More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2171 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2171  recombination protein RecR  100 
 
 		 206 aa  426  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0362  recombination protein RecR  69.12 
 
 		 206 aa  304  8.000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07580  recombination protein RecR  67.8 
 
 		 205 aa  302  2.0000000000000002e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3028  recombination protein RecR  58.13 
 
 		 205 aa  256  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303727 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1600  recombination protein RecR  57.14 
 
 		 203 aa  255  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.351131 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1045  recombination protein RecR  62.19 
 
 		 205 aa  252  3e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.414763  normal  0.641702 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0625  recombination protein RecR  57.79 
 
 		 200 aa  247  1e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0894  recombination protein RecR  56.37 
 
 		 205 aa  245  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1255  recombination protein RecR  57.92 
 
 		 207 aa  241  3.9999999999999997e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2905  recombination protein RecR  55.88 
 
 		 204 aa  241  3.9999999999999997e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1399  recombination protein RecR  49.21 
 
 		 192 aa  200  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.612922  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1639  DNA replication and repair protein RecR  47.42 
 
 		 219 aa  194  6e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  40.85 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6566  recombination protein RecR  42.11 
 
 		 199 aa  183  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00960042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  45.26 
 
 		 199 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  42.86 
 
 		 204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  42.63 
 
 		 199 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0268  recombination protein RecR  41.58 
 
 		 199 aa  182  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  43.16 
 
 		 199 aa  182  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  43.16 
 
 		 200 aa  181  5.0000000000000004e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09731  recombination protein RecR  47.54 
 
 		 189 aa  181  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  44.79 
 
 		 198 aa  180  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  44.97 
 
 		 199 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  44.79 
 
 		 198 aa  180  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  44.44 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  41.05 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1189  recombination protein RecR  43.28 
 
 		 204 aa  179  4e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00843682  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  42.42 
 
 		 199 aa  178  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  40.72 
 
 		 198 aa  178  4e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 198 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 198 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  41.45 
 
 		 199 aa  178  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0876  recombination protein RecR  43.07 
 
 		 205 aa  177  7e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236208  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4182  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 205 aa  177  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  41.8 
 
 		 199 aa  177  7e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2253  recombination protein RecR  46.15 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00314078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10891  RecR protein  46.37 
 
 		 182 aa  177  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.683026  normal  0.323303 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  44.39 
 
 		 199 aa  177  8e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  41.84 
 
 		 199 aa  177  8e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  40.21 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1513  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 222 aa  176  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0279848  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  44.44 
 
 		 197 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  40.21 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  43.23 
 
 		 198 aa  176  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  44.44 
 
 		 197 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  42.11 
 
 		 199 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0883  recombination protein RecR  42.29 
 
 		 204 aa  175  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254341  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  39.68 
 
 		 199 aa  175  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  40.21 
 
 		 199 aa  175  5e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0048  recombination protein RecR  42.13 
 
 		 198 aa  174  7e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  39.15 
 
 		 202 aa  173  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  42.41 
 
 		 203 aa  174  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  41.33 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  38.95 
 
 		 199 aa  173  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14831  RecR protein  44.69 
 
 		 182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.409588 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  43.24 
 
 		 189 aa  172  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  38.95 
 
 		 199 aa  172  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  40 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  41.33 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000716421  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0479  recombination protein RecR  40.21 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0004265  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1416  recombination protein RecR  44.26 
 
 		 182 aa  172  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.48434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1240  recombination protein RecR  42.71 
 
 		 201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  41.8 
 
 		 200 aa  172  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1728  recombination protein RecR  45.5 
 
 		 195 aa  171  5e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000187366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0605  recombination protein RecR  38.07 
 
 		 198 aa  171  5e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.813504 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0510  DNA replication and repair protein RecR  41.33 
 
 		 199 aa  172  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.186911  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1175  recombination protein RecR  41.29 
 
 		 204 aa  172  5e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000261474  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0651  DNA replication and repair protein RecR  44.69 
 
 		 182 aa  171  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121722  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3124  recombination protein RecR  41.8 
 
 		 199 aa  171  6.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0192329  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0094  recombination protein RecR  42.71 
 
 		 199 aa  171  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.427132  hitchhiker  0.00000395528 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0540  recombination protein RecR  40.74 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000530295  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0215  recombination protein RecR  40.21 
 
 		 197 aa  170  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0254  recombination protein RecR  39.68 
 
 		 197 aa  169  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136191  hitchhiker  0.0016505 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5291  recombination protein RecR  40.87 
 
 		 212 aa  169  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1172  recombination protein RecR  41.09 
 
 		 205 aa  170  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000693632  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0673  recombination protein RecR  41.05 
 
 		 202 aa  169  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  38.78 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2791  recombination protein RecR  38.86 
 
 		 201 aa  169  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0094882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28430  DNA replication and repair protein RecR  38.42 
 
 		 197 aa  168  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12041  recombination protein RecR  42.19 
 
 		 199 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  39.38 
 
 		 198 aa  169  4e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1284  recombination protein RecR  40.3 
 
 		 204 aa  168  4e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.722454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_522  recombination protein  41.62 
 
 		 204 aa  168  5e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0417916  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  40.74 
 
 		 199 aa  168  6e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12031  recombination protein RecR  42.19 
 
 		 199 aa  167  7e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1549  recombination protein RecR  41.67 
 
 		 195 aa  167  9e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00118167  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4329  recombination protein RecR  39.58 
 
 		 197 aa  167  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.63547  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  40.62 
 
 		 198 aa  167  9e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1719  recombination protein RecR  40.31 
 
 		 194 aa  167  9e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36550  recombination protein RecR  36.65 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  39.01 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0794  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 197 aa  167  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0617027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1108  recombination protein RecR  42.19 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425444  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1365  recombination protein RecR  38.27 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  41.67 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3924  recombination protein RecR  43.17 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00096202  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0800  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.924037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0694  recombination protein RecR  44.15 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488211  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  40.7 
 
 		 200 aa  165  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6148  recombination protein RecR  39.68 
 
 		 199 aa  165  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>