 
 
 		 202 aa  175  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1513  recombination protein RecR  42.64 
 
 		 222 aa  175  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0279848  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2791  recombination protein RecR  42.56 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0094882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  42.5 
 
 		 198 aa  175  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2272  recombination protein RecR  43.15 
 
 		 199 aa  174  6e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3693  recombination protein RecR  42.47 
 
 		 198 aa  174  6e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1549  recombination protein RecR  44.79 
 
 		 195 aa  174  7e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00118167  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  39.27 
 
 		 199 aa  174  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1144  recombination protein RecR  40.82 
 
 		 201 aa  174  7e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0987935  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  43 
 
 		 198 aa  174  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>