More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3028 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3028  recombination protein RecR  100 
 
 		 205 aa  422  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0894  recombination protein RecR  62.44 
 
 		 205 aa  273  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1045  recombination protein RecR  63.18 
 
 		 205 aa  271  6e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.414763  normal  0.641702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1600  recombination protein RecR  60.89 
 
 		 203 aa  270  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.351131 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2905  recombination protein RecR  60.59 
 
 		 204 aa  261  6e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0362  recombination protein RecR  60.1 
 
 		 206 aa  261  6e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2171  recombination protein RecR  58.13 
 
 		 206 aa  256  2e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07580  recombination protein RecR  57.14 
 
 		 205 aa  247  8e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0625  recombination protein RecR  55.78 
 
 		 200 aa  240  1e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1255  recombination protein RecR  58.21 
 
 		 207 aa  232  3e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  45.07 
 
 		 215 aa  197  7e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0883  recombination protein RecR  46.27 
 
 		 204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254341  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1399  recombination protein RecR  48.13 
 
 		 192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.612922  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  47.45 
 
 		 198 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  47.45 
 
 		 198 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1639  DNA replication and repair protein RecR  47.42 
 
 		 219 aa  193  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0876  recombination protein RecR  46.04 
 
 		 205 aa  194  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236208  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  49.73 
 
 		 197 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  49.73 
 
 		 197 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  48.65 
 
 		 199 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09731  recombination protein RecR  48.15 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  44.9 
 
 		 199 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  45.41 
 
 		 198 aa  188  5e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4182  recombination protein RecR  45.92 
 
 		 205 aa  188  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  44.86 
 
 		 198 aa  187  5.999999999999999e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  44.86 
 
 		 198 aa  187  5.999999999999999e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  43.68 
 
 		 200 aa  187  7e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  46.77 
 
 		 199 aa  187  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10891  RecR protein  49.16 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.683026  normal  0.323303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2253  recombination protein RecR  50.55 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00314078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1189  recombination protein RecR  44.28 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00843682  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1175  recombination protein RecR  45.77 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000261474  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  43.16 
 
 		 199 aa  185  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1284  recombination protein RecR  44.78 
 
 		 204 aa  185  4e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.722454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  45.41 
 
 		 199 aa  185  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  45.92 
 
 		 199 aa  184  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1180  recombination protein RecR  44.78 
 
 		 204 aa  184  8e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000222469  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1719  recombination protein RecR  45.03 
 
 		 194 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  42.63 
 
 		 199 aa  182  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 199 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000716421  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  47.03 
 
 		 189 aa  182  4.0000000000000006e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  43.37 
 
 		 198 aa  181  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  43.16 
 
 		 199 aa  181  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  43.39 
 
 		 204 aa  180  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0766  recombination protein RecR  45.95 
 
 		 198 aa  180  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.290455  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1369  recombination protein RecR  47.92 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0663  recombination protein RecR  45.41 
 
 		 198 aa  181  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0143934  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1172  recombination protein RecR  42.08 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000693632  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0673  recombination protein RecR  44.21 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  41.58 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14831  RecR protein  47.49 
 
 		 182 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.409588 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  44.9 
 
 		 200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  42.33 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  41.58 
 
 		 199 aa  178  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0048  recombination protein RecR  41.62 
 
 		 198 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 199 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  41.88 
 
 		 203 aa  177  7e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0651  DNA replication and repair protein RecR  47.49 
 
 		 182 aa  177  7e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121722  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28430  DNA replication and repair protein RecR  41.05 
 
 		 197 aa  177  7e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0052  recombination protein RecR  43.88 
 
 		 198 aa  177  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011836  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  41.45 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  43.88 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11881  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1288  recombination protein RecR  44.85 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  40.74 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1416  recombination protein RecR  47.49 
 
 		 182 aa  176  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.48434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0386  recombination protein RecR  41.94 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.147094  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  39.18 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  43.24 
 
 		 198 aa  175  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0605  recombination protein RecR  40.31 
 
 		 198 aa  175  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.813504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  42.11 
 
 		 199 aa  175  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  43.24 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  43.24 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4992  recombination protein RecR  43.81 
 
 		 203 aa  175  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  43.24 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  43.24 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0094  recombination protein RecR  45.31 
 
 		 199 aa  175  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.427132  hitchhiker  0.00000395528 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5271  recombination protein RecR  43.81 
 
 		 203 aa  175  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  43.24 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  43.24 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  43.24 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4903  recombination protein RecR  43.81 
 
 		 203 aa  175  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149021  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0540  recombination protein RecR  44.97 
 
 		 199 aa  175  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000530295  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  42.11 
 
 		 199 aa  175  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36550  recombination protein RecR  41.36 
 
 		 198 aa  174  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  42.78 
 
 		 199 aa  174  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3924  recombination protein RecR  42.7 
 
 		 204 aa  174  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00096202  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  42.33 
 
 		 199 aa  174  6e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  43.78 
 
 		 198 aa  174  7e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  43.24 
 
 		 198 aa  174  8e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0254  recombination protein RecR  40.21 
 
 		 197 aa  174  8e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136191  hitchhiker  0.0016505 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  43.24 
 
 		 198 aa  174  9e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  43.24 
 
 		 198 aa  174  9e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0127  recombination protein RecR  42.7 
 
 		 202 aa  174  9e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0792  recombination protein RecR  40.82 
 
 		 201 aa  174  9e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6566  recombination protein RecR  40 
 
 		 199 aa  173  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00960042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0479  recombination protein RecR  40.74 
 
 		 199 aa  173  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0004265  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5527  recombination protein RecR  43.81 
 
 		 203 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 198 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0215  recombination protein RecR  40.74 
 
 		 197 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>