More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07580 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_07580  recombination protein RecR  100 
 
 		 205 aa  424  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0362  recombination protein RecR  73.66 
 
 		 206 aa  319  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2171  recombination protein RecR  67.8 
 
 		 206 aa  302  2.0000000000000002e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1255  recombination protein RecR  59.9 
 
 		 207 aa  254  6e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1600  recombination protein RecR  57.64 
 
 		 203 aa  252  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.351131 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2905  recombination protein RecR  55.88 
 
 		 204 aa  248  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0894  recombination protein RecR  57.84 
 
 		 205 aa  249  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1045  recombination protein RecR  58.91 
 
 		 205 aa  247  7e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.414763  normal  0.641702 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3028  recombination protein RecR  57.14 
 
 		 205 aa  247  8e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303727 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0625  recombination protein RecR  58.29 
 
 		 200 aa  245  4e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  48.68 
 
 		 199 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  47.62 
 
 		 197 aa  194  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  47.62 
 
 		 197 aa  194  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2253  recombination protein RecR  49.45 
 
 		 185 aa  194  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00314078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1399  recombination protein RecR  45.08 
 
 		 192 aa  192  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.612922  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4182  recombination protein RecR  43.88 
 
 		 205 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09731  recombination protein RecR  47.57 
 
 		 189 aa  191  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  41.78 
 
 		 215 aa  191  7e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10891  RecR protein  49.16 
 
 		 182 aa  190  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.683026  normal  0.323303 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  46.49 
 
 		 189 aa  189  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  44.97 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  44.97 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1639  DNA replication and repair protein RecR  45.88 
 
 		 219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  45.5 
 
 		 198 aa  188  4e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 199 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 199 aa  187  7e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  45.83 
 
 		 199 aa  187  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1416  recombination protein RecR  46.45 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.48434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14831  RecR protein  46.93 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.409588 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  43.39 
 
 		 199 aa  186  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  41.92 
 
 		 199 aa  185  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  44.44 
 
 		 199 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0651  DNA replication and repair protein RecR  46.37 
 
 		 182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121722  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  42.33 
 
 		 199 aa  182  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 200 aa  182  3e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1189  recombination protein RecR  44.78 
 
 		 204 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00843682  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  42.16 
 
 		 199 aa  181  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0250  recombination protein RecR  42.27 
 
 		 198 aa  181  7e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 199 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  43.78 
 
 		 204 aa  180  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1284  recombination protein RecR  43.78 
 
 		 204 aa  180  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.722454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0268  recombination protein RecR  42.33 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  41.33 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  41.27 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  42.7 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  43.37 
 
 		 199 aa  180  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1513  recombination protein RecR  44.86 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0279848  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  43.72 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0883  recombination protein RecR  43.78 
 
 		 204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254341  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0048  recombination protein RecR  41.62 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  42.33 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0876  recombination protein RecR  42.08 
 
 		 205 aa  178  4e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236208  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  43.92 
 
 		 198 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  43.37 
 
 		 198 aa  179  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  43.37 
 
 		 198 aa  179  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 199 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6566  recombination protein RecR  42.33 
 
 		 199 aa  178  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00960042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0673  recombination protein RecR  43.68 
 
 		 202 aa  177  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_522  recombination protein  42.55 
 
 		 204 aa  177  9e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0417916  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  41.45 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12041  recombination protein RecR  43.23 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1369  recombination protein RecR  44.27 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1180  recombination protein RecR  43.78 
 
 		 204 aa  177  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000222469  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  41.67 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  42.33 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  42.33 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12031  recombination protein RecR  43.23 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1108  recombination protein RecR  43.23 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425444  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0557  recombination protein RecR  40.82 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0583  recombination protein RecR  41.49 
 
 		 204 aa  175  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0479  recombination protein RecR  41.62 
 
 		 199 aa  176  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0004265  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  40.21 
 
 		 202 aa  176  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  41.08 
 
 		 199 aa  175  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1973  recombination protein RecR  41.03 
 
 		 199 aa  175  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  42.25 
 
 		 199 aa  175  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  39.9 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1172  recombination protein RecR  42.08 
 
 		 205 aa  175  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000693632  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 198 aa  174  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2291  recombination protein RecR  42.16 
 
 		 205 aa  174  8e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.967474  normal  0.0406195 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3635  recombination protein RecR  41.08 
 
 		 198 aa  174  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0682949  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  39.69 
 
 		 198 aa  174  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3760  recombination protein RecR  41.08 
 
 		 198 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0254  recombination protein RecR  41.27 
 
 		 197 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136191  hitchhiker  0.0016505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0215  recombination protein RecR  40.74 
 
 		 197 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3693  recombination protein RecR  41.08 
 
 		 198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3124  recombination protein RecR  41.27 
 
 		 199 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0192329  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  38.27 
 
 		 199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000716421  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3776  recombination protein RecR  41.08 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0326868  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0052  recombination protein RecR  43.43 
 
 		 198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011836  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0127  recombination protein RecR  42.21 
 
 		 202 aa  171  5e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0258  recombination protein RecR  39.2 
 
 		 199 aa  171  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0605  recombination protein RecR  37.56 
 
 		 198 aa  171  5e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.813504 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0792  recombination protein RecR  39.29 
 
 		 201 aa  171  5e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  40.54 
 
 		 199 aa  171  5e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28430  DNA replication and repair protein RecR  40.21 
 
 		 197 aa  171  5.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11881  recombination protein RecR  41.33 
 
 		 199 aa  171  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1728  recombination protein RecR  43.75 
 
 		 195 aa  171  7.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000187366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  41.27 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1175  recombination protein RecR  40.3 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000261474  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0800  recombination protein RecR  41.75 
 
 		 197 aa  169  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.924037  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>